MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 13088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015714	GAA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705983
2	NC_015714	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705983
3	NC_015714	ACA	2	6	538	543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338705983
4	NC_015714	CTT	2	6	658	663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705983
5	NC_015714	AAG	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705983
6	NC_015714	TGT	2	6	945	950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705983
7	NC_015714	TTC	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705983
8	NC_015714	TTC	2	6	1078	1083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705983
9	NC_015714	TTC	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705983
10	NC_015714	GTT	2	6	1192	1197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705983
11	NC_015714	ACT	2	6	1249	1254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705983
12	NC_015714	TGG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338705983
13	NC_015714	GTG	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015714	TTC	2	6	1507	1512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015714	TAT	2	6	1583	1588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015714	TAA	2	6	1622	1627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015714	GGA	2	6	1628	1633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015714	AAG	2	6	1661	1666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705984
19	NC_015714	GCT	2	6	1747	1752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705984
20	NC_015714	ACG	2	6	1840	1845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705984
21	NC_015714	TGT	2	6	1869	1874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705984
22	NC_015714	CAA	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338705984
23	NC_015714	GAA	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705984
24	NC_015714	AGG	2	6	2010	2015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705984
25	NC_015714	AGA	2	6	2082	2087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705984
26	NC_015714	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705984
27	NC_015714	GCA	2	6	2301	2306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705984
28	NC_015714	TCT	2	6	2338	2343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705984
29	NC_015714	ATC	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705984
30	NC_015714	GTT	2	6	2454	2459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705984
31	NC_015714	TTA	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705984
32	NC_015714	CAG	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705984
33	NC_015714	TTG	2	6	2506	2511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705984
34	NC_015714	GAA	2	6	2563	2568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705984
35	NC_015714	GAA	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705984
36	NC_015714	AGG	2	6	2654	2659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705984
37	NC_015714	CAT	2	6	2730	2735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705984
38	NC_015714	TGC	2	6	2896	2901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705985
39	NC_015714	CAG	2	6	3088	3093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705985
40	NC_015714	CTT	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705985
41	NC_015714	TAT	2	6	3374	3379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705985
42	NC_015714	CTC	2	6	3436	3441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338705985
43	NC_015714	GAG	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705985
44	NC_015714	GAT	2	6	3668	3673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705985
45	NC_015714	ATG	2	6	3713	3718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705985
46	NC_015714	AAT	2	6	3831	3836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338705985
47	NC_015714	CGT	2	6	4081	4086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705986
48	NC_015714	GAA	2	6	4248	4253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705986
49	NC_015714	GAA	2	6	4395	4400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705987
50	NC_015714	GGA	2	6	4559	4564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705987
51	NC_015714	TTC	2	6	4876	4881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705987
52	NC_015714	TCT	2	6	4898	4903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705987
53	NC_015714	TTG	2	6	5122	5127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705987
54	NC_015714	ATT	2	6	5175	5180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705987
55	NC_015714	TAC	2	6	5207	5212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705987
56	NC_015714	ACG	2	6	5278	5283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705987
57	NC_015714	GTA	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705987
58	NC_015714	ATC	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705987
59	NC_015714	TCT	2	6	5757	5762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705987
60	NC_015714	GGA	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705987
61	NC_015714	GTT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705987
62	NC_015714	GAT	2	6	5844	5849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705987
63	NC_015714	AGA	2	6	5894	5899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705987
64	NC_015714	GGA	2	6	5991	5996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705987
65	NC_015714	GGC	2	6	6020	6025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338705987
66	NC_015714	TTA	2	6	6034	6039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705987
67	NC_015714	TAA	2	6	6227	6232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338705987
68	NC_015714	ACT	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705987
69	NC_015714	TAT	2	6	6314	6319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705987
70	NC_015714	TTA	2	6	6391	6396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705987
71	NC_015714	AAC	2	6	6523	6528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338705987
72	NC_015714	AGA	2	6	6616	6621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705987
73	NC_015714	GTG	2	6	6754	6759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338705987
74	NC_015714	TAG	3	9	6799	6807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705987
75	NC_015714	TGT	2	6	6874	6879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705988
76	NC_015714	GAG	2	6	6937	6942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705988
77	NC_015714	ATT	2	6	6972	6977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705988
78	NC_015714	GGA	2	6	7136	7141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705989
79	NC_015714	CTT	2	6	7142	7147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705989
80	NC_015714	GAT	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705989
81	NC_015714	ACT	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705989
82	NC_015714	TGA	2	6	7619	7624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705989
83	NC_015714	GCA	2	6	7627	7632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705989
84	NC_015714	TCA	2	6	7802	7807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705989
85	NC_015714	TTG	2	6	7813	7818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705989
86	NC_015714	AAG	2	6	7915	7920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705989
87	NC_015714	GAT	2	6	8050	8055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705989
88	NC_015714	TCT	2	6	8403	8408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705990
89	NC_015714	TGT	2	6	8678	8683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705990
90	NC_015714	CTG	2	6	8786	8791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705990
91	NC_015714	ACG	2	6	8811	8816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705990
92	NC_015714	ATC	2	6	8918	8923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705990
93	NC_015714	GCA	2	6	8952	8957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705990
94	NC_015714	ACT	2	6	8993	8998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705990
95	NC_015714	CGC	2	6	9011	9016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338705990
96	NC_015714	CCT	2	6	9036	9041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338705990
97	NC_015714	ACG	2	6	9119	9124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705990
98	NC_015714	TCT	2	6	9148	9153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705990
99	NC_015714	CGA	2	6	9175	9180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705990
100	NC_015714	TGT	2	6	9313	9318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705990
101	NC_015714	CCT	2	6	9358	9363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338705990
102	NC_015714	CTT	2	6	9404	9409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705990
103	NC_015714	TCT	2	6	9543	9548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705990
104	NC_015714	GTG	2	6	9621	9626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338705990
105	NC_015714	GCT	2	6	9833	9838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705990
106	NC_015714	GAT	2	6	9934	9939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705990
107	NC_015714	AGT	2	6	10145	10150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705990
108	NC_015714	TCA	2	6	10162	10167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705990
109	NC_015714	TAA	2	6	10178	10183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015714	GAA	2	6	10293	10298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705991
111	NC_015714	GTG	2	6	10337	10342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338705991
112	NC_015714	AGT	2	6	10371	10376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705991
113	NC_015714	TCC	2	6	10542	10547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338705992
114	NC_015714	CTG	2	6	10564	10569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705992
115	NC_015714	GTC	2	6	10584	10589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705992
116	NC_015714	TTG	2	6	10680	10685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705992
117	NC_015714	GAC	2	6	10811	10816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705992
118	NC_015714	AAG	3	9	10838	10846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705992
119	NC_015714	TAC	2	6	10952	10957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705992
120	NC_015714	TGG	2	6	10997	11002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338705992
121	NC_015714	TCG	2	6	11079	11084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705992
122	NC_015714	GCA	2	6	11244	11249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705992
123	NC_015714	CAT	2	6	11298	11303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705992
124	NC_015714	AAG	2	6	11406	11411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705992
125	NC_015714	TTG	2	6	11503	11508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705992
126	NC_015714	CTG	2	6	11509	11514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705992
127	NC_015714	CGC	2	6	11534	11539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338705992
128	NC_015714	CAC	2	6	11557	11562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338705992
129	NC_015714	CCT	2	6	11604	11609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338705992
130	NC_015714	CGT	2	6	11630	11635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705992
131	NC_015714	GGT	2	6	11724	11729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338705992
132	NC_015714	AGT	2	6	11847	11852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705992
133	NC_015714	AAG	2	6	12021	12026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705992
134	NC_015714	TCC	2	6	12044	12049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338705992
135	NC_015714	TGT	2	6	12089	12094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705992
136	NC_015714	TGC	2	6	12128	12133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705992
137	NC_015714	GGT	2	6	12207	12212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338705992
138	NC_015714	CGT	2	6	12342	12347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705992
139	NC_015714	GAT	2	6	12476	12481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015714	GGT	2	6	12620	12625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338705993
141	NC_015714	TGT	2	6	12640	12645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705993
142	NC_015714	GGA	2	6	12698	12703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705993
143	NC_015714	ATG	2	6	12748	12753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705993
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145	NC_015714	TTG	2	6	12913	12918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705993
146	NC_015714	CAT	2	6	12980	12985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705993
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148	NC_015714	TGA	2	6	13052	13057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705993
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150	NC_015714	GAG	2	6	13221	13226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705993
151	NC_015714	GAA	2	6	13313	13318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705993
152	NC_015714	TGA	2	6	13360	13365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705993
153	NC_015714	CGG	2	6	13486	13491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338705993
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155	NC_015714	TCT	2	6	13688	13693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705993
156	NC_015714	GTC	2	6	13813	13818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705993
157	NC_015714	TAT	2	6	13893	13898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015714	GTG	2	6	13952	13957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015714	GTT	2	6	14040	14045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705994
160	NC_015714	GCT	2	6	14052	14057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705994
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167	NC_015714	ATT	2	6	14729	14734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705994
168	NC_015714	TTA	2	6	14746	14751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705994
169	NC_015714	GTG	2	6	14762	14767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338705994
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254	NC_015714	ACA	2	6	22609	22614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338705998
255	NC_015714	CTG	2	6	22737	22742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705998
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259	NC_015714	GTT	2	6	22917	22922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705998
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270	NC_015714	GGC	2	6	24413	24418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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310	NC_015714	CTC	2	6	29111	29116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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