MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 4530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015714	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	338705983
2	NC_015714	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	338705983
3	NC_015714	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	338705983
4	NC_015714	TG	4	8	1520	1527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015714	TC	3	6	2018	2023	0 %	50 %	0 %	50 %	338705984
6	NC_015714	TA	3	6	2176	2181	50 %	50 %	0 %	0 %	338705984
7	NC_015714	AT	3	6	2820	2825	50 %	50 %	0 %	0 %	338705985
8	NC_015714	CA	3	6	3005	3010	50 %	0 %	0 %	50 %	338705985
9	NC_015714	AG	3	6	3248	3253	50 %	0 %	50 %	0 %	338705985
10	NC_015714	AT	3	6	3878	3883	50 %	50 %	0 %	0 %	338705986
11	NC_015714	GT	3	6	3930	3935	0 %	50 %	50 %	0 %	338705986
12	NC_015714	TC	3	6	4347	4352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015714	GA	3	6	6215	6220	50 %	0 %	50 %	0 %	338705987
14	NC_015714	CG	3	6	6307	6312	0 %	0 %	50 %	50 %	338705987
15	NC_015714	AC	3	6	6625	6630	50 %	0 %	0 %	50 %	338705987
16	NC_015714	GT	3	6	6729	6734	0 %	50 %	50 %	0 %	338705987
17	NC_015714	GT	3	6	6772	6777	0 %	50 %	50 %	0 %	338705987
18	NC_015714	GA	3	6	7437	7442	50 %	0 %	50 %	0 %	338705989
19	NC_015714	GC	3	6	7549	7554	0 %	0 %	50 %	50 %	338705989
20	NC_015714	AC	4	8	8177	8184	50 %	0 %	0 %	50 %	338705989
21	NC_015714	AT	4	8	8574	8581	50 %	50 %	0 %	0 %	338705990
22	NC_015714	CG	3	6	8708	8713	0 %	0 %	50 %	50 %	338705990
23	NC_015714	AG	4	8	9426	9433	50 %	0 %	50 %	0 %	338705990
24	NC_015714	AC	3	6	9826	9831	50 %	0 %	0 %	50 %	338705990
25	NC_015714	AG	3	6	9889	9894	50 %	0 %	50 %	0 %	338705990
26	NC_015714	TC	3	6	9946	9951	0 %	50 %	0 %	50 %	338705990
27	NC_015714	GC	3	6	10086	10091	0 %	0 %	50 %	50 %	338705990
28	NC_015714	TA	3	6	10220	10225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015714	TA	3	6	10247	10252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015714	TC	3	6	10746	10751	0 %	50 %	0 %	50 %	338705992
31	NC_015714	GC	3	6	11335	11340	0 %	0 %	50 %	50 %	338705992
32	NC_015714	GT	3	6	11376	11381	0 %	50 %	50 %	0 %	338705992
33	NC_015714	GT	3	6	11566	11571	0 %	50 %	50 %	0 %	338705992
34	NC_015714	CG	3	6	11839	11844	0 %	0 %	50 %	50 %	338705992
35	NC_015714	TA	3	6	11953	11958	50 %	50 %	0 %	0 %	338705992
36	NC_015714	CA	3	6	12073	12078	50 %	0 %	0 %	50 %	338705992
37	NC_015714	TA	3	6	12351	12356	50 %	50 %	0 %	0 %	338705992
38	NC_015714	GT	3	6	12399	12404	0 %	50 %	50 %	0 %	338705992
39	NC_015714	GA	3	6	12557	12562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015714	GT	3	6	12565	12570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015714	GC	3	6	12658	12663	0 %	0 %	50 %	50 %	338705993
42	NC_015714	GC	3	6	13105	13110	0 %	0 %	50 %	50 %	338705993
43	NC_015714	GT	3	6	13188	13193	0 %	50 %	50 %	0 %	338705993
44	NC_015714	CA	5	10	13280	13289	50 %	0 %	0 %	50 %	338705993
45	NC_015714	GA	3	6	13364	13369	50 %	0 %	50 %	0 %	338705993
46	NC_015714	GC	3	6	13575	13580	0 %	0 %	50 %	50 %	338705993
47	NC_015714	CT	4	8	13624	13631	0 %	50 %	0 %	50 %	338705993
48	NC_015714	GC	3	6	14311	14316	0 %	0 %	50 %	50 %	338705994
49	NC_015714	CG	3	6	14345	14350	0 %	0 %	50 %	50 %	338705994
50	NC_015714	AT	3	6	14588	14593	50 %	50 %	0 %	0 %	338705994
51	NC_015714	TG	3	6	15998	16003	0 %	50 %	50 %	0 %	338705995
52	NC_015714	CG	3	6	16433	16438	0 %	0 %	50 %	50 %	338705995
53	NC_015714	CG	3	6	16540	16545	0 %	0 %	50 %	50 %	338705995
54	NC_015714	GT	4	8	16871	16878	0 %	50 %	50 %	0 %	338705995
55	NC_015714	CA	3	6	16880	16885	50 %	0 %	0 %	50 %	338705995
56	NC_015714	GT	3	6	17261	17266	0 %	50 %	50 %	0 %	338705995
57	NC_015714	CG	3	6	17380	17385	0 %	0 %	50 %	50 %	338705995
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60	NC_015714	CG	4	8	17567	17574	0 %	0 %	50 %	50 %	338705995
61	NC_015714	GT	3	6	18307	18312	0 %	50 %	50 %	0 %	338705995
62	NC_015714	GT	3	6	18385	18390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015714	CG	3	6	18398	18403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015714	AT	3	6	18418	18423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015714	AT	3	6	18731	18736	50 %	50 %	0 %	0 %	338705996
66	NC_015714	GT	3	6	18787	18792	0 %	50 %	50 %	0 %	338705996
67	NC_015714	GC	3	6	18837	18842	0 %	0 %	50 %	50 %	338705996
68	NC_015714	CG	3	6	19510	19515	0 %	0 %	50 %	50 %	338705997
69	NC_015714	CG	3	6	19992	19997	0 %	0 %	50 %	50 %	338705997
70	NC_015714	GT	3	6	20425	20430	0 %	50 %	50 %	0 %	338705997
71	NC_015714	CG	3	6	20844	20849	0 %	0 %	50 %	50 %	338705997
72	NC_015714	CT	4	8	21187	21194	0 %	50 %	0 %	50 %	338705997
73	NC_015714	GC	3	6	21206	21211	0 %	0 %	50 %	50 %	338705997
74	NC_015714	GA	3	6	21746	21751	50 %	0 %	50 %	0 %	338705997
75	NC_015714	CA	3	6	21940	21945	50 %	0 %	0 %	50 %	338705997
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82	NC_015714	CA	3	6	24466	24471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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84	NC_015714	GA	4	8	24572	24579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_015714	CG	3	6	26824	26829	0 %	0 %	50 %	50 %	338705999
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91	NC_015714	GT	4	8	27497	27504	0 %	50 %	50 %	0 %	338705999
92	NC_015714	GC	4	8	27539	27546	0 %	0 %	50 %	50 %	338705999
93	NC_015714	GT	4	8	27891	27898	0 %	50 %	50 %	0 %	338706000
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95	NC_015714	GT	3	6	28132	28137	0 %	50 %	50 %	0 %	338706000
96	NC_015714	AT	4	8	28225	28232	50 %	50 %	0 %	0 %	338706000
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98	NC_015714	TG	3	6	28593	28598	0 %	50 %	50 %	0 %	338706000
99	NC_015714	AT	3	6	29020	29025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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104	NC_015714	TG	3	6	30718	30723	0 %	50 %	50 %	0 %	338706002
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106	NC_015714	GT	3	6	31137	31142	0 %	50 %	50 %	0 %	338706002
107	NC_015714	GA	3	6	31816	31821	50 %	0 %	50 %	0 %	338706002
108	NC_015714	GT	3	6	32485	32490	0 %	50 %	50 %	0 %	338706002
109	NC_015714	AC	3	6	32526	32531	50 %	0 %	0 %	50 %	338706002
110	NC_015714	GC	3	6	33070	33075	0 %	0 %	50 %	50 %	338706003
111	NC_015714	AG	3	6	33182	33187	50 %	0 %	50 %	0 %	338706003
112	NC_015714	AG	3	6	33191	33196	50 %	0 %	50 %	0 %	338706003
113	NC_015714	CG	3	6	33392	33397	0 %	0 %	50 %	50 %	338706003
114	NC_015714	AC	3	6	33817	33822	50 %	0 %	0 %	50 %	338706003
115	NC_015714	CG	3	6	34083	34088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015714	GT	3	6	34272	34277	0 %	50 %	50 %	0 %	338706004
117	NC_015714	GC	3	6	34810	34815	0 %	0 %	50 %	50 %	338706004
118	NC_015714	CG	4	8	34896	34903	0 %	0 %	50 %	50 %	338706004
119	NC_015714	GC	3	6	35079	35084	0 %	0 %	50 %	50 %	338706004
120	NC_015714	GC	3	6	35134	35139	0 %	0 %	50 %	50 %	338706004
121	NC_015714	AT	3	6	35208	35213	50 %	50 %	0 %	0 %	338706004
122	NC_015714	TA	3	6	35297	35302	50 %	50 %	0 %	0 %	338706004
123	NC_015714	TG	3	6	35453	35458	0 %	50 %	50 %	0 %	338706004
124	NC_015714	GC	3	6	35523	35528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015714	TG	3	6	35573	35578	0 %	50 %	50 %	0 %	338706005
126	NC_015714	CT	3	6	35751	35756	0 %	50 %	0 %	50 %	338706005
127	NC_015714	GT	4	8	35951	35958	0 %	50 %	50 %	0 %	338706005
128	NC_015714	GC	3	6	36098	36103	0 %	0 %	50 %	50 %	338706005
129	NC_015714	CA	3	6	36149	36154	50 %	0 %	0 %	50 %	338706005
130	NC_015714	TG	3	6	36191	36196	0 %	50 %	50 %	0 %	338706005
131	NC_015714	CG	3	6	36718	36723	0 %	0 %	50 %	50 %	338706005
132	NC_015714	TG	3	6	36976	36981	0 %	50 %	50 %	0 %	338706006
133	NC_015714	GT	3	6	37050	37055	0 %	50 %	50 %	0 %	338706006
134	NC_015714	CA	3	6	37100	37105	50 %	0 %	0 %	50 %	338706006
135	NC_015714	GC	3	6	37605	37610	0 %	0 %	50 %	50 %	338706006
136	NC_015714	AC	3	6	37675	37680	50 %	0 %	0 %	50 %	338706006
137	NC_015714	TG	3	6	38059	38064	0 %	50 %	50 %	0 %	338706006
138	NC_015714	GC	3	6	38169	38174	0 %	0 %	50 %	50 %	338706006
139	NC_015714	CT	3	6	39505	39510	0 %	50 %	0 %	50 %	338706007
140	NC_015714	GT	3	6	40659	40664	0 %	50 %	50 %	0 %	338706008
141	NC_015714	GT	3	6	40684	40689	0 %	50 %	50 %	0 %	338706008
142	NC_015714	GC	3	6	41010	41015	0 %	0 %	50 %	50 %	338706008
143	NC_015714	TG	3	6	41180	41185	0 %	50 %	50 %	0 %	338706009
144	NC_015714	AT	3	6	41363	41368	50 %	50 %	0 %	0 %	338706009
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