MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 368

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015714	TG	4	8	1520	1527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015714	TC	3	6	4347	4352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015714	TA	3	6	10220	10225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015714	TA	3	6	10247	10252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015714	GA	3	6	12557	12562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015714	GT	3	6	12565	12570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015714	GT	3	6	18385	18390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015714	CG	3	6	18398	18403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015714	AT	3	6	18418	18423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015714	GA	4	8	24428	24435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015714	CA	3	6	24466	24471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015714	TC	3	6	24507	24512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015714	GA	4	8	24572	24579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015714	TC	3	6	24652	24657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015714	AT	3	6	29020	29025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015714	CG	3	6	34083	34088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015714	GC	3	6	35523	35528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015714	GT	3	6	55715	55720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015714	AC	3	6	55815	55820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015714	CA	3	6	55870	55875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015714	GT	3	6	55882	55887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015714	TG	3	6	62997	63002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015714	AG	3	6	69248	69253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015714	CG	3	6	71159	71164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015714	TG	3	6	71190	71195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015714	TG	3	6	74039	74044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015714	GT	3	6	79132	79137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015714	GC	3	6	80891	80896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015714	AG	3	6	82464	82469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015714	GA	3	6	84418	84423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015714	CG	3	6	92443	92448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015714	TG	3	6	97512	97517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015714	CG	3	6	102874	102879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015714	GC	3	6	105942	105947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015714	CT	3	6	106764	106769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015714	GA	3	6	106775	106780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015714	AC	3	6	112218	112223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015714	GC	3	6	112438	112443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015714	CA	3	6	112681	112686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015714	TG	3	6	112751	112756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015714	GC	3	6	112871	112876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015714	TG	3	6	113003	113008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015714	AC	3	6	113085	113090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015714	TG	4	8	113457	113464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015714	GT	3	6	113476	113481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015714	GC	3	6	113545	113550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015714	TA	3	6	113849	113854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015714	CA	3	6	122186	122191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015714	TG	4	8	124883	124890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015714	GT	3	6	125109	125114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015714	AG	3	6	132726	132731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015714	TG	3	6	135083	135088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015714	CG	3	6	135507	135512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015714	CA	3	6	136233	136238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015714	GT	3	6	136498	136503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015714	CT	3	6	138031	138036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015714	GT	3	6	139576	139581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015714	CG	3	6	140909	140914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015714	CT	3	6	140954	140959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015714	GC	3	6	142888	142893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015714	CT	3	6	142985	142990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015714	GC	3	6	147536	147541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015714	TG	3	6	151037	151042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015714	CG	3	6	151461	151466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015714	CA	3	6	152187	152192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015714	GT	3	6	152452	152457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015714	GC	3	6	153999	154004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015714	GC	3	6	154013	154018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015714	CG	3	6	154039	154044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015714	CG	3	6	155012	155017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015714	GC	3	6	155064	155069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015714	CG	4	8	155129	155136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015714	GC	3	6	155318	155323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015714	TC	3	6	166650	166655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015714	GC	3	6	166931	166936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015714	TG	3	6	167480	167485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015714	GC	3	6	167542	167547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015714	GC	3	6	167799	167804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015714	AC	3	6	173850	173855	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015714	GA	3	6	173856	173861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015714	TG	3	6	173887	173892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015714	CT	3	6	174442	174447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015714	CG	3	6	181856	181861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015714	GC	3	6	184193	184198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015714	GC	3	6	201696	201701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015714	GT	3	6	203150	203155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015714	GT	4	8	203517	203524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015714	TC	3	6	216477	216482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015714	GC	3	6	217264	217269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015714	TG	4	8	219420	219427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015714	TG	3	6	226045	226050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015714	CG	3	6	227670	227675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015714	TG	3	6	227681	227686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015714	TG	4	8	228557	228564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015714	GC	3	6	228580	228585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015714	AC	3	6	228993	228998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015714	CA	3	6	229489	229494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015714	AC	3	6	229907	229912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015714	AC	3	6	230076	230081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015714	TC	3	6	230315	230320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015714	AG	3	6	230750	230755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015714	CG	3	6	230822	230827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015714	AG	3	6	230890	230895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015714	AG	3	6	231826	231831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015714	GA	3	6	232239	232244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015714	AC	3	6	232271	232276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015714	AC	3	6	235190	235195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015714	GA	3	6	238881	238886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015714	GT	3	6	239571	239576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015714	GT	3	6	239639	239644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015714	TG	3	6	240400	240405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015714	TG	3	6	243938	243943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015714	TG	3	6	252011	252016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015714	CT	3	6	261116	261121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015714	GT	3	6	261420	261425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015714	GT	3	6	261472	261477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015714	AG	3	6	261490	261495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015714	TG	3	6	261723	261728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015714	GT	3	6	264063	264068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015714	GT	3	6	265650	265655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015714	GT	3	6	268623	268628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015714	GC	3	6	269284	269289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015714	CA	3	6	269337	269342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015714	GC	3	6	270796	270801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015714	GC	3	6	275382	275387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015714	TG	4	8	276944	276951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015714	GC	3	6	276967	276972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015714	AC	3	6	277380	277385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015714	CA	3	6	277876	277881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015714	AC	3	6	278294	278299	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015714	AC	3	6	278463	278468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015714	TC	3	6	278702	278707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015714	AG	3	6	279147	279152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015714	CG	3	6	279219	279224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015714	AG	3	6	279287	279292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015714	AG	3	6	280223	280228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015714	GA	3	6	280636	280641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015714	AC	3	6	280668	280673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015714	GA	3	6	288729	288734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015714	GC	3	6	290925	290930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015714	TC	3	6	290965	290970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015714	GT	4	8	295514	295521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015714	AG	3	6	296409	296414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015714	TC	3	6	309550	309555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015714	GA	3	6	309644	309649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015714	CG	3	6	321245	321250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015714	TG	3	6	321302	321307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015714	GA	3	6	325348	325353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015714	GT	3	6	326459	326464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015714	TG	4	8	326547	326554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015714	TC	3	6	327103	327108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015714	CA	3	6	327416	327421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015714	GT	3	6	328140	328145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015714	CT	3	6	328704	328709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.