MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 4162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015714	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	338705983
2	NC_015714	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	338705983
3	NC_015714	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	338705983
4	NC_015714	TC	3	6	2018	2023	0 %	50 %	0 %	50 %	338705984
5	NC_015714	TA	3	6	2176	2181	50 %	50 %	0 %	0 %	338705984
6	NC_015714	AT	3	6	2820	2825	50 %	50 %	0 %	0 %	338705985
7	NC_015714	CA	3	6	3005	3010	50 %	0 %	0 %	50 %	338705985
8	NC_015714	AG	3	6	3248	3253	50 %	0 %	50 %	0 %	338705985
9	NC_015714	AT	3	6	3878	3883	50 %	50 %	0 %	0 %	338705986
10	NC_015714	GT	3	6	3930	3935	0 %	50 %	50 %	0 %	338705986
11	NC_015714	GA	3	6	6215	6220	50 %	0 %	50 %	0 %	338705987
12	NC_015714	CG	3	6	6307	6312	0 %	0 %	50 %	50 %	338705987
13	NC_015714	AC	3	6	6625	6630	50 %	0 %	0 %	50 %	338705987
14	NC_015714	GT	3	6	6729	6734	0 %	50 %	50 %	0 %	338705987
15	NC_015714	GT	3	6	6772	6777	0 %	50 %	50 %	0 %	338705987
16	NC_015714	GA	3	6	7437	7442	50 %	0 %	50 %	0 %	338705989
17	NC_015714	GC	3	6	7549	7554	0 %	0 %	50 %	50 %	338705989
18	NC_015714	AC	4	8	8177	8184	50 %	0 %	0 %	50 %	338705989
19	NC_015714	AT	4	8	8574	8581	50 %	50 %	0 %	0 %	338705990
20	NC_015714	CG	3	6	8708	8713	0 %	0 %	50 %	50 %	338705990
21	NC_015714	AG	4	8	9426	9433	50 %	0 %	50 %	0 %	338705990
22	NC_015714	AC	3	6	9826	9831	50 %	0 %	0 %	50 %	338705990
23	NC_015714	AG	3	6	9889	9894	50 %	0 %	50 %	0 %	338705990
24	NC_015714	TC	3	6	9946	9951	0 %	50 %	0 %	50 %	338705990
25	NC_015714	GC	3	6	10086	10091	0 %	0 %	50 %	50 %	338705990
26	NC_015714	TC	3	6	10746	10751	0 %	50 %	0 %	50 %	338705992
27	NC_015714	GC	3	6	11335	11340	0 %	0 %	50 %	50 %	338705992
28	NC_015714	GT	3	6	11376	11381	0 %	50 %	50 %	0 %	338705992
29	NC_015714	GT	3	6	11566	11571	0 %	50 %	50 %	0 %	338705992
30	NC_015714	CG	3	6	11839	11844	0 %	0 %	50 %	50 %	338705992
31	NC_015714	TA	3	6	11953	11958	50 %	50 %	0 %	0 %	338705992
32	NC_015714	CA	3	6	12073	12078	50 %	0 %	0 %	50 %	338705992
33	NC_015714	TA	3	6	12351	12356	50 %	50 %	0 %	0 %	338705992
34	NC_015714	GT	3	6	12399	12404	0 %	50 %	50 %	0 %	338705992
35	NC_015714	GC	3	6	12658	12663	0 %	0 %	50 %	50 %	338705993
36	NC_015714	GC	3	6	13105	13110	0 %	0 %	50 %	50 %	338705993
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39	NC_015714	GA	3	6	13364	13369	50 %	0 %	50 %	0 %	338705993
40	NC_015714	GC	3	6	13575	13580	0 %	0 %	50 %	50 %	338705993
41	NC_015714	CT	4	8	13624	13631	0 %	50 %	0 %	50 %	338705993
42	NC_015714	GC	3	6	14311	14316	0 %	0 %	50 %	50 %	338705994
43	NC_015714	CG	3	6	14345	14350	0 %	0 %	50 %	50 %	338705994
44	NC_015714	AT	3	6	14588	14593	50 %	50 %	0 %	0 %	338705994
45	NC_015714	TG	3	6	15998	16003	0 %	50 %	50 %	0 %	338705995
46	NC_015714	CG	3	6	16433	16438	0 %	0 %	50 %	50 %	338705995
47	NC_015714	CG	3	6	16540	16545	0 %	0 %	50 %	50 %	338705995
48	NC_015714	GT	4	8	16871	16878	0 %	50 %	50 %	0 %	338705995
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50	NC_015714	GT	3	6	17261	17266	0 %	50 %	50 %	0 %	338705995
51	NC_015714	CG	3	6	17380	17385	0 %	0 %	50 %	50 %	338705995
52	NC_015714	AG	3	6	17413	17418	50 %	0 %	50 %	0 %	338705995
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54	NC_015714	CG	4	8	17567	17574	0 %	0 %	50 %	50 %	338705995
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60	NC_015714	CG	3	6	19992	19997	0 %	0 %	50 %	50 %	338705997
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62	NC_015714	CG	3	6	20844	20849	0 %	0 %	50 %	50 %	338705997
63	NC_015714	CT	4	8	21187	21194	0 %	50 %	0 %	50 %	338705997
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68	NC_015714	AC	3	6	22512	22517	50 %	0 %	0 %	50 %	338705998
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104	NC_015714	GC	3	6	35134	35139	0 %	0 %	50 %	50 %	338706004
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110	NC_015714	GT	4	8	35951	35958	0 %	50 %	50 %	0 %	338706005
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113	NC_015714	TG	3	6	36191	36196	0 %	50 %	50 %	0 %	338706005
114	NC_015714	CG	3	6	36718	36723	0 %	0 %	50 %	50 %	338706005
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120	NC_015714	TG	3	6	38059	38064	0 %	50 %	50 %	0 %	338706006
121	NC_015714	GC	3	6	38169	38174	0 %	0 %	50 %	50 %	338706006
122	NC_015714	CT	3	6	39505	39510	0 %	50 %	0 %	50 %	338706007
123	NC_015714	GT	3	6	40659	40664	0 %	50 %	50 %	0 %	338706008
124	NC_015714	GT	3	6	40684	40689	0 %	50 %	50 %	0 %	338706008
125	NC_015714	GC	3	6	41010	41015	0 %	0 %	50 %	50 %	338706008
126	NC_015714	TG	3	6	41180	41185	0 %	50 %	50 %	0 %	338706009
127	NC_015714	AT	3	6	41363	41368	50 %	50 %	0 %	0 %	338706009
128	NC_015714	CA	3	6	41700	41705	50 %	0 %	0 %	50 %	338706009
129	NC_015714	CA	3	6	41732	41737	50 %	0 %	0 %	50 %	338706009
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133	NC_015714	AG	3	6	42948	42953	50 %	0 %	50 %	0 %	338706011
134	NC_015714	CG	3	6	43096	43101	0 %	0 %	50 %	50 %	338706012
135	NC_015714	CT	3	6	43421	43426	0 %	50 %	0 %	50 %	338706012
136	NC_015714	GC	3	6	43974	43979	0 %	0 %	50 %	50 %	338706013
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138	NC_015714	CA	3	6	44520	44525	50 %	0 %	0 %	50 %	338706013
139	NC_015714	GA	3	6	45230	45235	50 %	0 %	50 %	0 %	338706014
140	NC_015714	CG	3	6	45285	45290	0 %	0 %	50 %	50 %	338706014
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142	NC_015714	CG	3	6	45868	45873	0 %	0 %	50 %	50 %	338706015
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