MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015714	T	8	8	1483	1490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015714	A	6	6	1495	1500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015714	T	6	6	12481	12486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015714	G	10	10	12523	12532	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015714	G	6	6	24828	24833	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015714	A	6	6	24908	24913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015714	G	6	6	24955	24960	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015714	A	7	7	25093	25099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015714	G	6	6	29142	29147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015714	T	9	9	38327	38335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015714	T	6	6	40192	40197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015714	A	6	6	55624	55629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015714	T	6	6	59568	59573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015714	C	9	9	69105	69113	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_015714	A	6	6	69221	69226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015714	T	6	6	78668	78673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015714	T	6	6	78689	78694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015714	C	10	10	94809	94818	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_015714	A	6	6	111852	111857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015714	T	6	6	113022	113027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015714	A	9	9	113659	113667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015714	T	6	6	113834	113839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015714	A	6	6	122083	122088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015714	A	6	6	122143	122148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015714	T	6	6	132768	132773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015714	C	9	9	136667	136675	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_015714	C	8	8	140882	140889	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_015714	A	6	6	142905	142910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015714	T	6	6	149766	149771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015714	C	9	9	152621	152629	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_015714	A	6	6	167098	167103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015714	T	7	7	167521	167527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015714	T	6	6	167666	167671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015714	T	7	7	179890	179896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015714	T	6	6	188629	188634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015714	T	6	6	201868	201873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015714	G	8	8	205999	206006	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015714	A	6	6	216519	216524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015714	T	6	6	227630	227635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015714	A	6	6	231327	231332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015714	T	6	6	241715	241720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015714	T	9	9	243909	243917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015714	G	6	6	244154	244159	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015714	T	7	7	252041	252047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015714	G	6	6	261613	261618	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015714	C	6	6	275419	275424	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_015714	A	6	6	279724	279729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015714	G	7	7	295622	295628	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015714	T	6	6	296482	296487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015714	T	6	6	302312	302317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015714	T	6	6	303199	303204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015714	T	6	6	321257	321262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015714	T	6	6	325380	325385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015714	G	6	6	325405	325410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015714	G	9	9	326501	326509	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015714	C	9	9	331497	331505	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_015714	G	6	6	331630	331635	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015714	T	6	6	336688	336693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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61	NC_015714	G	6	6	368861	368866	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015714	G	10	10	369592	369601	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015714	T	6	6	379408	379413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015714	T	6	6	391539	391544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015714	T	6	6	397670	397675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_015714	T	8	8	418633	418640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015714	T	6	6	431860	431865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73	NC_015714	T	6	6	474042	474047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015714	C	6	6	480954	480959	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_015714	C	6	6	480974	480979	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_015714	G	6	6	487474	487479	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015714	G	6	6	488659	488664	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_015714	A	6	6	802767	802772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_015714	A	6	6	877497	877502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015714	T	6	6	878495	878500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015714	G	6	6	878508	878513	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015714	A	8	8	881779	881786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015714	A	6	6	886290	886295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015714	A	6	6	894960	894965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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118	NC_015714	A	6	6	915148	915153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015714	T	6	6	930572	930577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015714	T	6	6	931032	931037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015714	G	9	9	931262	931270	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015714	T	6	6	935098	935103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015714	A	6	6	941900	941905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015714	A	7	7	941910	941916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015714	T	7	7	944271	944277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015714	T	7	7	947399	947405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_015714	A	7	7	1019428	1019434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.