MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Simkania negevensis Z chromosome gsn.131

Total Repeats: 850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015713	CAATAT	2	12	385	396	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338731897
2	NC_015713	TTTTCT	2	12	2912	2923	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338731899
3	NC_015713	GATTTA	2	12	6382	6393	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338731900
4	NC_015713	ATCAAT	2	12	11384	11395	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338731906
5	NC_015713	TTACTA	2	12	12869	12880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338731907
6	NC_015713	AAGGGA	2	12	25902	25913	50 %	0 %	50 %	0 %	338731919
7	NC_015713	CAATAA	2	12	27518	27529	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	338731920
8	NC_015713	TGGAGG	2	12	30895	30906	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	338731925
9	NC_015713	GCCCTG	2	12	31759	31770	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015713	GAAGGG	2	12	33193	33204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731926
11	NC_015713	TCTCCT	2	12	43118	43129	0 %	50 %	0 %	50 %	338731935
12	NC_015713	CCACCT	2	12	45035	45046	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	338731936
13	NC_015713	TTTTGA	2	12	46628	46639	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338731938
14	NC_015713	TAAAAT	2	12	48013	48024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015713	ACCCAA	2	12	48223	48234	50 %	0 %	0 %	50 %	338731941
16	NC_015713	GAAGTG	2	12	55502	55513	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338731946
17	NC_015713	TGATGC	2	12	55663	55674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338731946
18	NC_015713	AAAAGA	2	12	61089	61100	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338731950
19	NC_015713	ATTTTT	2	12	61840	61851	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	338731952
20	NC_015713	TGAGCA	2	12	65538	65549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338731958
21	NC_015713	AGTTCC	2	12	68661	68672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338731959
22	NC_015713	TCCAAA	2	12	72802	72813	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	338731962
23	NC_015713	CTGTCA	2	12	73764	73775	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338731963
24	NC_015713	CTTTTT	2	12	78220	78231	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015713	AGGAAG	2	12	78474	78485	50 %	0 %	50 %	0 %	338731967
26	NC_015713	ACCAAG	2	12	81123	81134	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338731970
27	NC_015713	TTAAAA	2	12	81339	81350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731970
28	NC_015713	GATCTC	2	12	82345	82356	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338731971
29	NC_015713	CTTGGG	2	12	82358	82369	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338731971
30	NC_015713	AACTTC	2	12	82420	82431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731971
31	NC_015713	TAAAGC	2	12	83624	83635	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338731972
32	NC_015713	AAAATA	2	12	84772	84783	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	338731972
33	NC_015713	ATCAAG	2	12	87136	87147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338731972
34	NC_015713	AAACAA	2	12	88861	88872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	338731972
35	NC_015713	CTATAC	2	12	89942	89953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731972
36	NC_015713	CTTATG	2	12	90883	90894	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338731972
37	NC_015713	AGAAAA	2	12	93859	93870	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338731976
38	NC_015713	GAGGTT	2	12	95900	95911	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338731979
39	NC_015713	GCCTTG	2	12	95990	96001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731979
40	NC_015713	CATTCC	2	12	114919	114930	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338731995
41	NC_015713	AGGGTG	2	12	127730	127741	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	338732009
42	NC_015713	GATAAA	2	12	129042	129053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338732010
43	NC_015713	TATAAC	2	12	141812	141823	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338732018
44	NC_015713	TTTGGG	2	12	144080	144091	0 %	50 %	50 %	0 %	338732021
45	NC_015713	ACCTGC	2	12	145031	145042	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338732022
46	NC_015713	TTTATC	2	12	149158	149169	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015713	CTTGAA	2	12	150740	150751	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338732032
48	NC_015713	GGGTGT	2	12	150972	150983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338732032
49	NC_015713	AGTACC	2	12	151413	151424	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338732032
50	NC_015713	TGAGCT	2	12	152159	152170	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338732033
51	NC_015713	AAAACC	2	12	152361	152372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338732033
52	NC_015713	TCAACC	2	12	152653	152664	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338732033
53	NC_015713	CTTTTT	2	12	155845	155856	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015713	ATGGCT	2	12	157749	157760	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338732039
55	NC_015713	TGAAAT	2	12	157939	157950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338732039
56	NC_015713	TATCGA	2	12	159015	159026	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338732040
57	NC_015713	AAATTC	2	12	159905	159916	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338732041
58	NC_015713	CATATG	2	12	169884	169895	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338732051
59	NC_015713	TTTCTT	2	12	170152	170163	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338732052
60	NC_015713	TTCAAT	2	12	170545	170556	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338732054
61	NC_015713	CCTGAA	2	12	172178	172189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338732059
62	NC_015713	CAGACG	2	12	176264	176275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338732061
63	NC_015713	ATAGGA	2	12	178894	178905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015713	AAAAGA	2	12	181323	181334	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338732065
65	NC_015713	TGAAAT	2	12	185226	185237	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338732067
66	NC_015713	GAAAAA	2	12	185320	185331	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338732067
67	NC_015713	CTGATC	2	12	189503	189514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338732073
68	NC_015713	GGGAAT	2	12	189636	189647	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338732073
69	NC_015713	TCGATT	2	12	191217	191228	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338732075
70	NC_015713	ATCTTC	2	12	195642	195653	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338732079
71	NC_015713	GCTCCA	2	12	199765	199776	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338732084
72	NC_015713	TTTCGA	2	12	200986	200997	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338732085
73	NC_015713	CGAGAC	2	12	204849	204860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338732091
74	NC_015713	AAATGG	2	12	210606	210617	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338732097
75	NC_015713	TGAAGA	2	12	210655	210666	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338732097
76	NC_015713	TTTGAG	2	12	215269	215280	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338732102
77	NC_015713	CATCTT	2	12	219599	219610	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338732104
78	NC_015713	CTTTTT	2	12	220638	220649	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015713	TAGTCT	2	12	224532	224543	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338732111
80	NC_015713	TGTTTC	2	12	225054	225065	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338732111
81	NC_015713	AGGAAA	2	12	232546	232557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338732119
82	NC_015713	AAATCA	2	12	234274	234285	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	338732120
83	NC_015713	ATTTTT	2	12	234795	234806	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015713	TGCCAA	2	12	234925	234936	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338732121
85	NC_015713	GCAGAA	2	12	235178	235189	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338732121
86	NC_015713	TTTGAG	2	12	236884	236895	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338732122
87	NC_015713	TCCAAA	2	12	237322	237333	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	338732122
88	NC_015713	TTTTCT	2	12	240793	240804	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338732126
89	NC_015713	GATTCA	2	12	244033	244044	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338732127
90	NC_015713	CAATGA	2	12	245256	245267	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338732128
91	NC_015713	CAATTT	2	12	248811	248822	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338732129
92	NC_015713	GAAAAA	2	12	255480	255491	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338732136
93	NC_015713	TTTTCC	2	12	256829	256840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338732137
94	NC_015713	GCAAAG	2	12	262920	262931	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338732144
95	NC_015713	ATTTCT	2	12	266359	266370	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338732149
96	NC_015713	GCAAGA	2	12	276544	276555	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338732162
97	NC_015713	AAAAAG	2	12	276678	276689	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338732162
98	NC_015713	TCTCAA	2	12	279889	279900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338732167
99	NC_015713	TTTCTG	2	12	283208	283219	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338732171
100	NC_015713	TGTTAT	2	12	286537	286548	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338732175
101	NC_015713	TGGTTG	2	12	289882	289893	0 %	50 %	50 %	0 %	338732182
102	NC_015713	ATTTTA	2	12	294320	294331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338732187
103	NC_015713	CTTTTC	2	12	295769	295780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338732189
104	NC_015713	AAAGGG	2	12	301196	301207	50 %	0 %	50 %	0 %	338732193
105	NC_015713	GGCACT	2	12	311014	311025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338732203
106	NC_015713	GAAAGA	2	12	313953	313964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338732206
107	NC_015713	TGGGGG	2	12	316140	316151	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	338732208
108	NC_015713	GAAATG	2	12	316389	316400	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338732210
109	NC_015713	TGAGGT	2	12	317088	317099	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338732211
110	NC_015713	ATAAAA	2	12	319206	319217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015713	GCCAAT	2	12	321353	321364	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338732219
112	NC_015713	GCTCTT	2	12	324320	324331	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338732222
113	NC_015713	TTTGTC	2	12	324477	324488	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338732222
114	NC_015713	GACTAT	2	12	326083	326094	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338732226
115	NC_015713	GCAAAA	2	12	326607	326618	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338732226
116	NC_015713	GATTTA	2	12	330651	330662	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338732229
117	NC_015713	ACTTAA	2	12	332766	332777	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015713	GCCAGA	2	12	335517	335528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338732236
119	NC_015713	TTTGTT	2	12	339149	339160	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	338732239
120	NC_015713	TTAATT	2	12	339339	339350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015713	GTTGAG	2	12	340866	340877	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338732240
122	NC_015713	AGCTCC	2	12	344863	344874	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338732244
123	NC_015713	CTTGAA	2	12	345196	345207	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338732245
124	NC_015713	GGATCA	2	12	346944	346955	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338732246
125	NC_015713	GATCGA	2	12	348284	348295	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338732248
126	NC_015713	AATTAA	2	12	349149	349160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338732248
127	NC_015713	AACACA	2	12	353765	353776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338732255
128	NC_015713	CTTTGC	2	12	356032	356043	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338732259
129	NC_015713	AGGGAT	2	12	356659	356670	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338732259
130	NC_015713	TCTAAC	2	12	359055	359066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338732262
131	NC_015713	CTTCCT	2	12	359382	359393	0 %	50 %	0 %	50 %	338732263
132	NC_015713	AAGAAA	2	12	360943	360954	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338732264
133	NC_015713	GCTTCG	2	12	364423	364434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338732267
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135	NC_015713	CCGGAG	2	12	372509	372520	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015713	GGTTCT	2	12	381378	381389	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338732281
137	NC_015713	ATCCAG	2	12	382447	382458	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338732283
138	NC_015713	TTTCTG	2	12	385660	385671	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338732283
139	NC_015713	GAAATT	2	12	391573	391584	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338732287
140	NC_015713	CTCCAT	2	12	393098	393109	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338732287
141	NC_015713	TGAAAA	2	12	395564	395575	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338732290
142	NC_015713	GAGTAT	2	12	401399	401410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338732296
143	NC_015713	TTTCGC	2	12	406746	406757	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015713	TAGGCA	2	12	412337	412348	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338732308
145	NC_015713	CTGAAA	2	12	414387	414398	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338732308
146	NC_015713	CTTCAA	2	12	417849	417860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338732312
147	NC_015713	TAGATG	2	12	417900	417911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338732312
148	NC_015713	CTTCTA	2	12	420578	420589	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338732313
149	NC_015713	TTTGAA	2	12	425847	425858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338732317
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151	NC_015713	AAGATG	2	12	430649	430660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338732321
152	NC_015713	TCAGAT	2	12	431973	431984	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338732323
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171	NC_015713	TAAAGT	2	12	483899	483910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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219	NC_015713	CCTTGT	2	12	641103	641114	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338732497
220	NC_015713	CATTGT	2	12	648752	648763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338732506
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223	NC_015713	TGGCGC	2	12	676482	676493	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338732540
224	NC_015713	ACTTCC	2	12	683148	683159	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338732544
225	NC_015713	ATTCCC	2	12	686265	686276	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338732548
226	NC_015713	CTTCTC	2	12	691003	691014	0 %	50 %	0 %	50 %	338732552
227	NC_015713	TGCAGC	2	12	691978	691989	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338732553
228	NC_015713	GATTTG	2	12	697070	697081	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338732558
229	NC_015713	TTTTCA	2	12	698182	698193	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338732559
230	NC_015713	CAAAAG	2	12	699549	699560	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338732560
231	NC_015713	GCATAG	2	12	699722	699733	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338732560
232	NC_015713	AACTTT	2	12	707605	707616	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338732570
233	NC_015713	CCAAAG	2	12	712021	712032	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338732574
234	NC_015713	TCCTGC	2	12	714043	714054	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338732576
235	NC_015713	AAAAGA	2	12	714942	714953	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338732576
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350	NC_015713	GGGGCG	2	12	1008101	1008112	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
351	NC_015713	TTCGTT	2	12	1008385	1008396	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
352	NC_015713	GCAAGG	2	12	1009633	1009644	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	338732875
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447	NC_015713	GATTGG	2	12	1312955	1312966	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338733160
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456	NC_015713	TGCTTC	2	12	1358548	1358559	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
457	NC_015713	AGAAGT	2	12	1362850	1362861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338733209
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459	NC_015713	AACGGC	2	12	1370096	1370107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338733215
460	NC_015713	AGTTTT	2	12	1370225	1370236	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338733215
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462	NC_015713	GATCTC	2	12	1378295	1378306	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_015713	TGATTC	2	12	1379830	1379841	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338733226
464	NC_015713	CATTCC	2	12	1381857	1381868	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338733226
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500	NC_015713	CGTGTC	2	12	1496657	1496668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338733335

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