MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Simkania negevensis Z chromosome gsn.131

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015713	GCAAT	2	10	12429	12438	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015713	ATGGA	2	10	12772	12781	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015713	TTTTC	2	10	57553	57562	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015713	TAAAA	2	10	70414	70423	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015713	AGGTC	2	10	75235	75244	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015713	TTCTT	2	10	75658	75667	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015713	ACTTC	2	10	78497	78506	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015713	ATTTA	2	10	78594	78603	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015713	AGTTT	2	10	81016	81025	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015713	CTTCT	2	10	93619	93628	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_015713	TATCA	2	10	94497	94506	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015713	AATAA	2	10	113004	113013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015713	TTCCT	2	10	126006	126015	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015713	TCAAT	2	10	126024	126033	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015713	ATTTA	2	10	127513	127522	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015713	GATGA	2	10	148820	148829	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015713	ATTGC	2	10	154304	154313	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015713	AAAGA	2	10	171746	171755	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015713	AATTA	2	10	186946	186955	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015713	CAAAA	2	10	200604	200613	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015713	TTTTG	2	10	200627	200636	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015713	CTTTC	2	10	214976	214985	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015713	TACTT	2	10	229804	229813	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015713	ATTAA	2	10	250661	250670	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015713	ATATG	2	10	261619	261628	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015713	AAAAT	2	10	299748	299757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015713	TTTTA	2	10	307081	307090	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015713	AAATA	2	10	346675	346684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015713	CAAAG	2	10	355363	355372	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015713	TTTAT	2	10	369749	369758	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015713	AGTGA	2	10	369876	369885	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015713	AGATT	2	10	369976	369985	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015713	ATCAA	2	10	371746	371755	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015713	AGTTA	2	10	372473	372482	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015713	GCATG	2	10	373143	373152	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015713	TTCAA	2	10	374424	374433	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015713	ATCCC	2	10	375552	375561	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_015713	ATACA	2	10	377070	377079	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015713	AAAGA	2	10	390175	390184	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015713	AAATG	2	10	395156	395165	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015713	CCTTT	2	10	414965	414974	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015713	AATTT	2	10	419300	419309	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015713	AATTA	2	10	419329	419338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015713	ATTTT	2	10	430232	430241	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015713	AAATA	2	10	430266	430275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015713	AAGAA	2	10	449733	449742	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015713	TAAGT	2	10	461477	461486	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015713	ATTTT	2	10	496771	496780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015713	AAAGG	2	10	502815	502824	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015713	TTTTC	2	10	562143	562152	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015713	GAGAG	2	10	571190	571199	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015713	AAAAT	2	10	578728	578737	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015713	TTTCT	2	10	615689	615698	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015713	CTTTG	2	10	631208	631217	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015713	CAAAA	2	10	633335	633344	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015713	CTTCT	2	10	636774	636783	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_015713	CTTCT	2	10	645005	645014	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015713	TATGA	2	10	646395	646404	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015713	TTTCT	2	10	654978	654987	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015713	ATTAG	2	10	657006	657015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015713	CCCTT	2	10	671234	671243	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_015713	TCCAT	2	10	679822	679831	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_015713	ATTGC	2	10	680165	680174	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015713	AGGTT	2	10	701402	701411	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015713	ATCAA	2	10	702877	702886	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015713	AGTTT	2	10	716900	716909	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015713	TCCAT	2	10	732085	732094	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_015713	ATTGC	2	10	732428	732437	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015713	CTTTT	2	10	738789	738798	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015713	CTTTT	2	10	773053	773062	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015713	GAAAA	2	10	776636	776645	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015713	GCATA	2	10	788827	788836	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015713	TTTCC	2	10	805855	805864	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_015713	CTTTT	2	10	806020	806029	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015713	ATTTT	2	10	806894	806903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015713	ATTGA	2	10	831974	831983	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015713	AAATC	2	10	840102	840111	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015713	GAAGG	2	10	857427	857436	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015713	TGATA	2	10	889062	889071	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015713	TCCTG	2	10	895840	895849	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_015713	GTTTT	2	10	918484	918493	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015713	AGTAT	2	10	941028	941037	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015713	CATTA	2	10	949498	949507	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015713	TATTT	2	10	958177	958186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015713	ATAAA	2	10	996417	996426	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015713	ACCAA	2	10	1002281	1002290	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_015713	ATTTG	2	10	1019037	1019046	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015713	ATTTT	2	10	1042383	1042392	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015713	TCCAT	2	10	1043048	1043057	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_015713	ATTGC	2	10	1043391	1043400	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015713	AAGCA	2	10	1047961	1047970	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015713	ACTAG	2	10	1066708	1066717	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015713	TTTGT	2	10	1087168	1087177	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015713	ATTTT	2	10	1097423	1097432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015713	ATTAG	2	10	1134540	1134549	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015713	TATTT	2	10	1138617	1138626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015713	ATATT	2	10	1153337	1153346	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015713	GTTTA	2	10	1153433	1153442	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015713	AATTT	2	10	1155679	1155688	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015713	TTAAT	2	10	1184739	1184748	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015713	AAACT	2	10	1186311	1186320	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015713	AAAGT	2	10	1254375	1254384	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015713	ATTTT	2	10	1254862	1254871	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015713	TATTT	2	10	1283493	1283502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015713	AGAGA	2	10	1292871	1292880	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015713	ACCAG	2	10	1294008	1294017	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_015713	TCCTT	2	10	1319242	1319251	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_015713	CATAA	2	10	1333162	1333171	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015713	CTAAG	2	10	1346217	1346226	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015713	GAAAA	2	10	1352005	1352014	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015713	TAATA	2	10	1352809	1352818	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015713	ATTAA	2	10	1372277	1372286	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015713	GCCAT	2	10	1378398	1378407	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_015713	ATTTT	2	10	1397772	1397781	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015713	GCAAA	2	10	1397852	1397861	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015713	GAATG	2	10	1416790	1416799	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015713	AACTG	2	10	1421454	1421463	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015713	AAAGC	2	10	1421726	1421735	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015713	TCTCT	2	10	1424000	1424009	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_015713	TAAAA	2	10	1430853	1430862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015713	AATTA	2	10	1430925	1430934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015713	TCAAT	2	10	1435932	1435941	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015713	ATTTA	2	10	1448750	1448759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015713	GAATC	2	10	1463357	1463366	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015713	ATATA	2	10	1472689	1472698	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015713	TATTT	3	15	1520854	1520868	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015713	TCGAA	2	10	1522991	1523000	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015713	CTTGC	2	10	1555621	1555630	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_015713	TGAAT	2	10	1567896	1567905	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015713	ATTTT	2	10	1589829	1589838	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015713	CCCTT	2	10	1599271	1599280	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_015713	AAGAA	2	10	1613245	1613254	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015713	TTTAT	2	10	1648121	1648130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015713	TCTTT	2	10	1658657	1658666	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015713	TACTT	2	10	1668312	1668321	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015713	AATTT	2	10	1679181	1679190	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015713	CTTCT	2	10	1680963	1680972	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_015713	CAAAG	2	10	1684423	1684432	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015713	TGCTA	2	10	1688518	1688527	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015713	TTTTC	2	10	1716378	1716387	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015713	TGCCT	2	10	1733234	1733243	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_015713	ATATT	2	10	1735682	1735691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015713	CAGCT	2	10	1748083	1748092	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_015713	AAATT	2	10	1780752	1780761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015713	TAAAA	2	10	1791190	1791199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_015713	CTAAA	2	10	2397412	2397421	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
190	NC_015713	TAGAA	2	10	2410111	2410120	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_015713	CAAGC	2	10	2465342	2465351	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
198	NC_015713	ATAAG	2	10	2465615	2465624	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
199	NC_015713	CTTTT	2	10	2476605	2476614	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
200	NC_015713	TTTCT	2	10	2488103	2488112	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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202	NC_015713	GAAAA	2	10	2494258	2494267	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.