MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Simkania negevensis Z chromosome gsn.131

Total Repeats: 27817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015713	TTA	2	6	186	191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731897
2	NC_015713	AGA	2	6	235	240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731897
3	NC_015713	ACT	3	9	309	317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731897
4	NC_015713	AAT	2	6	343	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731897
5	NC_015713	ATC	2	6	419	424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731897
6	NC_015713	ATA	2	6	425	430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731897
7	NC_015713	CTA	2	6	443	448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731897
8	NC_015713	TGC	2	6	472	477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731897
9	NC_015713	TGA	2	6	555	560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731897
10	NC_015713	TAC	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731897
11	NC_015713	AAT	2	6	607	612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731897
12	NC_015713	TAT	2	6	618	623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731897
13	NC_015713	AGA	2	6	659	664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731897
14	NC_015713	CTT	2	6	701	706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731897
15	NC_015713	CTT	3	9	724	732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731897
16	NC_015713	AAT	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731897
17	NC_015713	TTC	2	6	756	761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731897
18	NC_015713	TAA	2	6	762	767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731897
19	NC_015713	TAT	2	6	846	851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731897
20	NC_015713	ATG	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731897
21	NC_015713	TCT	2	6	943	948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731897
22	NC_015713	GTT	2	6	1062	1067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731897
23	NC_015713	CAT	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731897
24	NC_015713	AAT	2	6	1327	1332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731897
25	NC_015713	ACT	2	6	1337	1342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731897
26	NC_015713	CTT	2	6	1690	1695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731898
27	NC_015713	GCT	2	6	1892	1897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731898
28	NC_015713	TAT	2	6	1926	1931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731898
29	NC_015713	GCT	2	6	1980	1985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731898
30	NC_015713	GAA	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731898
31	NC_015713	AGA	2	6	2213	2218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731898
32	NC_015713	TCA	2	6	2642	2647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731899
33	NC_015713	AAT	2	6	2696	2701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731899
34	NC_015713	GCT	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731899
35	NC_015713	GAA	2	6	2924	2929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731899
36	NC_015713	AAG	2	6	2985	2990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731899
37	NC_015713	AGC	3	9	3010	3018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731899
38	NC_015713	GAA	2	6	3179	3184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731899
39	NC_015713	ACA	2	6	3195	3200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731899
40	NC_015713	TGA	2	6	3238	3243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731899
41	NC_015713	ATA	2	6	3291	3296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731899
42	NC_015713	CCA	2	6	3367	3372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731899
43	NC_015713	ATG	2	6	3467	3472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731899
44	NC_015713	TCA	2	6	3509	3514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731899
45	NC_015713	TCT	3	9	3587	3595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731899
46	NC_015713	ATG	2	6	3929	3934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731899
47	NC_015713	AAG	2	6	3942	3947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731899
48	NC_015713	CTC	2	6	4032	4037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731899
49	NC_015713	CTG	2	6	4275	4280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731899
50	NC_015713	TGT	2	6	4477	4482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731899
51	NC_015713	ATA	2	6	4650	4655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731899
52	NC_015713	GAT	2	6	4706	4711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731899
53	NC_015713	GAT	2	6	4793	4798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731899
54	NC_015713	CTG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731899
55	NC_015713	ATT	2	6	4883	4888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731899
56	NC_015713	CAT	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731900
57	NC_015713	TGA	2	6	5112	5117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731900
58	NC_015713	AGA	2	6	5283	5288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731900
59	NC_015713	TAT	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731900
60	NC_015713	ATT	2	6	5438	5443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731900
61	NC_015713	TCA	2	6	5556	5561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731900
62	NC_015713	GCC	2	6	5660	5665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338731900
63	NC_015713	GGA	2	6	5683	5688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731900
64	NC_015713	ATG	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731900
65	NC_015713	GCT	2	6	6067	6072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731900
66	NC_015713	CAT	2	6	6082	6087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731900
67	NC_015713	GAA	2	6	6184	6189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731900
68	NC_015713	AGA	2	6	6252	6257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731900
69	NC_015713	CCT	2	6	6259	6264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731900
70	NC_015713	TTG	2	6	6452	6457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731900
71	NC_015713	GAG	2	6	6554	6559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731900
72	NC_015713	AGA	2	6	6666	6671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731900
73	NC_015713	AAG	2	6	6818	6823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731900
74	NC_015713	AAG	2	6	6941	6946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731900
75	NC_015713	TCA	2	6	6975	6980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731900
76	NC_015713	AGC	2	6	7007	7012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731900
77	NC_015713	CTT	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731900
78	NC_015713	AAT	2	6	7155	7160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731900
79	NC_015713	GGA	2	6	7174	7179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731900
80	NC_015713	TCT	3	9	7293	7301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731900
81	NC_015713	GAA	2	6	7333	7338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731900
82	NC_015713	GAA	2	6	7357	7362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731900
83	NC_015713	AGA	2	6	7512	7517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731900
84	NC_015713	CAA	2	6	7575	7580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731900
85	NC_015713	GCA	2	6	7600	7605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731900
86	NC_015713	TGA	2	6	7638	7643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731900
87	NC_015713	TAA	2	6	7747	7752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731901
88	NC_015713	TAT	2	6	7798	7803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731901
89	NC_015713	TGT	2	6	7819	7824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731901
90	NC_015713	ATG	2	6	7835	7840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731901
91	NC_015713	AGC	2	6	7906	7911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731901
92	NC_015713	GGA	2	6	7922	7927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731901
93	NC_015713	GTG	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731901
94	NC_015713	TTA	2	6	7998	8003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731901
95	NC_015713	TTG	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731901
96	NC_015713	AAG	2	6	8188	8193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731902
97	NC_015713	TGC	2	6	8201	8206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731902
98	NC_015713	GAT	2	6	8220	8225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731902
99	NC_015713	TGA	2	6	8357	8362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731902
100	NC_015713	CCA	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731902
101	NC_015713	ATT	2	6	8575	8580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731902
102	NC_015713	AAG	2	6	8590	8595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731902
103	NC_015713	GAA	2	6	8628	8633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731902
104	NC_015713	TTC	2	6	8672	8677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731902
105	NC_015713	TCA	3	9	8714	8722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731902
106	NC_015713	TTA	2	6	8739	8744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731902
107	NC_015713	GAA	2	6	8748	8753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731902
108	NC_015713	AGT	2	6	9887	9892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731903
109	NC_015713	ATG	2	6	9916	9921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731903
110	NC_015713	TTC	2	6	10026	10031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731903
111	NC_015713	GTC	2	6	10090	10095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731903
112	NC_015713	TAA	2	6	10214	10219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731904
113	NC_015713	TGG	2	6	10221	10226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731904
114	NC_015713	TCC	2	6	10256	10261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731904
115	NC_015713	GTT	2	6	10266	10271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731904
116	NC_015713	GAG	2	6	10352	10357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731904
117	NC_015713	ATG	2	6	10461	10466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731905
118	NC_015713	ATA	2	6	10524	10529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731905
119	NC_015713	CAA	2	6	11053	11058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731906
120	NC_015713	ATC	2	6	11063	11068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731906
121	NC_015713	CAA	2	6	11143	11148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731906
122	NC_015713	TTC	2	6	11180	11185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731906
123	NC_015713	CAA	2	6	11206	11211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731906
124	NC_015713	ACA	2	6	11286	11291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731906
125	NC_015713	TGC	2	6	11376	11381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731906
126	NC_015713	GCA	2	6	11412	11417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731906
127	NC_015713	CAG	2	6	11440	11445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731906
128	NC_015713	TGA	3	9	11466	11474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731906
129	NC_015713	GCT	2	6	11499	11504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731906
130	NC_015713	GTT	2	6	11515	11520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731906
131	NC_015713	CTT	2	6	11536	11541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731906
132	NC_015713	GTT	2	6	11734	11739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731906
133	NC_015713	ATT	2	6	11831	11836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731906
134	NC_015713	GTT	2	6	11845	11850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731906
135	NC_015713	TAA	2	6	13001	13006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731907
136	NC_015713	GGA	2	6	13007	13012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731907
137	NC_015713	TCT	2	6	13132	13137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731907
138	NC_015713	TTA	2	6	13208	13213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731907
139	NC_015713	AAT	2	6	13314	13319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731907
140	NC_015713	TCA	2	6	13379	13384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731907
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142	NC_015713	ATA	2	6	13447	13452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731907
143	NC_015713	TAA	2	6	13521	13526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731907
144	NC_015713	GAA	2	6	13538	13543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731907
145	NC_015713	TTG	2	6	13795	13800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731908
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147	NC_015713	CTG	2	6	14034	14039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731909
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151	NC_015713	GTG	2	6	14401	14406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731911
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158	NC_015713	TTG	2	6	14886	14891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731912
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160	NC_015713	CTT	2	6	16167	16172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731913
161	NC_015713	GAG	2	6	16528	16533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731913
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163	NC_015713	TTG	2	6	16917	16922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731914
164	NC_015713	ATC	2	6	16926	16931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731914
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241	NC_015713	GAG	2	6	23465	23470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731918
242	NC_015713	CTC	2	6	23708	23713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731918
243	NC_015713	AGT	2	6	23766	23771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731918
244	NC_015713	CTT	2	6	23854	23859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731918
245	NC_015713	GAG	2	6	23996	24001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731918
246	NC_015713	TCT	2	6	24015	24020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731918
247	NC_015713	TCA	2	6	24114	24119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731918
248	NC_015713	CTT	2	6	24133	24138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731918
249	NC_015713	CTT	2	6	24166	24171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731918
250	NC_015713	TGA	2	6	24202	24207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731918
251	NC_015713	CAG	2	6	24355	24360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731918
252	NC_015713	GTC	2	6	24417	24422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731918
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254	NC_015713	TGG	2	6	24502	24507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731919
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