MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Simkania negevensis Z plasmid pSn

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015710	GCAACA	2	12	80	91	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338731759
2	NC_015710	GTTCCA	2	12	2825	2836	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338731762
3	NC_015710	GATGAA	2	12	6667	6678	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338731766
4	NC_015710	CGCTAT	2	12	12089	12100	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338731776
5	NC_015710	TAGAAG	2	12	13054	13065	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338731777
6	NC_015710	TTTGAA	2	12	22934	22945	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338731788
7	NC_015710	AATTAC	2	12	25458	25469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338731790
8	NC_015710	ACCAGA	2	12	26294	26305	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338731790
9	NC_015710	GACAAC	2	12	27396	27407	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338731790
10	NC_015710	TTATAT	2	12	29605	29616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015710	TGAAAT	2	12	31566	31577	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338731799
12	NC_015710	TTCTTT	2	12	35390	35401	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338731803
13	NC_015710	CATGCA	2	12	36349	36360	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338731804
14	NC_015710	GAAAAG	2	12	42809	42820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731808
15	NC_015710	AGATGA	2	12	44272	44283	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338731810
16	NC_015710	ATTTTG	2	12	45253	45264	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338731811
17	NC_015710	ATTTAC	2	12	45548	45559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338731811
18	NC_015710	AACTTA	2	12	46396	46407	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338731811
19	NC_015710	TGTTTC	2	12	47496	47507	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338731813
20	NC_015710	AAAAGC	2	12	51080	51091	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338731814
21	NC_015710	GGGTTT	2	12	52062	52073	0 %	50 %	50 %	0 %	338731815
22	NC_015710	AGAAGT	2	12	59450	59461	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338731819
23	NC_015710	GTTCCA	2	12	60513	60524	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338731821
24	NC_015710	TCAGTA	2	12	70451	70462	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338731831
25	NC_015710	ACCACA	2	12	73935	73946	50 %	0 %	0 %	50 %	338731833
26	NC_015710	ATATTT	2	12	75060	75071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731835
27	NC_015710	ATACGA	2	12	78377	78388	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338731836
28	NC_015710	AATTTC	2	12	79629	79640	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338731838
29	NC_015710	TGAGGT	2	12	84238	84249	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338731841
30	NC_015710	TTCAAG	2	12	90498	90509	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338731849
31	NC_015710	GTTCTA	2	12	95168	95179	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338731853
32	NC_015710	TTCTTT	2	12	121520	121531	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338731883
33	NC_015710	GCTGTT	2	12	121614	121625	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338731883
34	NC_015710	AGGGTT	2	12	128376	128387	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338731889
35	NC_015710	CTTTAG	2	12	128735	128746	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338731889
36	NC_015710	TTATTT	2	12	129415	129426	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	338731891
37	NC_015710	ATTTTT	2	12	130442	130453	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	338731893

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.