MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Simkania negevensis Z plasmid pSn

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015710	CTCTT	2	10	10365	10374	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015710	TCAAA	2	10	16570	16579	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015710	CTATT	2	10	20566	20575	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015710	CTTCT	2	10	23577	23586	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015710	GCAAT	2	10	24077	24086	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015710	ATGGA	2	10	24420	24429	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015710	ATTAA	2	10	24863	24872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015710	TCAAA	2	10	28274	28283	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015710	ATTTA	2	10	65770	65779	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015710	ATTTC	2	10	72305	72314	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015710	TCCAT	2	10	72493	72502	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015710	ATTGC	2	10	72836	72845	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015710	TTTGT	2	10	80372	80381	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015710	TTTTC	2	10	80438	80447	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015710	GTTAA	2	10	97670	97679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015710	TCCAT	2	10	106336	106345	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_015710	ATTGC	2	10	106679	106688	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015710	TAAGT	2	10	108504	108513	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015710	TTTAT	2	10	127056	127065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015710	TAAAT	2	10	127081	127090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015710	CATCC	2	10	130121	130130	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.