MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Simkania negevensis Z plasmid pSn

Total Repeats: 339

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015710	ATTC	2	8	330	337	25 %	50 %	0 %	25 %	338731759
2	NC_015710	GCAA	2	8	761	768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015710	ATCA	2	8	786	793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015710	TGTT	2	8	1322	1329	0 %	75 %	25 %	0 %	338731761
5	NC_015710	TTGT	2	8	1545	1552	0 %	75 %	25 %	0 %	338731761
6	NC_015710	AGTC	2	8	3484	3491	25 %	25 %	25 %	25 %	338731763
7	NC_015710	GATG	2	8	4167	4174	25 %	25 %	50 %	0 %	338731763
8	NC_015710	TCTT	2	8	4218	4225	0 %	75 %	0 %	25 %	338731763
9	NC_015710	CTAT	2	8	4301	4308	25 %	50 %	0 %	25 %	338731764
10	NC_015710	TTCC	2	8	4551	4558	0 %	50 %	0 %	50 %	338731765
11	NC_015710	ATTC	2	8	4606	4613	25 %	50 %	0 %	25 %	338731765
12	NC_015710	AATC	2	8	4633	4640	50 %	25 %	0 %	25 %	338731765
13	NC_015710	AACG	2	8	4723	4730	50 %	0 %	25 %	25 %	338731765
14	NC_015710	CAAG	2	8	5581	5588	50 %	0 %	25 %	25 %	338731765
15	NC_015710	TCGA	2	8	6218	6225	25 %	25 %	25 %	25 %	338731766
16	NC_015710	GAAG	2	8	6820	6827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015710	ATTT	2	8	6830	6837	25 %	75 %	0 %	0 %	338731767
18	NC_015710	GTAT	2	8	6965	6972	25 %	50 %	25 %	0 %	338731767
19	NC_015710	GTAT	2	8	6998	7005	25 %	50 %	25 %	0 %	338731767
20	NC_015710	GTAT	2	8	7031	7038	25 %	50 %	25 %	0 %	338731767
21	NC_015710	ATAA	2	8	7129	7136	75 %	25 %	0 %	0 %	338731767
22	NC_015710	TAAA	2	8	7508	7515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015710	GAAA	2	8	7968	7975	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015710	CTGC	2	8	8955	8962	0 %	25 %	25 %	50 %	338731771
25	NC_015710	TTCC	2	8	8984	8991	0 %	50 %	0 %	50 %	338731771
26	NC_015710	ATTC	2	8	9039	9046	25 %	50 %	0 %	25 %	338731771
27	NC_015710	AATC	2	8	9066	9073	50 %	25 %	0 %	25 %	338731771
28	NC_015710	AGTT	2	8	10143	10150	25 %	50 %	25 %	0 %	338731771
29	NC_015710	TGGA	2	8	10534	10541	25 %	25 %	50 %	0 %	338731772
30	NC_015710	AAGA	2	8	10549	10556	75 %	0 %	25 %	0 %	338731772
31	NC_015710	TGAA	2	8	11197	11204	50 %	25 %	25 %	0 %	338731773
32	NC_015710	ATTG	2	8	11253	11260	25 %	50 %	25 %	0 %	338731773
33	NC_015710	TGAT	2	8	11359	11366	25 %	50 %	25 %	0 %	338731773
34	NC_015710	TTGG	2	8	12018	12025	0 %	50 %	50 %	0 %	338731776
35	NC_015710	ATAA	2	8	12041	12048	75 %	25 %	0 %	0 %	338731776
36	NC_015710	AGGA	2	8	12235	12242	50 %	0 %	50 %	0 %	338731776
37	NC_015710	GAAT	2	8	13139	13146	50 %	25 %	25 %	0 %	338731777
38	NC_015710	ACAG	2	8	13267	13274	50 %	0 %	25 %	25 %	338731777
39	NC_015710	TTCA	2	8	13467	13474	25 %	50 %	0 %	25 %	338731777
40	NC_015710	CTTG	2	8	14031	14038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015710	CTTT	2	8	14414	14421	0 %	75 %	0 %	25 %	338731779
42	NC_015710	TTTA	2	8	14706	14713	25 %	75 %	0 %	0 %	338731780
43	NC_015710	TTAG	2	8	15079	15086	25 %	50 %	25 %	0 %	338731780
44	NC_015710	TATC	2	8	15617	15624	25 %	50 %	0 %	25 %	338731780
45	NC_015710	TGCA	2	8	15905	15912	25 %	25 %	25 %	25 %	338731780
46	NC_015710	TTTC	2	8	16177	16184	0 %	75 %	0 %	25 %	338731780
47	NC_015710	AGAA	2	8	17763	17770	75 %	0 %	25 %	0 %	338731782
48	NC_015710	TTGG	2	8	17776	17783	0 %	50 %	50 %	0 %	338731782
49	NC_015710	ATTT	2	8	17953	17960	25 %	75 %	0 %	0 %	338731782
50	NC_015710	CTTG	2	8	18004	18011	0 %	50 %	25 %	25 %	338731782
51	NC_015710	TCTA	2	8	18448	18455	25 %	50 %	0 %	25 %	338731782
52	NC_015710	TGAG	2	8	19036	19043	25 %	25 %	50 %	0 %	338731783
53	NC_015710	CAAG	2	8	19197	19204	50 %	0 %	25 %	25 %	338731783
54	NC_015710	TTCA	2	8	19220	19227	25 %	50 %	0 %	25 %	338731783
55	NC_015710	GATA	2	8	19559	19566	50 %	25 %	25 %	0 %	338731783
56	NC_015710	CGAG	2	8	19586	19593	25 %	0 %	50 %	25 %	338731783
57	NC_015710	TACT	2	8	20357	20364	25 %	50 %	0 %	25 %	338731784
58	NC_015710	TAAT	2	8	20723	20730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015710	TATG	2	8	20788	20795	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015710	AGCC	2	8	20831	20838	25 %	0 %	25 %	50 %	338731785
61	NC_015710	TAGA	2	8	21301	21308	50 %	25 %	25 %	0 %	338731785
62	NC_015710	CGTT	2	8	22251	22258	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015710	AGAA	2	8	22332	22339	75 %	0 %	25 %	0 %	338731787
64	NC_015710	GTAA	2	8	22807	22814	50 %	25 %	25 %	0 %	338731788
65	NC_015710	TAGG	2	8	22816	22823	25 %	25 %	50 %	0 %	338731788
66	NC_015710	TGAA	2	8	23016	23023	50 %	25 %	25 %	0 %	338731788
67	NC_015710	GATT	2	8	23291	23298	25 %	50 %	25 %	0 %	338731788
68	NC_015710	AAAC	2	8	23378	23385	75 %	0 %	0 %	25 %	338731788
69	NC_015710	GTTT	2	8	23398	23405	0 %	75 %	25 %	0 %	338731788
70	NC_015710	GGAA	2	8	23945	23952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015710	TTAA	2	8	24554	24561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015710	AGAA	2	8	24608	24615	75 %	0 %	25 %	0 %	338731789
73	NC_015710	CTAC	2	8	24651	24658	25 %	25 %	0 %	50 %	338731789
74	NC_015710	ATTA	2	8	24835	24842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015710	AATC	2	8	25057	25064	50 %	25 %	0 %	25 %	338731790
76	NC_015710	AGGA	2	8	26093	26100	50 %	0 %	50 %	0 %	338731790
77	NC_015710	AAGA	2	8	26803	26810	75 %	0 %	25 %	0 %	338731790
78	NC_015710	AATT	2	8	27220	27227	50 %	50 %	0 %	0 %	338731790
79	NC_015710	TAAT	2	8	27310	27317	50 %	50 %	0 %	0 %	338731790
80	NC_015710	AGAA	2	8	27512	27519	75 %	0 %	25 %	0 %	338731790
81	NC_015710	GGAA	2	8	27877	27884	50 %	0 %	50 %	0 %	338731790
82	NC_015710	ATTA	2	8	28446	28453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015710	ACAT	2	8	28876	28883	50 %	25 %	0 %	25 %	338731794
84	NC_015710	GTTT	2	8	29000	29007	0 %	75 %	25 %	0 %	338731794
85	NC_015710	TGAT	2	8	29354	29361	25 %	50 %	25 %	0 %	338731795
86	NC_015710	TAGA	2	8	29467	29474	50 %	25 %	25 %	0 %	338731795
87	NC_015710	TAGG	2	8	30023	30030	25 %	25 %	50 %	0 %	338731796
88	NC_015710	AGAA	2	8	30186	30193	75 %	0 %	25 %	0 %	338731796
89	NC_015710	AAGG	2	8	30224	30231	50 %	0 %	50 %	0 %	338731796
90	NC_015710	AGTT	2	8	30409	30416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015710	ATTT	2	8	30564	30571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015710	AATG	2	8	31139	31146	50 %	25 %	25 %	0 %	338731798
93	NC_015710	AATT	2	8	31168	31175	50 %	50 %	0 %	0 %	338731798
94	NC_015710	GAAA	2	8	31341	31348	75 %	0 %	25 %	0 %	338731798
95	NC_015710	GAAG	2	8	32445	32452	50 %	0 %	50 %	0 %	338731800
96	NC_015710	TCGA	2	8	33460	33467	25 %	25 %	25 %	25 %	338731800
97	NC_015710	TTTC	2	8	34313	34320	0 %	75 %	0 %	25 %	338731801
98	NC_015710	TCAA	2	8	35361	35368	50 %	25 %	0 %	25 %	338731803
99	NC_015710	CTAT	2	8	35482	35489	25 %	50 %	0 %	25 %	338731803
100	NC_015710	TTAG	2	8	35660	35667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015710	TTGC	2	8	35705	35712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015710	GAAG	2	8	35815	35822	50 %	0 %	50 %	0 %	338731804
103	NC_015710	AGAA	2	8	36003	36010	75 %	0 %	25 %	0 %	338731804
104	NC_015710	AGCA	2	8	36102	36109	50 %	0 %	25 %	25 %	338731804
105	NC_015710	ATCC	2	8	36154	36161	25 %	25 %	0 %	50 %	338731804
106	NC_015710	TTCT	2	8	36502	36509	0 %	75 %	0 %	25 %	338731804
107	NC_015710	AAGA	2	8	37522	37529	75 %	0 %	25 %	0 %	338731804
108	NC_015710	GAAA	2	8	37880	37887	75 %	0 %	25 %	0 %	338731804
109	NC_015710	TCAA	2	8	38009	38016	50 %	25 %	0 %	25 %	338731804
110	NC_015710	TAAA	2	8	38504	38511	75 %	25 %	0 %	0 %	338731804
111	NC_015710	GAAT	2	8	38787	38794	50 %	25 %	25 %	0 %	338731804
112	NC_015710	GCTT	2	8	39125	39132	0 %	50 %	25 %	25 %	338731804
113	NC_015710	GAAA	2	8	40146	40153	75 %	0 %	25 %	0 %	338731804
114	NC_015710	GAAG	2	8	40272	40279	50 %	0 %	50 %	0 %	338731804
115	NC_015710	CATT	2	8	40423	40430	25 %	50 %	0 %	25 %	338731804
116	NC_015710	CAAA	2	8	40467	40474	75 %	0 %	0 %	25 %	338731804
117	NC_015710	TAGA	2	8	41206	41213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015710	ATGA	2	8	41756	41763	50 %	25 %	25 %	0 %	338731806
119	NC_015710	GCAA	2	8	41845	41852	50 %	0 %	25 %	25 %	338731807
120	NC_015710	AAAG	2	8	41947	41954	75 %	0 %	25 %	0 %	338731807
121	NC_015710	AAGA	2	8	42173	42180	75 %	0 %	25 %	0 %	338731808
122	NC_015710	CATA	2	8	42189	42196	50 %	25 %	0 %	25 %	338731808
123	NC_015710	CATG	2	8	42229	42236	25 %	25 %	25 %	25 %	338731808
124	NC_015710	GAAC	2	8	42618	42625	50 %	0 %	25 %	25 %	338731808
125	NC_015710	TCAT	2	8	42677	42684	25 %	50 %	0 %	25 %	338731808
126	NC_015710	AGAA	2	8	42777	42784	75 %	0 %	25 %	0 %	338731808
127	NC_015710	AAGA	2	8	42920	42927	75 %	0 %	25 %	0 %	338731808
128	NC_015710	ATTA	2	8	43285	43292	50 %	50 %	0 %	0 %	338731809
129	NC_015710	AAGC	2	8	43373	43380	50 %	0 %	25 %	25 %	338731810
130	NC_015710	TCCT	2	8	43763	43770	0 %	50 %	0 %	50 %	338731810
131	NC_015710	CTAC	2	8	44081	44088	25 %	25 %	0 %	50 %	338731810
132	NC_015710	CCTG	2	8	44671	44678	0 %	25 %	25 %	50 %	338731810
133	NC_015710	ATAA	2	8	44962	44969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015710	CAAA	2	8	46478	46485	75 %	0 %	0 %	25 %	338731811
135	NC_015710	TCTT	2	8	47382	47389	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015710	TTTA	2	8	47393	47400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015710	ACTA	2	8	47547	47554	50 %	25 %	0 %	25 %	338731813
138	NC_015710	AATG	2	8	47704	47711	50 %	25 %	25 %	0 %	338731813
139	NC_015710	TATC	2	8	47813	47820	25 %	50 %	0 %	25 %	338731813
140	NC_015710	TACA	2	8	47944	47951	50 %	25 %	0 %	25 %	338731813
141	NC_015710	CTTC	2	8	48412	48419	0 %	50 %	0 %	50 %	338731813
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.