MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Simkania negevensis Z plasmid pSn

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015710	GCAA	2	8	761	768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015710	ATCA	2	8	786	793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015710	GAAG	2	8	6820	6827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015710	TAAA	2	8	7508	7515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015710	GAAA	2	8	7968	7975	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015710	CTTG	2	8	14031	14038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015710	TAAT	2	8	20723	20730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015710	TATG	2	8	20788	20795	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015710	CGTT	2	8	22251	22258	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015710	GGAA	2	8	23945	23952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015710	TTAA	2	8	24554	24561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015710	ATTA	2	8	24835	24842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015710	ATTA	2	8	28446	28453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015710	AGTT	2	8	30409	30416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015710	ATTT	2	8	30564	30571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015710	TTAG	2	8	35660	35667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015710	TTGC	2	8	35705	35712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015710	TAGA	2	8	41206	41213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015710	ATAA	2	8	44962	44969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015710	TCTT	2	8	47382	47389	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015710	TTTA	2	8	47393	47400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015710	GTCG	2	8	72291	72298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015710	TTTA	2	8	74185	74192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015710	AAGC	2	8	74211	74218	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015710	AAGC	2	8	74232	74239	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015710	TCAA	2	8	76021	76028	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015710	AATC	2	8	78536	78543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015710	AAGA	2	8	99993	100000	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015710	CTTT	2	8	100237	100244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015710	CGTG	2	8	100691	100698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015710	TCGT	2	8	100712	100719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015710	AAAT	2	8	101374	101381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015710	CTAT	2	8	108000	108007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015710	ATCT	2	8	108212	108219	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015710	CTTT	2	8	108472	108479	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015710	TGTT	2	8	108586	108593	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015710	ACCT	2	8	114328	114335	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015710	TTTG	2	8	116232	116239	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015710	TCTG	2	8	130051	130058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015710	ATCA	2	8	130112	130119	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.