MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 chromosome

Total Repeats: 696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015709	TCAGTG	2	12	161	172	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015709	ATGGTA	2	12	3797	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706996
3	NC_015709	TTAGCT	2	12	4072	4083	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338706996
4	NC_015709	AAGCAA	2	12	4906	4917	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015709	CTTTGA	2	12	5808	5819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338706997
6	NC_015709	ACAATT	2	12	7725	7736	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338706999
7	NC_015709	GCGCAA	2	12	8602	8613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338707000
8	NC_015709	TTTTAT	2	12	12592	12603	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	338707004
9	NC_015709	CTGTCG	2	12	14394	14405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338707005
10	NC_015709	CGGGGG	2	12	16062	16073	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	338707006
11	NC_015709	TACTAA	2	12	22434	22445	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338707011
12	NC_015709	TCTTCA	2	12	23943	23954	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338707013
13	NC_015709	CGGTAA	2	12	25894	25905	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338707015
14	NC_015709	CCCTAG	2	12	28846	28857	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338707017
15	NC_015709	ATAAAA	2	12	43747	43758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015709	TCAATA	2	12	44885	44896	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338707032
17	NC_015709	AGCGGG	2	12	45118	45129	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	338707032
18	NC_015709	CACCCT	2	12	45342	45353	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	338707032
19	NC_015709	TATCAA	2	12	46271	46282	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338707033
20	NC_015709	AAGGAA	2	12	46907	46918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338707034
21	NC_015709	TGCCTT	2	12	47401	47412	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338707034
22	NC_015709	AACAAA	2	12	49729	49740	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	338707037
23	NC_015709	ATACCC	2	12	50129	50140	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338707037
24	NC_015709	CCTGAT	2	12	50800	50811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338707037
25	NC_015709	TCTTGT	2	12	51702	51713	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338707038
26	NC_015709	GTCTTT	2	12	56120	56131	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338707042
27	NC_015709	TTCAGC	2	12	58012	58023	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338707044
28	NC_015709	ATCGAA	2	12	64666	64677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707049
29	NC_015709	TTACGG	2	12	74392	74403	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015709	TATTCC	2	12	77603	77614	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338707064
31	NC_015709	AGCTAA	2	12	78856	78867	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707065
32	NC_015709	TTCTAT	2	12	82752	82763	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338707068
33	NC_015709	TAAAAG	2	12	89241	89252	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338707073
34	NC_015709	GATTCT	2	12	90298	90309	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338707074
35	NC_015709	TCAGGC	2	12	90763	90774	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338707076
36	NC_015709	TGTTCA	2	12	90851	90862	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338707076
37	NC_015709	TGGATG	2	12	93770	93781	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338707079
38	NC_015709	AACCTC	2	12	94987	94998	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338707081
39	NC_015709	TTTTAT	2	12	95478	95489	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	338707082
40	NC_015709	AATATC	2	12	96421	96432	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338707084
41	NC_015709	GTATTT	2	12	110410	110421	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015709	GGCCAA	2	12	118117	118128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338707101
43	NC_015709	GGGAAG	2	12	118338	118349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338707101
44	NC_015709	GCGCTG	2	12	120350	120361	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338707101
45	NC_015709	CTTTCA	2	12	121025	121036	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015709	CAGAAG	2	12	124508	124519	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338707105
47	NC_015709	TCATAA	2	12	129438	129449	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338707109
48	NC_015709	GGGCAG	2	12	137033	137044	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	338707115
49	NC_015709	GATGCG	2	12	137233	137244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338707115
50	NC_015709	ACAAGA	2	12	138620	138631	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338707116
51	NC_015709	TCCCGT	2	12	139109	139120	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338707117
52	NC_015709	GAACAT	2	12	139274	139285	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707117
53	NC_015709	TCTTAT	2	12	139491	139502	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338707118
54	NC_015709	CAGGGG	2	12	139817	139828	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	338707118
55	NC_015709	AAAGAT	2	12	141408	141419	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338707119
56	NC_015709	AGATAA	2	12	141973	141984	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338707120
57	NC_015709	TCGTGT	2	12	143413	143424	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338707120
58	NC_015709	TGATAA	2	12	143817	143828	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338707121
59	NC_015709	GATATT	2	12	146380	146391	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338707121
60	NC_015709	GCAACG	2	12	148531	148542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338707122
61	NC_015709	CTTTCT	2	12	149287	149298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015709	CAAGAC	2	12	158034	158045	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338707131
63	NC_015709	TGGATG	2	12	159520	159531	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338707132
64	NC_015709	AAAATA	2	12	160958	160969	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015709	GAAGGT	2	12	164273	164284	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338707136
66	NC_015709	AGCCGC	2	12	166377	166388	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338707140
67	NC_015709	CGGGTA	2	12	173244	173255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338707144
68	NC_015709	CGCCAC	2	12	175923	175934	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	338707148
69	NC_015709	TAAGAA	2	12	184517	184528	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338707155
70	NC_015709	GTGCTT	2	12	185992	186003	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338707157
71	NC_015709	GGCATT	2	12	196628	196639	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338707168
72	NC_015709	ATTTCT	2	12	198997	199008	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338707169
73	NC_015709	CAATAG	2	12	199265	199276	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707169
74	NC_015709	TAAAAA	2	12	203641	203652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015709	AAAAAT	2	12	204565	204576	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015709	AAAAAT	2	12	214006	214017	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015709	CTTCAT	2	12	214338	214349	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015709	GTATTG	2	12	220117	220128	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338707182
79	NC_015709	AGCCTT	2	12	221495	221506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338707183
80	NC_015709	ATTTTG	2	12	221914	221925	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338707183
81	NC_015709	GAACAA	2	12	223254	223265	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338707183
82	NC_015709	TTTATC	2	12	227969	227980	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338707186
83	NC_015709	GCTCTT	2	12	232558	232569	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338707190
84	NC_015709	GATAAC	2	12	242598	242609	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707198
85	NC_015709	ACCCCT	2	12	246570	246581	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	338707199
86	NC_015709	CAAAAA	2	12	251011	251022	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015709	AGGACG	2	12	252316	252327	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	338707207
88	NC_015709	TTAGAA	2	12	254994	255005	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338707209
89	NC_015709	TTTTTA	2	12	257356	257367	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015709	ACTATC	2	12	262029	262040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338707220
91	NC_015709	ACCTTA	2	12	265345	265356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338707223
92	NC_015709	TTTAAT	2	12	266224	266235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015709	CCTGTT	2	12	267290	267301	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338707224
94	NC_015709	GCAATA	2	12	272211	272222	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707228
95	NC_015709	AATTTA	2	12	276183	276194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015709	GCAACC	2	12	276895	276906	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338707232
97	NC_015709	TAAATC	2	12	282441	282452	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015709	GACATC	2	12	285357	285368	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338707240
99	NC_015709	CCCATC	2	12	286611	286622	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	338707241
100	NC_015709	TCTGGT	2	12	287925	287936	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338707242
101	NC_015709	GTAATG	2	12	290146	290157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338707246
102	NC_015709	TAATTT	2	12	298068	298079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015709	CCGTGA	2	12	303847	303858	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338707259
104	NC_015709	TAGAAA	2	12	305720	305731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015709	ATTTAA	2	12	308381	308392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015709	GCAATA	2	12	308721	308732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707264
107	NC_015709	TTGTAA	2	12	309275	309286	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338707264
108	NC_015709	ATGGCC	2	12	311101	311112	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338707266
109	NC_015709	CTTCGG	2	12	312418	312429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338707268
110	NC_015709	CTTCAG	2	12	312499	312510	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338707268
111	NC_015709	ATACCG	2	12	314659	314670	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338707269
112	NC_015709	AGCCAG	2	12	317982	317993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338707271
113	NC_015709	GCAGCG	2	12	322328	322339	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338707276
114	NC_015709	GCGAAG	2	12	331736	331747	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	338707286
115	NC_015709	TTATGG	2	12	331851	331862	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338707286
116	NC_015709	ATCGCT	2	12	334026	334037	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338707287
117	NC_015709	TATTGG	2	12	334133	334144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338707287
118	NC_015709	TGTTTA	2	12	342936	342947	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338707293
119	NC_015709	TTTCAA	2	12	344888	344899	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338707295
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121	NC_015709	GTTCCG	2	12	358210	358221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338707307
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126	NC_015709	ATAATT	2	12	376024	376035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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226	NC_015709	AAATAT	2	12	631161	631172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
227	NC_015709	ATAGCG	2	12	637778	637789	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338707537
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231	NC_015709	GCTTTT	2	12	652129	652140	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338707551
232	NC_015709	ACCAAC	2	12	652778	652789	50 %	0 %	0 %	50 %	338707552
233	NC_015709	ATCAGA	2	12	653974	653985	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707554
234	NC_015709	TTTTAT	2	12	660526	660537	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_015709	GCAAGC	2	12	663803	663814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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237	NC_015709	TGCTTT	2	12	670728	670739	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338707567
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342	NC_015709	TTAAAA	2	12	942080	942091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_015709	GAAGAC	2	12	943768	943779	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338707820
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454	NC_015709	GCTGAT	2	12	1266554	1266565	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338708066
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462	NC_015709	TATTAA	2	12	1307896	1307907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_015709	ACCGCG	2	12	1309108	1309119	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338708101
464	NC_015709	CTTTAC	2	12	1314418	1314429	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338708107
465	NC_015709	TATTTT	2	12	1321097	1321108	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_015709	GATTAT	2	12	1321589	1321600	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338708112
467	NC_015709	TTGATG	2	12	1326298	1326309	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338708115
468	NC_015709	GATTTT	2	12	1327826	1327837	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338708116
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470	NC_015709	TAGCCT	2	12	1331548	1331559	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338708120
471	NC_015709	GCACCG	2	12	1333018	1333029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338708122
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489	NC_015709	ATTGCC	2	12	1371843	1371854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338708158
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499	NC_015709	TTGCTA	2	12	1406606	1406617	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338708182
500	NC_015709	CGGTAA	2	12	1408968	1408979	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338708183

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