MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 chromosome

Total Repeats: 306

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015709	TATTT	2	10	4797	4806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015709	TATTC	2	10	6964	6973	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015709	TATTT	2	10	7052	7061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015709	GTTAG	2	10	12904	12913	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015709	AGGAT	2	10	33620	33629	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015709	AGGGG	2	10	46721	46730	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015709	AAGGG	2	10	66147	66156	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015709	TTCTT	2	10	73642	73651	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015709	CTATT	2	10	78112	78121	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015709	AATTT	2	10	78142	78151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015709	TAAAA	2	10	84903	84912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015709	AATAG	2	10	85905	85914	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015709	CATGA	2	10	88023	88032	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015709	GGTGT	2	10	107480	107489	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015709	TATTT	2	10	109673	109682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015709	CTATT	2	10	110454	110463	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015709	AGAAA	2	10	113684	113693	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015709	TGTAT	2	10	133645	133654	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015709	GTTAA	2	10	138913	138922	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015709	TTTTA	2	10	155185	155194	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015709	ATATT	2	10	155204	155213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015709	GTTTT	2	10	159285	159294	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015709	AAAAG	2	10	210929	210938	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015709	AACTT	2	10	211519	211528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015709	AAATG	2	10	217366	217375	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015709	TGAAT	2	10	225167	225176	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015709	GAAAA	2	10	228617	228626	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015709	TGAAA	2	10	246949	246958	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015709	ATTGA	2	10	247064	247073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015709	TAATA	2	10	250862	250871	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015709	CTTTT	2	10	254533	254542	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015709	AAAAT	2	10	257409	257418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015709	ATTTT	2	10	257428	257437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015709	CAAAG	2	10	260990	260999	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015709	AATAT	2	10	266302	266311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015709	AGGCA	2	10	269598	269607	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015709	ATTTT	2	10	276118	276127	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015709	CCTTT	2	10	279080	279089	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_015709	ACCCT	2	10	295573	295582	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_015709	ATTCT	2	10	304177	304186	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015709	AAAAT	2	10	305584	305593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015709	TTTAA	2	10	307306	307315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015709	TTTAT	2	10	323290	323299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015709	GAAAG	2	10	323402	323411	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015709	CTTAT	2	10	343117	343126	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015709	GTTAG	2	10	364339	364348	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015709	TTTTA	2	10	376058	376067	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015709	CAAGA	2	10	385587	385596	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015709	TAATA	2	10	391858	391867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015709	ATTTT	2	10	391927	391936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015709	AAACT	2	10	392092	392101	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015709	TTATC	2	10	395368	395377	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015709	AGCAT	2	10	406344	406353	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015709	ATGTT	2	10	421079	421088	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015709	GATCA	2	10	423655	423664	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015709	ATTTT	2	10	426836	426845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015709	ATATT	2	10	428088	428097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015709	CCATT	2	10	428126	428135	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_015709	TATCT	2	10	435787	435796	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015709	CTTTT	2	10	435926	435935	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015709	ATTTT	2	10	438841	438850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015709	AATGA	2	10	441007	441016	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015709	ATGGG	2	10	443629	443638	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015709	TATAA	2	10	446506	446515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015709	TAATA	2	10	448409	448418	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015709	AAATT	2	10	448485	448494	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015709	TTACT	2	10	450169	450178	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015709	GAAAA	2	10	467988	467997	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015709	ATTTT	2	10	481583	481592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015709	AAATT	2	10	482117	482126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015709	ATCTT	2	10	496082	496091	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015709	AAATA	2	10	513359	513368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015709	AAATA	2	10	514053	514062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015709	CTTTT	2	10	537463	537472	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015709	ATCTT	2	10	543391	543400	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015709	TGAAA	2	10	570218	570227	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015709	TTTAA	2	10	570256	570265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015709	TAAAG	2	10	574379	574388	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015709	CATCT	2	10	576926	576935	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_015709	TATAT	2	10	578845	578854	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015709	CGGAT	2	10	613019	613028	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015709	TATAA	2	10	624762	624771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015709	GGAAA	2	10	624958	624967	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015709	TATTT	2	10	631209	631218	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015709	GCGTG	2	10	654971	654980	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_015709	ATAAA	2	10	663915	663924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015709	TATAT	2	10	667828	667837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015709	ACCCT	2	10	694885	694894	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_015709	TCCGA	2	10	695030	695039	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_015709	AATAT	2	10	700719	700728	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015709	ATAAG	2	10	709038	709047	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015709	GAATA	2	10	711418	711427	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015709	TTTGT	2	10	721695	721704	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015709	TTTTA	2	10	732514	732523	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015709	AAAAT	2	10	732535	732544	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015709	AATAA	2	10	743049	743058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015709	TTTAT	2	10	743501	743510	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015709	AAAGA	2	10	752604	752613	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015709	GTCCT	2	10	752662	752671	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_015709	CAAAA	2	10	756785	756794	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015709	TGTTT	2	10	767340	767349	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015709	AAAAG	2	10	772047	772056	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015709	AATAT	2	10	783053	783062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015709	ATTAT	2	10	783276	783285	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015709	ATCTC	2	10	786482	786491	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_015709	CCCTT	2	10	798719	798728	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_015709	TATCG	2	10	809045	809054	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015709	ATGAT	2	10	809065	809074	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015709	TATTT	2	10	829434	829443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015709	TAAAA	2	10	835690	835699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015709	ATCAT	2	10	840495	840504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015709	TCTCT	2	10	854849	854858	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_015709	GCTTT	2	10	860174	860183	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015709	GATAT	2	10	868326	868335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015709	ATAAA	2	10	894720	894729	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015709	TTAAT	2	10	894820	894829	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015709	GAAAT	2	10	894830	894839	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015709	TAAAA	2	10	894894	894903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015709	TATTT	2	10	895290	895299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015709	TATAA	2	10	908793	908802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015709	TAAAT	2	10	913417	913426	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015709	TATAA	2	10	915737	915746	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015709	ATTTT	2	10	923214	923223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015709	CTTTT	2	10	927795	927804	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015709	GGTGC	2	10	937715	937724	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015709	TAAAT	2	10	938355	938364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015709	TCTGA	2	10	952130	952139	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015709	TAAAA	2	10	975735	975744	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015709	GCCCT	2	10	975829	975838	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_015709	AAAAT	2	10	975849	975858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015709	TTAAA	2	10	980000	980009	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015709	TTTTA	2	10	980202	980211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015709	GTAAG	2	10	985882	985891	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015709	ATTTC	2	10	991532	991541	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015709	AAAAG	2	10	997249	997258	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015709	TTATT	2	10	997431	997440	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015709	TAGCT	2	10	998606	998615	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015709	TAAAT	2	10	999096	999105	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015709	GTAAG	2	10	1011482	1011491	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015709	CTTTT	2	10	1020313	1020322	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015709	GGCAA	2	10	1021242	1021251	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015709	TATAA	2	10	1021950	1021959	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015709	AGTAA	2	10	1023917	1023926	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015709	TTTAT	2	10	1027435	1027444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015709	ATTAT	2	10	1041543	1041552	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015709	ATTTT	2	10	1052731	1052740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015709	TCGAT	2	10	1081373	1081382	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_015709	TGCCC	2	10	1081856	1081865	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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288	NC_015709	GGCGG	2	10	1880184	1880193	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
289	NC_015709	AAAAG	2	10	1880277	1880286	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015709	ATTTT	2	10	1880745	1880754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015709	CTTGC	2	10	1884582	1884591	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
292	NC_015709	ATTTT	2	10	1889979	1889988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015709	ATTTT	2	10	1893504	1893513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015709	AATTT	2	10	1901888	1901897	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_015709	TAAAA	2	10	1933605	1933614	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_015709	GTGAT	2	10	1934188	1934197	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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306	NC_015709	AAAAT	2	10	1987467	1987476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.