MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL04

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015705	TCCGCT	2	12	519	530	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338215038
2	NC_015705	GTAAAA	2	12	545	556	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338215038
3	NC_015705	AGAAAC	2	12	4060	4071	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015705	GCCGAT	2	12	4295	4306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015705	AAAAGA	2	12	5824	5835	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338215043
6	NC_015705	AAGAAA	2	12	5978	5989	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338215043
7	NC_015705	CCACGG	2	12	10177	10188	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338215047
8	NC_015705	ATTTTT	2	12	18211	18222	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	338215057
9	NC_015705	GTAAAG	2	12	20672	20683	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015705	CAGCCC	2	12	27029	27040	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	338215064
11	NC_015705	GTTTTG	2	12	31379	31390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215066
12	NC_015705	GTTGCA	2	12	31597	31608	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338215066
13	NC_015705	ATTGAT	2	12	35126	35137	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338215069
14	NC_015705	TATTGC	2	12	38837	38848	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338215075
15	NC_015705	ATTGAA	2	12	41840	41851	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015705	ATAAAC	2	12	42861	42872	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	338215076
17	NC_015705	AAATTC	2	12	42953	42964	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338215076
18	NC_015705	GTGAAT	2	12	43237	43248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.