MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL04

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015705	TTTGG	2	10	1349	1358	0 %	60 %	40 %	0 %	338215038
2	NC_015705	TAATG	2	10	1829	1838	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015705	TGTAT	2	10	3492	3501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015705	ATACA	2	10	3522	3531	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015705	TAAGT	2	10	6040	6049	40 %	40 %	20 %	0 %	338215043
6	NC_015705	GGAAA	2	10	7441	7450	60 %	0 %	40 %	0 %	338215044
7	NC_015705	GCTTC	2	10	8330	8339	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015705	CGAAG	2	10	10091	10100	40 %	0 %	40 %	20 %	338215047
9	NC_015705	GCCCG	2	10	13051	13060	0 %	0 %	40 %	60 %	338215049
10	NC_015705	AAATA	2	10	15027	15036	80 %	20 %	0 %	0 %	338215052
11	NC_015705	ATCTT	2	10	16093	16102	20 %	60 %	0 %	20 %	338215055
12	NC_015705	CTTTT	2	10	18983	18992	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015705	TCCAA	2	10	21079	21088	40 %	20 %	0 %	40 %	338215060
14	NC_015705	TCCGT	2	10	21599	21608	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015705	AAAAG	2	10	22350	22359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015705	TTTTC	2	10	23166	23175	0 %	80 %	0 %	20 %	338215061
17	NC_015705	TTCGT	2	10	27672	27681	0 %	60 %	20 %	20 %	338215064
18	NC_015705	CTTTG	2	10	27738	27747	0 %	60 %	20 %	20 %	338215064
19	NC_015705	AAAAC	2	10	31725	31734	80 %	0 %	0 %	20 %	338215066
20	NC_015705	CTTTG	2	10	35619	35628	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015705	TATTT	2	10	35735	35744	20 %	80 %	0 %	0 %	338215072
22	NC_015705	GTGCG	2	10	36845	36854	0 %	20 %	60 %	20 %	338215072
23	NC_015705	AAAGC	2	10	37688	37697	60 %	0 %	20 %	20 %	338215074
24	NC_015705	TAAAA	2	10	38025	38034	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015705	TGAGG	2	10	40095	40104	20 %	20 %	60 %	0 %	338215075
26	NC_015705	AAGAT	2	10	41940	41949	60 %	20 %	20 %	0 %	338215076
27	NC_015705	TGGTA	2	10	43488	43497	20 %	40 %	40 %	0 %	338215077
28	NC_015705	CTTTT	2	10	44585	44594	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.