MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL04

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015705	TTTGG	2	10	1349	1358	0 %	60 %	40 %	0 %	338215038
2	NC_015705	TAAGT	2	10	6040	6049	40 %	40 %	20 %	0 %	338215043
3	NC_015705	GGAAA	2	10	7441	7450	60 %	0 %	40 %	0 %	338215044
4	NC_015705	CGAAG	2	10	10091	10100	40 %	0 %	40 %	20 %	338215047
5	NC_015705	GCCCG	2	10	13051	13060	0 %	0 %	40 %	60 %	338215049
6	NC_015705	AAATA	2	10	15027	15036	80 %	20 %	0 %	0 %	338215052
7	NC_015705	ATCTT	2	10	16093	16102	20 %	60 %	0 %	20 %	338215055
8	NC_015705	TCCAA	2	10	21079	21088	40 %	20 %	0 %	40 %	338215060
9	NC_015705	TTTTC	2	10	23166	23175	0 %	80 %	0 %	20 %	338215061
10	NC_015705	TTCGT	2	10	27672	27681	0 %	60 %	20 %	20 %	338215064
11	NC_015705	CTTTG	2	10	27738	27747	0 %	60 %	20 %	20 %	338215064
12	NC_015705	AAAAC	2	10	31725	31734	80 %	0 %	0 %	20 %	338215066
13	NC_015705	TATTT	2	10	35735	35744	20 %	80 %	0 %	0 %	338215072
14	NC_015705	GTGCG	2	10	36845	36854	0 %	20 %	60 %	20 %	338215072
15	NC_015705	AAAGC	2	10	37688	37697	60 %	0 %	20 %	20 %	338215074
16	NC_015705	TGAGG	2	10	40095	40104	20 %	20 %	60 %	0 %	338215075
17	NC_015705	AAGAT	2	10	41940	41949	60 %	20 %	20 %	0 %	338215076
18	NC_015705	TGGTA	2	10	43488	43497	20 %	40 %	40 %	0 %	338215077

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.