MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL04

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015705	ATTG	2	8	26	33	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015705	TCAA	2	8	1574	1581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015705	TCCA	2	8	1606	1613	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015705	TTTC	2	8	1696	1703	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015705	GTTT	2	8	1760	1767	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015705	CGTG	2	8	4453	4460	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015705	TTTC	2	8	4607	4614	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015705	ATTC	2	8	5112	5119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015705	CAAC	2	8	6199	6206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015705	ACTG	2	8	6373	6380	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015705	CGTA	2	8	8229	8236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015705	CAGG	2	8	8384	8391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015705	AGGC	2	8	11661	11668	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015705	TCAG	2	8	18631	18638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015705	ACCG	2	8	19089	19096	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015705	ATGA	2	8	20660	20667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015705	CTTT	2	8	22590	22597	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015705	TCTT	2	8	23270	23277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015705	TCAA	2	8	23380	23387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015705	TTTA	2	8	29997	30004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015705	AACT	2	8	35568	35575	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015705	ACTT	2	8	37307	37314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015705	TAAT	2	8	43816	43823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015705	AATA	2	8	44468	44475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015705	TTTC	2	8	44550	44557	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015705	ATAA	2	8	44746	44753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.