MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL04

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015705	GT	3	6	536	541	0 %	50 %	50 %	0 %	338215038
2	NC_015705	TA	3	6	692	697	50 %	50 %	0 %	0 %	338215038
3	NC_015705	TA	3	6	950	955	50 %	50 %	0 %	0 %	338215038
4	NC_015705	TA	3	6	4952	4957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015705	AT	3	6	7142	7147	50 %	50 %	0 %	0 %	338215044
6	NC_015705	AG	3	6	7928	7933	50 %	0 %	50 %	0 %	338215044
7	NC_015705	CA	3	6	9557	9562	50 %	0 %	0 %	50 %	338215046
8	NC_015705	TC	3	6	11635	11640	0 %	50 %	0 %	50 %	338215048
9	NC_015705	CA	3	6	11945	11950	50 %	0 %	0 %	50 %	338215049
10	NC_015705	CT	3	6	12484	12489	0 %	50 %	0 %	50 %	338215049
11	NC_015705	AT	3	6	15020	15025	50 %	50 %	0 %	0 %	338215052
12	NC_015705	TG	3	6	15403	15408	0 %	50 %	50 %	0 %	338215054
13	NC_015705	CG	3	6	17195	17200	0 %	0 %	50 %	50 %	338215057
14	NC_015705	GT	3	6	18184	18189	0 %	50 %	50 %	0 %	338215057
15	NC_015705	GA	3	6	20866	20871	50 %	0 %	50 %	0 %	338215060
16	NC_015705	AG	3	6	21239	21244	50 %	0 %	50 %	0 %	338215060
17	NC_015705	GA	3	6	21676	21681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015705	TG	3	6	23057	23062	0 %	50 %	50 %	0 %	338215061
19	NC_015705	AT	3	6	23192	23197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015705	GC	3	6	25102	25107	0 %	0 %	50 %	50 %	338215063
21	NC_015705	TC	3	6	26789	26794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015705	TA	3	6	30550	30555	50 %	50 %	0 %	0 %	338215065
23	NC_015705	AT	3	6	31749	31754	50 %	50 %	0 %	0 %	338215066
24	NC_015705	CT	3	6	33303	33308	0 %	50 %	0 %	50 %	338215067
25	NC_015705	AT	3	6	33321	33326	50 %	50 %	0 %	0 %	338215067
26	NC_015705	TC	3	6	35375	35380	0 %	50 %	0 %	50 %	338215070
27	NC_015705	TG	3	6	35471	35476	0 %	50 %	50 %	0 %	338215071
28	NC_015705	AC	3	6	35593	35598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015705	AT	5	10	35700	35709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015705	GT	3	6	36449	36454	0 %	50 %	50 %	0 %	338215072
31	NC_015705	TA	3	6	37077	37082	50 %	50 %	0 %	0 %	338215072
32	NC_015705	TG	3	6	37536	37541	0 %	50 %	50 %	0 %	338215073
33	NC_015705	CA	3	6	42226	42231	50 %	0 %	0 %	50 %	338215076
34	NC_015705	GA	3	6	43124	43129	50 %	0 %	50 %	0 %	338215076

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.