MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL04

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015705	T	6	6	65	70	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015705	A	6	6	160	165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015705	T	7	7	487	493	0 %	100 %	0 %	0 %	338215038
4	NC_015705	A	6	6	977	982	100 %	0 %	0 %	0 %	338215038
5	NC_015705	T	6	6	1125	1130	0 %	100 %	0 %	0 %	338215038
6	NC_015705	T	6	6	1528	1533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015705	A	6	6	1718	1723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015705	A	6	6	1885	1890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015705	T	6	6	1958	1963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015705	G	7	7	2157	2163	0 %	0 %	100 %	0 %	338215039
11	NC_015705	A	7	7	2325	2331	100 %	0 %	0 %	0 %	338215039
12	NC_015705	A	6	6	2417	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	338215039
13	NC_015705	T	6	6	2853	2858	0 %	100 %	0 %	0 %	338215039
14	NC_015705	A	8	8	3299	3306	100 %	0 %	0 %	0 %	338215040
15	NC_015705	T	6	6	4316	4321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015705	A	7	7	4441	4447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015705	A	6	6	4997	5002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015705	A	6	6	5094	5099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015705	T	6	6	5381	5386	0 %	100 %	0 %	0 %	338215042
20	NC_015705	A	7	7	5987	5993	100 %	0 %	0 %	0 %	338215043
21	NC_015705	T	6	6	6193	6198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015705	A	6	6	6245	6250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015705	T	6	6	6278	6283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015705	A	6	6	6294	6299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015705	A	7	7	6301	6307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015705	A	7	7	6621	6627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015705	T	6	6	6642	6647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015705	A	7	7	6707	6713	100 %	0 %	0 %	0 %	338215044
29	NC_015705	A	6	6	6752	6757	100 %	0 %	0 %	0 %	338215044
30	NC_015705	A	6	6	7058	7063	100 %	0 %	0 %	0 %	338215044
31	NC_015705	A	6	6	7626	7631	100 %	0 %	0 %	0 %	338215044
32	NC_015705	A	6	6	7633	7638	100 %	0 %	0 %	0 %	338215044
33	NC_015705	T	6	6	8067	8072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015705	T	6	6	8346	8351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015705	A	6	6	8769	8774	100 %	0 %	0 %	0 %	338215045
36	NC_015705	A	7	7	8975	8981	100 %	0 %	0 %	0 %	338215045
37	NC_015705	A	6	6	9991	9996	100 %	0 %	0 %	0 %	338215047
38	NC_015705	T	6	6	10030	10035	0 %	100 %	0 %	0 %	338215047
39	NC_015705	A	6	6	10048	10053	100 %	0 %	0 %	0 %	338215047
40	NC_015705	A	6	6	10204	10209	100 %	0 %	0 %	0 %	338215047
41	NC_015705	A	6	6	10685	10690	100 %	0 %	0 %	0 %	338215048
42	NC_015705	T	6	6	11190	11195	0 %	100 %	0 %	0 %	338215048
43	NC_015705	A	6	6	11349	11354	100 %	0 %	0 %	0 %	338215048
44	NC_015705	C	6	6	11409	11414	0 %	0 %	0 %	100 %	338215048
45	NC_015705	A	7	7	11508	11514	100 %	0 %	0 %	0 %	338215048
46	NC_015705	T	6	6	12438	12443	0 %	100 %	0 %	0 %	338215049
47	NC_015705	T	6	6	12894	12899	0 %	100 %	0 %	0 %	338215049
48	NC_015705	A	6	6	13384	13389	100 %	0 %	0 %	0 %	338215049
49	NC_015705	T	6	6	14343	14348	0 %	100 %	0 %	0 %	338215051
50	NC_015705	A	6	6	14877	14882	100 %	0 %	0 %	0 %	338215051
51	NC_015705	T	7	7	14887	14893	0 %	100 %	0 %	0 %	338215051
52	NC_015705	A	6	6	15010	15015	100 %	0 %	0 %	0 %	338215052
53	NC_015705	T	6	6	15113	15118	0 %	100 %	0 %	0 %	338215052
54	NC_015705	A	6	6	15261	15266	100 %	0 %	0 %	0 %	338215053
55	NC_015705	A	6	6	15602	15607	100 %	0 %	0 %	0 %	338215054
56	NC_015705	T	7	7	15712	15718	0 %	100 %	0 %	0 %	338215054
57	NC_015705	A	6	6	15782	15787	100 %	0 %	0 %	0 %	338215054
58	NC_015705	T	6	6	15940	15945	0 %	100 %	0 %	0 %	338215054
59	NC_015705	T	6	6	16239	16244	0 %	100 %	0 %	0 %	338215055
60	NC_015705	A	6	6	16545	16550	100 %	0 %	0 %	0 %	338215055
61	NC_015705	A	7	7	16859	16865	100 %	0 %	0 %	0 %	338215056
62	NC_015705	A	6	6	17024	17029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015705	T	7	7	17939	17945	0 %	100 %	0 %	0 %	338215057
64	NC_015705	A	6	6	18163	18168	100 %	0 %	0 %	0 %	338215057
65	NC_015705	T	7	7	18517	18523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015705	A	6	6	18618	18623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015705	T	8	8	18685	18692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015705	A	7	7	18804	18810	100 %	0 %	0 %	0 %	338215058
69	NC_015705	T	6	6	18929	18934	0 %	100 %	0 %	0 %	338215058
70	NC_015705	A	8	8	19049	19056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015705	A	6	6	19160	19165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015705	C	6	6	19286	19291	0 %	0 %	0 %	100 %	338215059
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74	NC_015705	T	6	6	19398	19403	0 %	100 %	0 %	0 %	338215059
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79	NC_015705	A	6	6	21025	21030	100 %	0 %	0 %	0 %	338215060
80	NC_015705	T	6	6	21132	21137	0 %	100 %	0 %	0 %	338215060
81	NC_015705	A	6	6	21186	21191	100 %	0 %	0 %	0 %	338215060
82	NC_015705	T	6	6	21642	21647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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85	NC_015705	A	6	6	22470	22475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015705	T	6	6	22552	22557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015705	T	6	6	22723	22728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015705	T	8	8	22778	22785	0 %	100 %	0 %	0 %	338215061
89	NC_015705	A	6	6	23238	23243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015705	A	6	6	23370	23375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015705	A	6	6	24162	24167	100 %	0 %	0 %	0 %	338215062
92	NC_015705	A	6	6	25474	25479	100 %	0 %	0 %	0 %	338215063
93	NC_015705	C	6	6	25541	25546	0 %	0 %	0 %	100 %	338215063
94	NC_015705	A	6	6	26048	26053	100 %	0 %	0 %	0 %	338215063
95	NC_015705	A	7	7	26131	26137	100 %	0 %	0 %	0 %	338215063
96	NC_015705	A	7	7	26847	26853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015705	T	6	6	27562	27567	0 %	100 %	0 %	0 %	338215064
98	NC_015705	T	6	6	27905	27910	0 %	100 %	0 %	0 %	338215064
99	NC_015705	A	6	6	27956	27961	100 %	0 %	0 %	0 %	338215064
100	NC_015705	A	6	6	28213	28218	100 %	0 %	0 %	0 %	338215064
101	NC_015705	T	6	6	28495	28500	0 %	100 %	0 %	0 %	338215064
102	NC_015705	T	8	8	29792	29799	0 %	100 %	0 %	0 %	338215064
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109	NC_015705	T	6	6	32464	32469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015705	T	6	6	32876	32881	0 %	100 %	0 %	0 %	338215067
111	NC_015705	A	6	6	33014	33019	100 %	0 %	0 %	0 %	338215067
112	NC_015705	A	7	7	33355	33361	100 %	0 %	0 %	0 %	338215067
113	NC_015705	T	8	8	33471	33478	0 %	100 %	0 %	0 %	338215067
114	NC_015705	A	6	6	33654	33659	100 %	0 %	0 %	0 %	338215068
115	NC_015705	T	6	6	34049	34054	0 %	100 %	0 %	0 %	338215068
116	NC_015705	A	6	6	34097	34102	100 %	0 %	0 %	0 %	338215068
117	NC_015705	A	6	6	34129	34134	100 %	0 %	0 %	0 %	338215068
118	NC_015705	A	7	7	34283	34289	100 %	0 %	0 %	0 %	338215069
119	NC_015705	A	6	6	34671	34676	100 %	0 %	0 %	0 %	338215069
120	NC_015705	A	6	6	34758	34763	100 %	0 %	0 %	0 %	338215069
121	NC_015705	T	6	6	34790	34795	0 %	100 %	0 %	0 %	338215069
122	NC_015705	A	9	9	34989	34997	100 %	0 %	0 %	0 %	338215069
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124	NC_015705	C	8	8	35380	35387	0 %	0 %	0 %	100 %	338215070
125	NC_015705	T	6	6	35406	35411	0 %	100 %	0 %	0 %	338215070
126	NC_015705	T	7	7	35493	35499	0 %	100 %	0 %	0 %	338215071
127	NC_015705	T	6	6	35586	35591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015705	T	7	7	36066	36072	0 %	100 %	0 %	0 %	338215072
129	NC_015705	A	6	6	36140	36145	100 %	0 %	0 %	0 %	338215072
130	NC_015705	A	6	6	36355	36360	100 %	0 %	0 %	0 %	338215072
131	NC_015705	T	7	7	36922	36928	0 %	100 %	0 %	0 %	338215072
132	NC_015705	A	6	6	37177	37182	100 %	0 %	0 %	0 %	338215072
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135	NC_015705	A	6	6	37994	37999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_015705	A	6	6	40294	40299	100 %	0 %	0 %	0 %	338215075
139	NC_015705	T	6	6	42888	42893	0 %	100 %	0 %	0 %	338215076
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142	NC_015705	T	6	6	43733	43738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015705	A	6	6	44529	44534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.