MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015704	TGATGT	2	12	549	560	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338215081
2	NC_015704	ATTATG	2	12	5063	5074	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338215088
3	NC_015704	TTTAAC	2	12	6250	6261	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338215089
4	NC_015704	ACTGAA	2	12	9837	9848	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338215093
5	NC_015704	AACATC	2	12	10874	10885	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	338215094
6	NC_015704	ATTTGA	2	12	22877	22888	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338215107
7	NC_015704	AGCCAA	2	12	29738	29749	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338215113
8	NC_015704	GCTTGG	2	12	31921	31932	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338215115
9	NC_015704	ACCCGC	2	12	35477	35488	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	338215117
10	NC_015704	TCTCCA	2	12	35547	35558	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338215117
11	NC_015704	GTGGGC	2	12	37486	37497	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	338215118
12	NC_015704	TTCGGG	2	12	38157	38168	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338215118
13	NC_015704	TGCCAA	2	12	41024	41035	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338215119
14	NC_015704	TTTTTG	2	12	42198	42209	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	338215120
15	NC_015704	AATAAA	2	12	42805	42816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	338215121
16	NC_015704	ATTTTG	2	12	43280	43291	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338215121
17	NC_015704	GCCGTA	2	12	45255	45266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338215122
18	NC_015704	ATACTC	2	12	46421	46432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215122
19	NC_015704	ATGACC	2	12	49729	49740	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338215124
20	NC_015704	CCGTTT	2	12	49963	49974	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338215124
21	NC_015704	TACTTT	2	12	60288	60299	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338215138
22	NC_015704	ATCTAA	2	12	62137	62148	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338215139
23	NC_015704	GGCTTT	2	12	62155	62166	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338215139
24	NC_015704	GCCACC	2	12	63114	63125	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	338215140
25	NC_015704	CAGCAT	2	12	65046	65057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338215141
26	NC_015704	TGACAA	2	12	66979	66990	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338215142
27	NC_015704	GATGGT	2	12	70282	70293	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338215146
28	NC_015704	GATTGA	2	12	73730	73741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215151
29	NC_015704	TGGCTT	2	12	74107	74118	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338215152
30	NC_015704	TGGTAC	2	12	75146	75157	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338215153
31	NC_015704	AATAAA	2	12	76059	76070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	338215155
32	NC_015704	TATTTT	2	12	77146	77157	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	338215156
33	NC_015704	GTCTTT	2	12	82182	82193	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338215160
34	NC_015704	CCCCTG	2	12	85802	85813	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	338215161
35	NC_015704	TTATTT	2	12	88521	88532	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	338215164

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.