MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015704	CTTTT	2	10	653	662	0 %	80 %	0 %	20 %	338215081
2	NC_015704	TTTTG	2	10	906	915	0 %	80 %	20 %	0 %	338215082
3	NC_015704	GTTTT	2	10	1017	1026	0 %	80 %	20 %	0 %	338215082
4	NC_015704	AGAAA	2	10	1309	1318	80 %	0 %	20 %	0 %	338215082
5	NC_015704	TGAAA	2	10	3226	3235	60 %	20 %	20 %	0 %	338215088
6	NC_015704	ATACG	2	10	3268	3277	40 %	20 %	20 %	20 %	338215088
7	NC_015704	TCGAA	2	10	4433	4442	40 %	20 %	20 %	20 %	338215088
8	NC_015704	TGAAA	2	10	6414	6423	60 %	20 %	20 %	0 %	338215089
9	NC_015704	TTGGT	2	10	7309	7318	0 %	60 %	40 %	0 %	338215090
10	NC_015704	CAACG	2	10	9337	9346	40 %	0 %	20 %	40 %	338215093
11	NC_015704	TTACC	2	10	10036	10045	20 %	40 %	0 %	40 %	338215093
12	NC_015704	CCAAT	2	10	10560	10569	40 %	20 %	0 %	40 %	338215094
13	NC_015704	TCATT	2	10	10947	10956	20 %	60 %	0 %	20 %	338215094
14	NC_015704	GCTAC	2	10	18809	18818	20 %	20 %	20 %	40 %	338215100
15	NC_015704	CATTT	2	10	21891	21900	20 %	60 %	0 %	20 %	338215105
16	NC_015704	TCCTA	2	10	21975	21984	20 %	40 %	0 %	40 %	338215105
17	NC_015704	GCCAC	2	10	23308	23317	20 %	0 %	20 %	60 %	338215108
18	NC_015704	GAAAA	2	10	23558	23567	80 %	0 %	20 %	0 %	338215108
19	NC_015704	GTTTT	2	10	25707	25716	0 %	80 %	20 %	0 %	338215110
20	NC_015704	GCAAA	2	10	28245	28254	60 %	0 %	20 %	20 %	338215112
21	NC_015704	TGATT	2	10	29318	29327	20 %	60 %	20 %	0 %	338215113
22	NC_015704	AATTC	2	10	31963	31972	40 %	40 %	0 %	20 %	338215115
23	NC_015704	TTTCG	2	10	32049	32058	0 %	60 %	20 %	20 %	338215115
24	NC_015704	ATAAA	2	10	35688	35697	80 %	20 %	0 %	0 %	338215117
25	NC_015704	GGGGA	2	10	36286	36295	20 %	0 %	80 %	0 %	338215117
26	NC_015704	ATTGA	2	10	36613	36622	40 %	40 %	20 %	0 %	338215117
27	NC_015704	AGTTG	2	10	36737	36746	20 %	40 %	40 %	0 %	338215118
28	NC_015704	TTTTA	2	10	43057	43066	20 %	80 %	0 %	0 %	338215121
29	NC_015704	TTTTC	2	10	43626	43635	0 %	80 %	0 %	20 %	338215121
30	NC_015704	GCGGT	2	10	49630	49639	0 %	20 %	60 %	20 %	338215124
31	NC_015704	ACCGT	2	10	50071	50080	20 %	20 %	20 %	40 %	338215124
32	NC_015704	TTCGG	2	10	51116	51125	0 %	40 %	40 %	20 %	338215125
33	NC_015704	AAAAT	2	10	51252	51261	80 %	20 %	0 %	0 %	338215125
34	NC_015704	GAATT	2	10	51419	51428	40 %	40 %	20 %	0 %	338215125
35	NC_015704	TCAAT	2	10	52319	52328	40 %	40 %	0 %	20 %	338215127
36	NC_015704	GCATC	2	10	52859	52868	20 %	20 %	20 %	40 %	338215128
37	NC_015704	GCTAT	2	10	53555	53564	20 %	40 %	20 %	20 %	338215129
38	NC_015704	CTTGC	2	10	54445	54454	0 %	40 %	20 %	40 %	338215129
39	NC_015704	GTTTT	2	10	54610	54619	0 %	80 %	20 %	0 %	338215130
40	NC_015704	TTTTG	2	10	57037	57046	0 %	80 %	20 %	0 %	338215134
41	NC_015704	ACAGG	2	10	61135	61144	40 %	0 %	40 %	20 %	338215138
42	NC_015704	ACAGG	2	10	61291	61300	40 %	0 %	40 %	20 %	338215138
43	NC_015704	CACTC	2	10	63316	63325	20 %	20 %	0 %	60 %	338215140
44	NC_015704	AATAA	2	10	63326	63335	80 %	20 %	0 %	0 %	338215140
45	NC_015704	AGTAC	2	10	63423	63432	40 %	20 %	20 %	20 %	338215140
46	NC_015704	GATTG	2	10	64346	64355	20 %	40 %	40 %	0 %	338215140
47	NC_015704	AATTT	2	10	64629	64638	40 %	60 %	0 %	0 %	338215140
48	NC_015704	TTGAT	2	10	65372	65381	20 %	60 %	20 %	0 %	338215141
49	NC_015704	CTGCC	2	10	68141	68150	0 %	20 %	20 %	60 %	338215143
50	NC_015704	AATCA	2	10	69255	69264	60 %	20 %	0 %	20 %	338215145
51	NC_015704	TGATT	2	10	71550	71559	20 %	60 %	20 %	0 %	338215148
52	NC_015704	TGGCT	2	10	71951	71960	0 %	40 %	40 %	20 %	338215149
53	NC_015704	CTTGT	2	10	72063	72072	0 %	60 %	20 %	20 %	338215149
54	NC_015704	TACCA	2	10	75320	75329	40 %	20 %	0 %	40 %	338215154
55	NC_015704	TATTT	2	10	76807	76816	20 %	80 %	0 %	0 %	338215156
56	NC_015704	ATACC	2	10	79664	79673	40 %	20 %	0 %	40 %	338215159
57	NC_015704	ACCCT	2	10	80360	80369	20 %	20 %	0 %	60 %	338215160
58	NC_015704	TTCCT	2	10	80952	80961	0 %	60 %	0 %	40 %	338215160
59	NC_015704	ATTTC	2	10	81277	81286	20 %	60 %	0 %	20 %	338215160
60	NC_015704	TTTTC	2	10	81531	81540	0 %	80 %	0 %	20 %	338215160
61	NC_015704	GTTTG	2	10	81617	81626	0 %	60 %	40 %	0 %	338215160
62	NC_015704	TGATT	2	10	81935	81944	20 %	60 %	20 %	0 %	338215160
63	NC_015704	TTTCA	2	10	82770	82779	20 %	60 %	0 %	20 %	338215160
64	NC_015704	TGAGG	2	10	82916	82925	20 %	20 %	60 %	0 %	338215160
65	NC_015704	CGAAC	2	10	84520	84529	40 %	0 %	20 %	40 %	338215160
66	NC_015704	GCAAA	2	10	85274	85283	60 %	0 %	20 %	20 %	338215160
67	NC_015704	TTTTC	2	10	86140	86149	0 %	80 %	0 %	20 %	338215162
68	NC_015704	GATTT	2	10	90159	90168	20 %	60 %	20 %	0 %	338215167
69	NC_015704	GATTA	2	10	90240	90249	40 %	40 %	20 %	0 %	338215167
70	NC_015704	CTAAA	2	10	92110	92119	60 %	20 %	0 %	20 %	338215169

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.