MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015704	ATCA	2	8	520	527	50 %	25 %	0 %	25 %	338215081
2	NC_015704	GTTT	2	8	780	787	0 %	75 %	25 %	0 %	338215082
3	NC_015704	GGTA	2	8	1089	1096	25 %	25 %	50 %	0 %	338215082
4	NC_015704	CAAG	2	8	1232	1239	50 %	0 %	25 %	25 %	338215082
5	NC_015704	TAAA	2	8	1552	1559	75 %	25 %	0 %	0 %	338215083
6	NC_015704	ATTT	2	8	1601	1608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015704	AAGG	2	8	1656	1663	50 %	0 %	50 %	0 %	338215084
8	NC_015704	AATG	2	8	2020	2027	50 %	25 %	25 %	0 %	338215085
9	NC_015704	GGTG	2	8	2244	2251	0 %	25 %	75 %	0 %	338215085
10	NC_015704	ATTC	2	8	2369	2376	25 %	50 %	0 %	25 %	338215086
11	NC_015704	TTTG	2	8	2508	2515	0 %	75 %	25 %	0 %	338215086
12	NC_015704	TGGG	2	8	2552	2559	0 %	25 %	75 %	0 %	338215086
13	NC_015704	GCAG	2	8	2955	2962	25 %	0 %	50 %	25 %	338215087
14	NC_015704	ACGA	2	8	3420	3427	50 %	0 %	25 %	25 %	338215088
15	NC_015704	TTCG	2	8	3712	3719	0 %	50 %	25 %	25 %	338215088
16	NC_015704	AAAT	2	8	4846	4853	75 %	25 %	0 %	0 %	338215088
17	NC_015704	GAAC	2	8	5606	5613	50 %	0 %	25 %	25 %	338215088
18	NC_015704	ATGA	2	8	6049	6056	50 %	25 %	25 %	0 %	338215089
19	NC_015704	GGCA	2	8	6162	6169	25 %	0 %	50 %	25 %	338215089
20	NC_015704	ACCG	2	8	6464	6471	25 %	0 %	25 %	50 %	338215089
21	NC_015704	GATT	2	8	6814	6821	25 %	50 %	25 %	0 %	338215090
22	NC_015704	GTAG	2	8	8806	8813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015704	ATGA	2	8	8985	8992	50 %	25 %	25 %	0 %	338215093
24	NC_015704	TTGC	2	8	9091	9098	0 %	50 %	25 %	25 %	338215093
25	NC_015704	CCCG	2	8	9188	9195	0 %	0 %	25 %	75 %	338215093
26	NC_015704	GAAT	2	8	9356	9363	50 %	25 %	25 %	0 %	338215093
27	NC_015704	GTGG	2	8	9639	9646	0 %	25 %	75 %	0 %	338215093
28	NC_015704	CGAA	2	8	9909	9916	50 %	0 %	25 %	25 %	338215093
29	NC_015704	TGGA	2	8	10162	10169	25 %	25 %	50 %	0 %	338215093
30	NC_015704	TCTT	2	8	10260	10267	0 %	75 %	0 %	25 %	338215093
31	NC_015704	AGAA	2	8	10539	10546	75 %	0 %	25 %	0 %	338215094
32	NC_015704	ATTT	2	8	11105	11112	25 %	75 %	0 %	0 %	338215094
33	NC_015704	GATT	2	8	11140	11147	25 %	50 %	25 %	0 %	338215094
34	NC_015704	CAAC	2	8	11694	11701	50 %	0 %	0 %	50 %	338215095
35	NC_015704	AAAT	2	8	11898	11905	75 %	25 %	0 %	0 %	338215095
36	NC_015704	ATCA	2	8	12012	12019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015704	TTGG	2	8	12557	12564	0 %	50 %	50 %	0 %	338215096
38	NC_015704	AGGT	2	8	13618	13625	25 %	25 %	50 %	0 %	338215096
39	NC_015704	GAAA	2	8	14067	14074	75 %	0 %	25 %	0 %	338215097
40	NC_015704	ACTT	2	8	14693	14700	25 %	50 %	0 %	25 %	338215098
41	NC_015704	AATA	2	8	14717	14724	75 %	25 %	0 %	0 %	338215098
42	NC_015704	GATG	2	8	14764	14771	25 %	25 %	50 %	0 %	338215098
43	NC_015704	ATCT	2	8	14838	14845	25 %	50 %	0 %	25 %	338215098
44	NC_015704	ATAA	2	8	15069	15076	75 %	25 %	0 %	0 %	338215098
45	NC_015704	TATT	2	8	15161	15168	25 %	75 %	0 %	0 %	338215098
46	NC_015704	ATTG	2	8	15301	15308	25 %	50 %	25 %	0 %	338215098
47	NC_015704	TAAC	2	8	15347	15354	50 %	25 %	0 %	25 %	338215098
48	NC_015704	CAAA	2	8	15535	15542	75 %	0 %	0 %	25 %	338215098
49	NC_015704	AAAT	2	8	16557	16564	75 %	25 %	0 %	0 %	338215098
50	NC_015704	AAGG	2	8	16890	16897	50 %	0 %	50 %	0 %	338215098
51	NC_015704	TTTC	2	8	17123	17130	0 %	75 %	0 %	25 %	338215098
52	NC_015704	TGGA	2	8	17285	17292	25 %	25 %	50 %	0 %	338215099
53	NC_015704	CTGT	2	8	17484	17491	0 %	50 %	25 %	25 %	338215099
54	NC_015704	TTTC	2	8	17737	17744	0 %	75 %	0 %	25 %	338215099
55	NC_015704	GTTT	2	8	18134	18141	0 %	75 %	25 %	0 %	338215100
56	NC_015704	GGCG	2	8	18310	18317	0 %	0 %	75 %	25 %	338215100
57	NC_015704	CAAC	2	8	18402	18409	50 %	0 %	0 %	50 %	338215100
58	NC_015704	TACG	2	8	18449	18456	25 %	25 %	25 %	25 %	338215100
59	NC_015704	CTCA	2	8	18934	18941	25 %	25 %	0 %	50 %	338215100
60	NC_015704	AATC	2	8	19110	19117	50 %	25 %	0 %	25 %	338215101
61	NC_015704	CAAA	2	8	19338	19345	75 %	0 %	0 %	25 %	338215102
62	NC_015704	ATTT	3	12	19536	19547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015704	AATC	2	8	20056	20063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015704	GTTG	2	8	20290	20297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015704	TAAA	2	8	21189	21196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015704	CTTA	2	8	21317	21324	25 %	50 %	0 %	25 %	338215105
67	NC_015704	TGAT	2	8	21353	21360	25 %	50 %	25 %	0 %	338215105
68	NC_015704	AATA	2	8	21814	21821	75 %	25 %	0 %	0 %	338215105
69	NC_015704	CAAA	2	8	22110	22117	75 %	0 %	0 %	25 %	338215106
70	NC_015704	TTCG	2	8	22289	22296	0 %	50 %	25 %	25 %	338215106
71	NC_015704	CAAG	2	8	22601	22608	50 %	0 %	25 %	25 %	338215107
72	NC_015704	GTTC	2	8	22612	22619	0 %	50 %	25 %	25 %	338215107
73	NC_015704	ACCA	2	8	23157	23164	50 %	0 %	0 %	50 %	338215108
74	NC_015704	TGAT	2	8	23614	23621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015704	CAAC	2	8	23785	23792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015704	TCAA	2	8	23942	23949	50 %	25 %	0 %	25 %	338215109
77	NC_015704	CTTT	2	8	24323	24330	0 %	75 %	0 %	25 %	338215109
78	NC_015704	CCTT	2	8	24457	24464	0 %	50 %	0 %	50 %	338215109
79	NC_015704	CTGG	2	8	25283	25290	0 %	25 %	50 %	25 %	338215110
80	NC_015704	TCAA	2	8	25373	25380	50 %	25 %	0 %	25 %	338215110
81	NC_015704	GCTT	2	8	25538	25545	0 %	50 %	25 %	25 %	338215110
82	NC_015704	AGTG	2	8	26044	26051	25 %	25 %	50 %	0 %	338215111
83	NC_015704	CAAT	2	8	26135	26142	50 %	25 %	0 %	25 %	338215111
84	NC_015704	GTTT	2	8	26972	26979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015704	TTAT	2	8	27040	27047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015704	ATTC	2	8	27100	27107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015704	AATA	2	8	27117	27124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015704	ATTC	2	8	27514	27521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015704	CTGA	2	8	27802	27809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015704	TTGA	2	8	28104	28111	25 %	50 %	25 %	0 %	338215112
91	NC_015704	TCGC	2	8	28901	28908	0 %	25 %	25 %	50 %	338215112
92	NC_015704	CACC	2	8	29054	29061	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_015704	GTAG	2	8	30039	30046	25 %	25 %	50 %	0 %	338215113
94	NC_015704	TGCC	2	8	30254	30261	0 %	25 %	25 %	50 %	338215113
95	NC_015704	GTAA	2	8	30426	30433	50 %	25 %	25 %	0 %	338215113
96	NC_015704	ATGA	2	8	30645	30652	50 %	25 %	25 %	0 %	338215113
97	NC_015704	AATC	2	8	31326	31333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015704	GACT	2	8	31565	31572	25 %	25 %	25 %	25 %	338215115
99	NC_015704	CGAC	2	8	32141	32148	25 %	0 %	25 %	50 %	338215115
100	NC_015704	CGAC	2	8	32827	32834	25 %	0 %	25 %	50 %	338215116
101	NC_015704	GTTG	2	8	33025	33032	0 %	50 %	50 %	0 %	338215116
102	NC_015704	TCAG	2	8	33096	33103	25 %	25 %	25 %	25 %	338215116
103	NC_015704	TGGG	2	8	33609	33616	0 %	25 %	75 %	0 %	338215116
104	NC_015704	CTTG	2	8	33889	33896	0 %	50 %	25 %	25 %	338215116
105	NC_015704	CGGT	2	8	34353	34360	0 %	25 %	50 %	25 %	338215116
106	NC_015704	GGTC	2	8	34708	34715	0 %	25 %	50 %	25 %	338215116
107	NC_015704	TCAT	2	8	35858	35865	25 %	50 %	0 %	25 %	338215117
108	NC_015704	GTAA	2	8	35973	35980	50 %	25 %	25 %	0 %	338215117
109	NC_015704	AACC	2	8	36342	36349	50 %	0 %	0 %	50 %	338215117
110	NC_015704	ACAA	2	8	36640	36647	75 %	0 %	0 %	25 %	338215117
111	NC_015704	GGTT	2	8	37568	37575	0 %	50 %	50 %	0 %	338215118
112	NC_015704	GGCG	2	8	37875	37882	0 %	0 %	75 %	25 %	338215118
113	NC_015704	GCAC	2	8	38146	38153	25 %	0 %	25 %	50 %	338215118
114	NC_015704	AGCG	2	8	38243	38250	25 %	0 %	50 %	25 %	338215118
115	NC_015704	AATC	2	8	38285	38292	50 %	25 %	0 %	25 %	338215118
116	NC_015704	GCAG	2	8	38415	38422	25 %	0 %	50 %	25 %	338215118
117	NC_015704	TTTC	2	8	38504	38511	0 %	75 %	0 %	25 %	338215118
118	NC_015704	TGTA	2	8	38893	38900	25 %	50 %	25 %	0 %	338215118
119	NC_015704	TTGG	2	8	39000	39007	0 %	50 %	50 %	0 %	338215118
120	NC_015704	CGGG	2	8	39308	39315	0 %	0 %	75 %	25 %	338215118
121	NC_015704	GTTT	2	8	40646	40653	0 %	75 %	25 %	0 %	338215119
122	NC_015704	TGAA	2	8	40728	40735	50 %	25 %	25 %	0 %	338215119
123	NC_015704	CTTT	2	8	41881	41888	0 %	75 %	0 %	25 %	338215119
124	NC_015704	AGCC	2	8	42335	42342	25 %	0 %	25 %	50 %	338215120
125	NC_015704	ATTT	2	8	42529	42536	25 %	75 %	0 %	0 %	338215120
126	NC_015704	ATCA	2	8	42880	42887	50 %	25 %	0 %	25 %	338215121
127	NC_015704	ACAT	2	8	42896	42903	50 %	25 %	0 %	25 %	338215121
128	NC_015704	GTTT	2	8	42962	42969	0 %	75 %	25 %	0 %	338215121
129	NC_015704	ACAT	2	8	43097	43104	50 %	25 %	0 %	25 %	338215121
130	NC_015704	CTTT	2	8	43497	43504	0 %	75 %	0 %	25 %	338215121
131	NC_015704	TTGC	2	8	44330	44337	0 %	50 %	25 %	25 %	338215122
132	NC_015704	TGAT	2	8	44384	44391	25 %	50 %	25 %	0 %	338215122
133	NC_015704	TTAA	2	8	44762	44769	50 %	50 %	0 %	0 %	338215122
134	NC_015704	CAGC	2	8	44922	44929	25 %	0 %	25 %	50 %	338215122
135	NC_015704	ATTT	2	8	45055	45062	25 %	75 %	0 %	0 %	338215122
136	NC_015704	AATA	2	8	45092	45099	75 %	25 %	0 %	0 %	338215122
137	NC_015704	TTGA	2	8	45322	45329	25 %	50 %	25 %	0 %	338215122
138	NC_015704	TGGT	2	8	46597	46604	0 %	50 %	50 %	0 %	338215122
139	NC_015704	GTAA	2	8	46696	46703	50 %	25 %	25 %	0 %	338215122
140	NC_015704	CCAA	2	8	46778	46785	50 %	0 %	0 %	50 %	338215122
141	NC_015704	TAAA	2	8	46798	46805	75 %	25 %	0 %	0 %	338215122
142	NC_015704	CATC	2	8	46875	46882	25 %	25 %	0 %	50 %	338215122
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.