MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015704	TAA	2	6	1419	1424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015704	TAT	2	6	1567	1572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015704	TAA	3	9	1584	1592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015704	ATT	2	6	8748	8753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015704	GAA	2	6	8773	8778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015704	TCA	2	6	8970	8975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015704	TCT	2	6	12035	12040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015704	TAT	2	6	12099	12104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015704	AGC	2	6	12126	12131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015704	ATT	2	6	14648	14653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015704	ATT	2	6	19578	19583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015704	TGC	2	6	20094	20099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015704	AGT	2	6	20126	20131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015704	ATG	2	6	20241	20246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015704	AAC	2	6	20322	20327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015704	GAT	2	6	20413	20418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015704	CCT	2	6	20473	20478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015704	TAA	2	6	20592	20597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015704	TAT	2	6	22961	22966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015704	TTA	2	6	22971	22976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015704	AAG	2	6	23000	23005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015704	AAT	2	6	24704	24709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015704	TAT	2	6	25735	25740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015704	TAG	2	6	25854	25859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015704	ATT	2	6	25912	25917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015704	AAT	2	6	27024	27029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015704	AAC	2	6	27176	27181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015704	TAA	2	6	27376	27381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015704	AAT	2	6	27537	27542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015704	GAT	2	6	27564	27569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015704	TGT	2	6	27573	27578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015704	AAT	2	6	27675	27680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015704	TCA	2	6	27691	27696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015704	AAT	2	6	27700	27705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015704	GCC	2	6	39673	39678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015704	AGA	2	6	39749	39754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015704	CTT	2	6	39818	39823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015704	TTG	2	6	39878	39883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015704	AAT	2	6	41898	41903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015704	TAA	2	6	42545	42550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015704	GCG	2	6	48209	48214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015704	GAA	2	6	48266	48271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015704	ACA	2	6	52197	52202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015704	CTG	2	6	52803	52808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015704	ATA	2	6	58588	58593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015704	ATC	2	6	58594	58599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015704	ACA	2	6	58647	58652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015704	GAT	2	6	69745	69750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015704	GTA	2	6	69811	69816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015704	ATA	2	6	69835	69840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015704	TGT	2	6	72778	72783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015704	TAA	2	6	73956	73961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015704	AGT	2	6	74265	74270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015704	ACA	2	6	74341	74346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015704	TAA	2	6	88464	88469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015704	ATT	2	6	88475	88480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015704	ATC	2	6	89164	89169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015704	GGT	2	6	91321	91326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015704	ATA	2	6	93509	93514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.