MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02

Total Repeats: 1058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015704	TCC	2	6	113	118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215080
2	NC_015704	GTA	2	6	178	183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215080
3	NC_015704	GTA	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215080
4	NC_015704	ATG	2	6	269	274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215080
5	NC_015704	GCA	2	6	341	346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215080
6	NC_015704	GAA	2	6	349	354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215080
7	NC_015704	AAT	2	6	471	476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215080
8	NC_015704	CCA	2	6	537	542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215081
9	NC_015704	TTC	2	6	631	636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215081
10	NC_015704	CTG	2	6	667	672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215081
11	NC_015704	TTC	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215081
12	NC_015704	TTC	2	6	804	809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215082
13	NC_015704	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215082
14	NC_015704	TTC	2	6	825	830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215082
15	NC_015704	CCA	2	6	869	874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215082
16	NC_015704	AAT	2	6	1161	1166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215082
17	NC_015704	CTA	2	6	1250	1255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215082
18	NC_015704	AGT	2	6	1332	1337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215082
19	NC_015704	TTA	2	6	1370	1375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215082
20	NC_015704	TGA	2	6	1649	1654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215084
21	NC_015704	CAA	2	6	1759	1764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215084
22	NC_015704	TAT	2	6	1803	1808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215084
23	NC_015704	GCC	2	6	1819	1824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215084
24	NC_015704	GCC	2	6	1894	1899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215084
25	NC_015704	TGC	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215084
26	NC_015704	TCT	2	6	1958	1963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215084
27	NC_015704	GAA	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215085
28	NC_015704	CAC	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215085
29	NC_015704	CAA	2	6	2336	2341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215085
30	NC_015704	GCA	2	6	2410	2415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215086
31	NC_015704	GAA	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215086
32	NC_015704	TCT	2	6	2567	2572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215086
33	NC_015704	TCA	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215086
34	NC_015704	GAA	2	6	2695	2700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215086
35	NC_015704	TTG	2	6	2737	2742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215086
36	NC_015704	CTA	2	6	2852	2857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215087
37	NC_015704	CGC	2	6	2858	2863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215087
38	NC_015704	CAT	2	6	2906	2911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215087
39	NC_015704	ATG	2	6	2980	2985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215087
40	NC_015704	GAT	2	6	3356	3361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215088
41	NC_015704	CAA	2	6	3397	3402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215088
42	NC_015704	CTT	2	6	3486	3491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215088
43	NC_015704	CAG	2	6	3512	3517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215088
44	NC_015704	ACT	2	6	3523	3528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215088
45	NC_015704	AAT	2	6	3818	3823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215088
46	NC_015704	CAG	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215088
47	NC_015704	ATG	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215088
48	NC_015704	TAG	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215088
49	NC_015704	GAA	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215088
50	NC_015704	CAA	2	6	4075	4080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215088
51	NC_015704	GCG	3	9	4163	4171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215088
52	NC_015704	ATT	2	6	4222	4227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215088
53	NC_015704	TGG	2	6	4392	4397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215088
54	NC_015704	AAC	2	6	4490	4495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215088
55	NC_015704	TAC	2	6	4502	4507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215088
56	NC_015704	TGG	2	6	4536	4541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215088
57	NC_015704	CGA	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215088
58	NC_015704	TTG	2	6	4685	4690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215088
59	NC_015704	GAA	2	6	4702	4707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215088
60	NC_015704	GTC	2	6	4720	4725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215088
61	NC_015704	TTA	2	6	4933	4938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215088
62	NC_015704	ACT	2	6	4956	4961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215088
63	NC_015704	ATA	2	6	5022	5027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215088
64	NC_015704	ACC	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215088
65	NC_015704	CTT	2	6	5173	5178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215088
66	NC_015704	AGT	2	6	5224	5229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215088
67	NC_015704	GAT	2	6	5243	5248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215088
68	NC_015704	TAT	2	6	5278	5283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215088
69	NC_015704	CAA	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215088
70	NC_015704	CAT	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215088
71	NC_015704	TGC	2	6	5445	5450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215088
72	NC_015704	GCG	2	6	5518	5523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215088
73	NC_015704	GGA	2	6	5530	5535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338215088
74	NC_015704	TGT	2	6	5724	5729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215089
75	NC_015704	CTT	2	6	5783	5788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215089
76	NC_015704	GCG	2	6	5834	5839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215089
77	NC_015704	ATT	2	6	5962	5967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215089
78	NC_015704	TAC	2	6	6127	6132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215089
79	NC_015704	ATG	2	6	6281	6286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215089
80	NC_015704	AAG	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215089
81	NC_015704	AGA	2	6	6537	6542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215089
82	NC_015704	GAA	2	6	6595	6600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215089
83	NC_015704	TGA	2	6	6621	6626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215089
84	NC_015704	AAG	2	6	6959	6964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215090
85	NC_015704	GGT	2	6	7046	7051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215090
86	NC_015704	GCT	2	6	7352	7357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215090
87	NC_015704	CAG	2	6	7363	7368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215090
88	NC_015704	GCG	2	6	7415	7420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215090
89	NC_015704	AGG	2	6	7432	7437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338215090
90	NC_015704	GAG	2	6	7551	7556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338215090
91	NC_015704	CAG	2	6	7716	7721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215090
92	NC_015704	AGT	2	6	7771	7776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215090
93	NC_015704	TGG	2	6	7777	7782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215090
94	NC_015704	GGT	2	6	7799	7804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215090
95	NC_015704	CCA	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215090
96	NC_015704	ACG	2	6	8110	8115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215091
97	NC_015704	ATT	2	6	8131	8136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215092
98	NC_015704	TCA	2	6	8338	8343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215092
99	NC_015704	GAC	2	6	8399	8404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215092
100	NC_015704	GTT	2	6	8419	8424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215092
101	NC_015704	TGA	2	6	8431	8436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215092
102	NC_015704	AAG	2	6	8444	8449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215092
103	NC_015704	TTA	2	6	8622	8627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215092
104	NC_015704	TGG	2	6	8640	8645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215092
105	NC_015704	CAC	2	6	9006	9011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215093
106	NC_015704	GAC	2	6	9020	9025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215093
107	NC_015704	TAA	2	6	9056	9061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215093
108	NC_015704	CTG	2	6	9160	9165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215093
109	NC_015704	TGA	2	6	9221	9226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215093
110	NC_015704	GCT	2	6	9300	9305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215093
111	NC_015704	ATA	2	6	9403	9408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215093
112	NC_015704	TGA	2	6	9691	9696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215093
113	NC_015704	CTG	2	6	9742	9747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215093
114	NC_015704	GTT	2	6	9758	9763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215093
115	NC_015704	GAA	2	6	9813	9818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215093
116	NC_015704	CTA	2	6	9820	9825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215093
117	NC_015704	ACT	2	6	9855	9860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215093
118	NC_015704	TGC	2	6	10015	10020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215093
119	NC_015704	CAT	2	6	10208	10213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215093
120	NC_015704	CGG	2	6	10243	10248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215093
121	NC_015704	AAT	2	6	10456	10461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215093
122	NC_015704	ACA	2	6	10664	10669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215094
123	NC_015704	GAA	2	6	10817	10822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215094
124	NC_015704	AAT	2	6	10889	10894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215094
125	NC_015704	GCA	2	6	11204	11209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215094
126	NC_015704	CAT	2	6	11392	11397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215094
127	NC_015704	CAA	2	6	11436	11441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215095
128	NC_015704	GAA	2	6	11443	11448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215095
129	NC_015704	GTT	2	6	11909	11914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215095
130	NC_015704	CCT	2	6	11943	11948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215095
131	NC_015704	TGA	2	6	12428	12433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215096
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134	NC_015704	GCA	2	6	12700	12705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215096
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252	NC_015704	AGG	2	6	22912	22917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338215107
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254	NC_015704	CAA	2	6	23207	23212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215108
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257	NC_015704	AGT	2	6	23593	23598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215108
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