MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015704	GT	3	6	170	175	0 %	50 %	50 %	0 %	338215080
2	NC_015704	CA	3	6	1506	1511	50 %	0 %	0 %	50 %	338215083
3	NC_015704	AT	3	6	1987	1992	50 %	50 %	0 %	0 %	338215085
4	NC_015704	CT	3	6	3908	3913	0 %	50 %	0 %	50 %	338215088
5	NC_015704	TA	3	6	3924	3929	50 %	50 %	0 %	0 %	338215088
6	NC_015704	GA	3	6	6091	6096	50 %	0 %	50 %	0 %	338215089
7	NC_015704	AC	3	6	7332	7337	50 %	0 %	0 %	50 %	338215090
8	NC_015704	GA	3	6	10198	10203	50 %	0 %	50 %	0 %	338215093
9	NC_015704	CA	3	6	10668	10673	50 %	0 %	0 %	50 %	338215094
10	NC_015704	TC	3	6	12316	12321	0 %	50 %	0 %	50 %	338215096
11	NC_015704	TC	3	6	12598	12603	0 %	50 %	0 %	50 %	338215096
12	NC_015704	TC	3	6	13283	13288	0 %	50 %	0 %	50 %	338215096
13	NC_015704	AC	3	6	13839	13844	50 %	0 %	0 %	50 %	338215097
14	NC_015704	TC	3	6	13852	13857	0 %	50 %	0 %	50 %	338215097
15	NC_015704	TA	3	6	14757	14762	50 %	50 %	0 %	0 %	338215098
16	NC_015704	CT	3	6	15590	15595	0 %	50 %	0 %	50 %	338215098
17	NC_015704	AG	3	6	16924	16929	50 %	0 %	50 %	0 %	338215098
18	NC_015704	CT	3	6	16990	16995	0 %	50 %	0 %	50 %	338215098
19	NC_015704	AT	3	6	17678	17683	50 %	50 %	0 %	0 %	338215099
20	NC_015704	AT	3	6	17907	17912	50 %	50 %	0 %	0 %	338215099
21	NC_015704	TA	3	6	18073	18078	50 %	50 %	0 %	0 %	338215100
22	NC_015704	AG	3	6	18479	18484	50 %	0 %	50 %	0 %	338215100
23	NC_015704	AC	3	6	21264	21269	50 %	0 %	0 %	50 %	338215105
24	NC_015704	AC	3	6	24278	24283	50 %	0 %	0 %	50 %	338215109
25	NC_015704	TA	3	6	27952	27957	50 %	50 %	0 %	0 %	338215112
26	NC_015704	CT	3	6	28890	28895	0 %	50 %	0 %	50 %	338215112
27	NC_015704	AG	3	6	29395	29400	50 %	0 %	50 %	0 %	338215113
28	NC_015704	AG	3	6	30485	30490	50 %	0 %	50 %	0 %	338215113
29	NC_015704	AG	3	6	31730	31735	50 %	0 %	50 %	0 %	338215115
30	NC_015704	AT	3	6	33136	33141	50 %	50 %	0 %	0 %	338215116
31	NC_015704	GT	3	6	34676	34681	0 %	50 %	50 %	0 %	338215116
32	NC_015704	GA	3	6	39226	39231	50 %	0 %	50 %	0 %	338215118
33	NC_015704	TG	3	6	40108	40113	0 %	50 %	50 %	0 %	338215119
34	NC_015704	GT	3	6	41050	41055	0 %	50 %	50 %	0 %	338215119
35	NC_015704	GA	3	6	41134	41139	50 %	0 %	50 %	0 %	338215119
36	NC_015704	TA	3	6	41858	41863	50 %	50 %	0 %	0 %	338215119
37	NC_015704	GA	3	6	44989	44994	50 %	0 %	50 %	0 %	338215122
38	NC_015704	TC	3	6	45286	45291	0 %	50 %	0 %	50 %	338215122
39	NC_015704	GT	3	6	48852	48857	0 %	50 %	50 %	0 %	338215124
40	NC_015704	TC	3	6	49321	49326	0 %	50 %	0 %	50 %	338215124
41	NC_015704	AT	3	6	51508	51513	50 %	50 %	0 %	0 %	338215126
42	NC_015704	AC	3	6	52452	52457	50 %	0 %	0 %	50 %	338215127
43	NC_015704	AG	4	8	52717	52724	50 %	0 %	50 %	0 %	338215127
44	NC_015704	AG	3	6	53929	53934	50 %	0 %	50 %	0 %	338215129
45	NC_015704	TG	3	6	54861	54866	0 %	50 %	50 %	0 %	338215131
46	NC_015704	TA	3	6	54920	54925	50 %	50 %	0 %	0 %	338215131
47	NC_015704	GA	4	8	55389	55396	50 %	0 %	50 %	0 %	338215131
48	NC_015704	TA	3	6	55612	55617	50 %	50 %	0 %	0 %	338215132
49	NC_015704	TA	3	6	56957	56962	50 %	50 %	0 %	0 %	338215134
50	NC_015704	TA	3	6	57563	57568	50 %	50 %	0 %	0 %	338215135
51	NC_015704	TC	3	6	57642	57647	0 %	50 %	0 %	50 %	338215135
52	NC_015704	AG	3	6	58458	58463	50 %	0 %	50 %	0 %	338215136
53	NC_015704	AG	3	6	59161	59166	50 %	0 %	50 %	0 %	338215137
54	NC_015704	AT	3	6	61396	61401	50 %	50 %	0 %	0 %	338215138
55	NC_015704	AT	3	6	63153	63158	50 %	50 %	0 %	0 %	338215140
56	NC_015704	TA	3	6	71063	71068	50 %	50 %	0 %	0 %	338215147
57	NC_015704	GT	3	6	71517	71522	0 %	50 %	50 %	0 %	338215148
58	NC_015704	CT	3	6	71841	71846	0 %	50 %	0 %	50 %	338215149
59	NC_015704	GC	3	6	71931	71936	0 %	0 %	50 %	50 %	338215149
60	NC_015704	AT	3	6	72220	72225	50 %	50 %	0 %	0 %	338215149
61	NC_015704	GA	3	6	72980	72985	50 %	0 %	50 %	0 %	338215150
62	NC_015704	GT	3	6	73353	73358	0 %	50 %	50 %	0 %	338215151
63	NC_015704	CT	3	6	74532	74537	0 %	50 %	0 %	50 %	338215153
64	NC_015704	TA	3	6	74768	74773	50 %	50 %	0 %	0 %	338215153
65	NC_015704	TG	3	6	74900	74905	0 %	50 %	50 %	0 %	338215153
66	NC_015704	AT	3	6	75183	75188	50 %	50 %	0 %	0 %	338215153
67	NC_015704	AT	3	6	75505	75510	50 %	50 %	0 %	0 %	338215154
68	NC_015704	AG	3	6	78879	78884	50 %	0 %	50 %	0 %	338215157
69	NC_015704	TA	3	6	81548	81553	50 %	50 %	0 %	0 %	338215160
70	NC_015704	CT	3	6	82370	82375	0 %	50 %	0 %	50 %	338215160
71	NC_015704	CT	3	6	88058	88063	0 %	50 %	0 %	50 %	338215162
72	NC_015704	AG	3	6	88231	88236	50 %	0 %	50 %	0 %	338215163
73	NC_015704	AT	4	8	88502	88509	50 %	50 %	0 %	0 %	338215164
74	NC_015704	GA	3	6	88963	88968	50 %	0 %	50 %	0 %	338215164
75	NC_015704	AT	3	6	89961	89966	50 %	50 %	0 %	0 %	338215167
76	NC_015704	GT	3	6	92322	92327	0 %	50 %	50 %	0 %	338215169
77	NC_015704	TC	3	6	92383	92388	0 %	50 %	0 %	50 %	338215169
78	NC_015704	GT	3	6	93283	93288	0 %	50 %	50 %	0 %	338215169

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.