MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 chromosome

Total Repeats: 255

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015703	TGGTGT	2	12	22013	22024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015703	TTTGCA	2	12	53111	53122	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015703	ATTTTT	2	12	82383	82394	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015703	AATGTA	2	12	164244	164255	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015703	TTGCCA	2	12	170294	170305	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015703	TTTTTG	2	12	175642	175653	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015703	TCACAT	2	12	197661	197672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015703	GTTGTG	2	12	203714	203725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015703	TGTTTG	2	12	231337	231348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015703	GCCTTC	2	12	242069	242080	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015703	TCGCTT	2	12	242792	242803	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015703	TTTACA	2	12	243083	243094	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015703	TACGAT	2	12	248612	248623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015703	TTTTGC	2	12	310746	310757	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015703	AGAAAA	2	12	327023	327034	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015703	TCGCGC	2	12	344856	344867	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015703	TGCCGG	2	12	376203	376214	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015703	GGTTTG	2	12	381086	381097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015703	ATCACA	2	12	381248	381259	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015703	GCCCCT	2	12	390089	390100	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015703	AAAGGT	2	12	408226	408237	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015703	TAAATA	2	12	418108	418119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015703	TATTTA	2	12	418132	418143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015703	AAAACT	2	12	445552	445563	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015703	AATTTT	2	12	459151	459162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015703	TTCCGC	2	12	466462	466473	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015703	CGAAAG	2	12	467315	467326	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015703	TGGGGA	2	12	483688	483699	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015703	CAAAAT	2	12	513042	513053	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015703	GCGCTT	2	12	540658	540669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015703	ATTGAA	2	12	546822	546833	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015703	ATTTTT	2	12	575037	575048	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015703	ATTGTA	2	12	586191	586202	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015703	AACCTA	2	12	599126	599137	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015703	AAAGCT	2	12	634224	634235	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015703	ATCCAA	2	12	657761	657772	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015703	CAATTC	2	12	740583	740594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015703	TTATTT	2	12	765791	765802	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015703	GAAAAC	2	12	802172	802183	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015703	AAAAAG	2	12	810712	810723	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015703	GCATGG	2	12	819611	819622	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015703	AAAATA	2	12	819866	819877	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015703	TTACGT	2	12	841264	841275	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015703	TATTTT	2	12	844742	844753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015703	GGTTGG	2	12	871189	871200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015703	ATGATA	2	12	878073	878084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015703	TTTATT	2	12	900594	900605	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015703	TTCATA	2	12	906550	906561	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015703	CCAAAA	2	12	909838	909849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015703	TAAAAA	2	12	922514	922525	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015703	AAACCA	2	12	947209	947220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015703	CGTTAT	2	12	959218	959229	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015703	GCCGAA	2	12	959926	959937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015703	ATTTTT	2	12	961781	961792	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015703	CAGGAA	2	12	965704	965715	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015703	ATAAAA	2	12	970922	970933	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015703	CCGTTG	2	12	1083816	1083827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015703	GTCTCT	2	12	1092560	1092571	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015703	TTAAAC	2	12	1099456	1099467	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015703	TTAGTT	2	12	1123819	1123830	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015703	AGTAGA	2	12	1125347	1125358	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015703	CTTTTT	2	12	1126885	1126896	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015703	CAAAGA	2	12	1128350	1128361	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015703	TCATGA	2	12	1155945	1155956	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015703	TTTATT	2	12	1170898	1170909	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015703	AAAGTT	2	12	1181520	1181531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015703	AATTCC	2	12	1281966	1281977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015703	ATCAAA	2	12	1314439	1314450	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015703	AAACAG	2	12	1471248	1471259	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015703	GTAGGG	2	12	1547227	1547238	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015703	AAAAAC	2	12	1567552	1567563	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015703	TAAGCA	2	12	1597168	1597179	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015703	GTAAAT	2	12	1650290	1650301	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015703	TCAAAA	2	12	1735884	1735895	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015703	AATGAT	2	12	1800432	1800443	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015703	CATATA	2	12	1843135	1843146	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015703	GTTTTT	2	12	1857079	1857090	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015703	GCAGAC	2	12	1864794	1864805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015703	CTTTAT	2	12	1897302	1897313	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015703	GCTTTT	2	12	1903446	1903457	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015703	AGTTTG	2	12	1905530	1905541	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015703	TGATTT	2	12	1907401	1907412	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015703	GCCTTC	2	12	1931169	1931180	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015703	TCGCTT	2	12	1931892	1931903	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015703	TTTACA	2	12	1932183	1932194	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015703	TAAAAA	2	12	2026536	2026547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015703	TTTTTA	2	12	2032884	2032895	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015703	TTACGT	2	12	2106798	2106809	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015703	TTTATA	2	12	2129085	2129096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015703	AAAAGT	2	12	2132634	2132645	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015703	GGTTTT	2	12	2228320	2228331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015703	ATTTTA	2	12	2291760	2291771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015703	TTTCAG	2	12	2294198	2294209	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015703	TCTTTT	2	12	2296766	2296777	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015703	AAATAG	2	12	2315651	2315662	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015703	TTTTGA	2	12	2415445	2415456	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015703	TTGAAG	2	12	2430860	2430871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015703	CAAAAA	2	12	2494184	2494195	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015703	TGGTTA	2	12	2512707	2512718	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015703	TGTTTG	2	12	2571856	2571867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015703	AATAAA	2	12	2613349	2613360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015703	AATAAA	2	12	2725230	2725241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015703	TAAAAA	2	12	2736295	2736306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015703	GTTTTG	2	12	2737654	2737665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015703	AAAAAT	2	12	2770798	2770809	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015703	TGTTTT	2	12	2774877	2774888	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015703	AGTTAA	2	12	2777400	2777411	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015703	CAAAGA	2	12	2793537	2793548	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015703	ATTTTA	2	12	2844663	2844674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015703	GATTTT	2	12	2865951	2865962	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015703	TAAAAA	2	12	2925494	2925505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015703	AAGTAA	2	12	2935661	2935672	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015703	CCGGCC	2	12	2969115	2969126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015703	GAAAAA	2	12	2972574	2972585	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015703	AAGTAA	2	12	2978895	2978906	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015703	GTAAAA	2	12	3102842	3102853	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015703	AAAATG	2	12	3117760	3117771	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015703	ATTTGG	2	12	3167075	3167086	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015703	TACTTT	2	12	3169708	3169719	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_015703	CCGTTA	2	12	3278915	3278926	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015703	CAACCC	2	12	3279103	3279114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015703	AGCCGA	2	12	3317399	3317410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015703	TGAGAA	2	12	3322498	3322509	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015703	TGGGAT	2	12	3334723	3334734	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015703	CATAAA	2	12	3340276	3340287	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015703	ACCAAA	2	12	3421275	3421286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015703	TTTTTA	2	12	3424727	3424738	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_015703	TTTTAC	2	12	6265562	6265573	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
249	NC_015703	ATAGGT	2	12	6277693	6277704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_015703	CCTTGG	2	12	6393943	6393954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_015703	CCAAAG	2	12	6446987	6446998	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_015703	TTATTT	2	12	6455161	6455172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_015703	CTCTTT	2	12	6492133	6492144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_015703	AAAGGA	2	12	6543843	6543854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_015703	TCTTTA	2	12	6564790	6564801	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.