MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 chromosome

Total Repeats: 8692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015703	TCA	2	6	1551	1556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015703	TAT	2	6	3146	3151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015703	ATC	2	6	3185	3190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015703	CTC	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015703	TTC	2	6	10550	10555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015703	CAA	2	6	12454	12459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015703	GAC	2	6	12514	12519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015703	AAT	2	6	12565	12570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015703	TGC	2	6	12786	12791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015703	GAA	2	6	12827	12832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015703	TCG	2	6	12840	12845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015703	CAT	2	6	12905	12910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015703	CAA	2	6	12925	12930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015703	TTG	2	6	13310	13315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015703	GTG	2	6	16534	16539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015703	CAC	2	6	16603	16608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015703	TAA	2	6	16741	16746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015703	CAT	2	6	16754	16759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015703	GCG	2	6	18115	18120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015703	TTG	2	6	19292	19297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015703	GCA	2	6	21679	21684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015703	CGA	2	6	21708	21713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015703	CTG	2	6	21772	21777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015703	CAG	3	9	21869	21877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015703	CGA	2	6	21900	21905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015703	ACT	2	6	21921	21926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015703	CCA	2	6	22029	22034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015703	TAT	2	6	23471	23476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015703	TTG	2	6	23577	23582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015703	GTT	2	6	23595	23600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015703	CCA	2	6	23610	23615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015703	GAG	2	6	24550	24555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015703	CTC	2	6	25586	25591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015703	GAG	2	6	29535	29540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015703	AGT	2	6	29557	29562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015703	ACT	2	6	29591	29596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015703	TCA	2	6	32108	32113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015703	TGA	2	6	32935	32940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015703	GGT	2	6	32952	32957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015703	CAC	2	6	33027	33032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015703	AAT	2	6	33680	33685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015703	GAA	2	6	33727	33732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015703	TAT	2	6	33798	33803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015703	AGC	2	6	35821	35826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015703	TTC	2	6	38016	38021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015703	ATT	2	6	38072	38077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015703	CTT	2	6	38087	38092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015703	GTG	2	6	38113	38118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015703	CAG	2	6	38137	38142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015703	TCG	2	6	38704	38709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015703	ATC	2	6	42503	42508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015703	TGT	2	6	44088	44093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015703	AAT	2	6	44095	44100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015703	ATA	2	6	48744	48749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015703	ACA	2	6	48815	48820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015703	GCG	2	6	49979	49984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015703	AAG	2	6	51278	51283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015703	AAC	2	6	51290	51295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015703	AAT	2	6	51395	51400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015703	TGG	2	6	53046	53051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015703	CAC	2	6	53059	53064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015703	AAC	2	6	53144	53149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015703	GCG	2	6	53325	53330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015703	GGA	2	6	53475	53480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015703	CTG	2	6	53535	53540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015703	CCA	2	6	53593	53598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015703	TAT	2	6	53769	53774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015703	AAC	2	6	53823	53828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015703	GAC	2	6	55303	55308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015703	TAT	2	6	55309	55314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015703	GCC	2	6	55318	55323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015703	GCC	2	6	55378	55383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015703	GTA	2	6	55469	55474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015703	TAA	2	6	60086	60091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015703	TTC	2	6	61605	61610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015703	TGG	2	6	64234	64239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015703	CAA	2	6	66027	66032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015703	CCG	2	6	66033	66038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015703	GTT	2	6	67098	67103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015703	GAA	2	6	67174	67179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015703	CTA	2	6	67217	67222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015703	AGA	2	6	67255	67260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015703	CAG	2	6	67278	67283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015703	ACA	2	6	70496	70501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015703	TCT	2	6	71902	71907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015703	TAA	2	6	71992	71997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015703	CCA	2	6	72002	72007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015703	TTA	2	6	72640	72645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015703	ACT	2	6	73923	73928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015703	TGG	2	6	73933	73938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015703	CAA	2	6	73950	73955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015703	ATT	2	6	74016	74021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015703	TCC	2	6	74880	74885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015703	AAT	2	6	77438	77443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015703	AGT	2	6	77482	77487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015703	AGA	2	6	77609	77614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015703	CTT	2	6	78216	78221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015703	AAG	2	6	78256	78261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015703	AAC	2	6	78338	78343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015703	AAT	2	6	78463	78468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015703	CAA	2	6	78523	78528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015703	CTC	2	6	78610	78615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015703	CGA	2	6	79025	79030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015703	TTC	2	6	80233	80238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015703	TAT	2	6	80379	80384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015703	TGC	2	6	80766	80771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015703	TTA	2	6	80812	80817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015703	ACG	2	6	82407	82412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015703	TAT	2	6	83581	83586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015703	ATT	2	6	84920	84925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015703	CAG	2	6	84975	84980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015703	CAC	2	6	85019	85024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_015703	TAA	2	6	85060	85065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015703	ATT	2	6	85206	85211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015703	AAG	2	6	85241	85246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015703	TCA	2	6	93800	93805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015703	ATG	2	6	102088	102093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015703	AAG	2	6	102096	102101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015703	TTG	2	6	102111	102116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015703	CAT	2	6	104027	104032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015703	TCG	2	6	104045	104050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015703	GAA	2	6	107825	107830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015703	GTT	2	6	107895	107900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015703	CAT	2	6	108579	108584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015703	AAT	2	6	108624	108629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015703	TTA	2	6	108641	108646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015703	TCC	2	6	110002	110007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015703	AAC	2	6	110092	110097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015703	CTT	2	6	110166	110171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015703	TCA	2	6	110178	110183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015703	AAC	2	6	110188	110193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015703	ACA	2	6	112762	112767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015703	GAA	2	6	112786	112791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015703	GCA	2	6	112840	112845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015703	TAA	2	6	116526	116531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015703	ATT	2	6	116544	116549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015703	CTT	2	6	116554	116559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015703	CAG	2	6	116667	116672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015703	TGA	2	6	116679	116684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_015703	ATC	2	6	240522	240527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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