MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 chromosome

Total Repeats: 6676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015703	CT	3	6	75	80	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015703	TC	3	6	1682	1687	0 %	50 %	0 %	50 %	338209547
3	NC_015703	GA	3	6	2220	2225	50 %	0 %	50 %	0 %	338209547
4	NC_015703	GC	3	6	6256	6261	0 %	0 %	50 %	50 %	338209552
5	NC_015703	GC	3	6	6296	6301	0 %	0 %	50 %	50 %	338209552
6	NC_015703	GC	3	6	9704	9709	0 %	0 %	50 %	50 %	338209554
7	NC_015703	CG	3	6	10609	10614	0 %	0 %	50 %	50 %	338209555
8	NC_015703	TC	3	6	10860	10865	0 %	50 %	0 %	50 %	338209555
9	NC_015703	TA	3	6	13016	13021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015703	GT	3	6	13451	13456	0 %	50 %	50 %	0 %	338209557
11	NC_015703	TG	3	6	13809	13814	0 %	50 %	50 %	0 %	338209557
12	NC_015703	TG	3	6	14535	14540	0 %	50 %	50 %	0 %	338209557
13	NC_015703	GC	3	6	14696	14701	0 %	0 %	50 %	50 %	338209557
14	NC_015703	GT	3	6	14957	14962	0 %	50 %	50 %	0 %	338209557
15	NC_015703	TG	3	6	15072	15077	0 %	50 %	50 %	0 %	338209557
16	NC_015703	AT	3	6	16137	16142	50 %	50 %	0 %	0 %	338209557
17	NC_015703	GT	3	6	18841	18846	0 %	50 %	50 %	0 %	338209560
18	NC_015703	CG	3	6	19757	19762	0 %	0 %	50 %	50 %	338209561
19	NC_015703	CG	3	6	22506	22511	0 %	0 %	50 %	50 %	338209562
20	NC_015703	CA	3	6	23126	23131	50 %	0 %	0 %	50 %	338209562
21	NC_015703	CG	3	6	23723	23728	0 %	0 %	50 %	50 %	338209563
22	NC_015703	CG	3	6	26765	26770	0 %	0 %	50 %	50 %	338209565
23	NC_015703	CT	3	6	27216	27221	0 %	50 %	0 %	50 %	338209565
24	NC_015703	AG	3	6	28429	28434	50 %	0 %	50 %	0 %	338209565
25	NC_015703	GC	3	6	28736	28741	0 %	0 %	50 %	50 %	338209566
26	NC_015703	CT	3	6	33610	33615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015703	GT	3	6	33701	33706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015703	TG	3	6	34772	34777	0 %	50 %	50 %	0 %	338209571
29	NC_015703	AT	3	6	34965	34970	50 %	50 %	0 %	0 %	338209571
30	NC_015703	TA	3	6	35394	35399	50 %	50 %	0 %	0 %	338209572
31	NC_015703	TA	3	6	36889	36894	50 %	50 %	0 %	0 %	338209574
32	NC_015703	AG	3	6	38633	38638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015703	AC	3	6	38680	38685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015703	CG	3	6	39343	39348	0 %	0 %	50 %	50 %	338209576
35	NC_015703	TC	3	6	42636	42641	0 %	50 %	0 %	50 %	338209579
36	NC_015703	TG	3	6	43069	43074	0 %	50 %	50 %	0 %	338209579
37	NC_015703	GC	4	8	43188	43195	0 %	0 %	50 %	50 %	338209579
38	NC_015703	CT	3	6	43802	43807	0 %	50 %	0 %	50 %	338209579
39	NC_015703	AC	3	6	44525	44530	50 %	0 %	0 %	50 %	338209580
40	NC_015703	GC	3	6	45739	45744	0 %	0 %	50 %	50 %	338209580
41	NC_015703	TC	3	6	46343	46348	0 %	50 %	0 %	50 %	338209581
42	NC_015703	AC	3	6	47357	47362	50 %	0 %	0 %	50 %	338209581
43	NC_015703	GC	3	6	50238	50243	0 %	0 %	50 %	50 %	338209583
44	NC_015703	CT	3	6	51008	51013	0 %	50 %	0 %	50 %	338209583
45	NC_015703	AT	3	6	53157	53162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015703	CT	3	6	53806	53811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015703	TA	3	6	53971	53976	50 %	50 %	0 %	0 %	338209585
48	NC_015703	CT	3	6	54608	54613	0 %	50 %	0 %	50 %	338209585
49	NC_015703	TC	3	6	54861	54866	0 %	50 %	0 %	50 %	338209585
50	NC_015703	AT	3	6	54873	54878	50 %	50 %	0 %	0 %	338209585
51	NC_015703	GC	3	6	55559	55564	0 %	0 %	50 %	50 %	338209586
52	NC_015703	TC	3	6	57966	57971	0 %	50 %	0 %	50 %	338209587
53	NC_015703	AC	3	6	58158	58163	50 %	0 %	0 %	50 %	338209587
54	NC_015703	CG	3	6	63110	63115	0 %	0 %	50 %	50 %	338209590
55	NC_015703	GC	3	6	63333	63338	0 %	0 %	50 %	50 %	338209590
56	NC_015703	GC	3	6	64794	64799	0 %	0 %	50 %	50 %	338209591
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60	NC_015703	CT	3	6	68703	68708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015703	TC	3	6	69826	69831	0 %	50 %	0 %	50 %	338209594
62	NC_015703	AC	3	6	70221	70226	50 %	0 %	0 %	50 %	338209594
63	NC_015703	AT	3	6	73367	73372	50 %	50 %	0 %	0 %	338209599
64	NC_015703	AT	3	6	73962	73967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015703	CT	3	6	74087	74092	0 %	50 %	0 %	50 %	338209601
66	NC_015703	AT	3	6	74742	74747	50 %	50 %	0 %	0 %	338209601
67	NC_015703	GC	3	6	76319	76324	0 %	0 %	50 %	50 %	338209603
68	NC_015703	TC	3	6	76675	76680	0 %	50 %	0 %	50 %	338209604
69	NC_015703	AT	3	6	78472	78477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015703	CG	3	6	79206	79211	0 %	0 %	50 %	50 %	338209607
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72	NC_015703	GA	3	6	80160	80165	50 %	0 %	50 %	0 %	338209607
73	NC_015703	AC	3	6	80254	80259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015703	TG	3	6	80292	80297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015703	TG	3	6	83455	83460	0 %	50 %	50 %	0 %	338209611
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79	NC_015703	CA	3	6	91237	91242	50 %	0 %	0 %	50 %	338209617
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82	NC_015703	AC	3	6	100597	100602	50 %	0 %	0 %	50 %	338209624
83	NC_015703	TA	3	6	102554	102559	50 %	50 %	0 %	0 %	338209626
84	NC_015703	CG	3	6	103203	103208	0 %	0 %	50 %	50 %	338209626
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89	NC_015703	TG	3	6	105297	105302	0 %	50 %	50 %	0 %	338209627
90	NC_015703	AT	3	6	105398	105403	50 %	50 %	0 %	0 %	338209628
91	NC_015703	CG	3	6	106443	106448	0 %	0 %	50 %	50 %	338209628
92	NC_015703	GC	3	6	106856	106861	0 %	0 %	50 %	50 %	338209628
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95	NC_015703	TG	3	6	110051	110056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015703	TA	3	6	110149	110154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_015703	AT	3	6	117288	117293	50 %	50 %	0 %	0 %	338209635
104	NC_015703	AT	3	6	117573	117578	50 %	50 %	0 %	0 %	338209635
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107	NC_015703	GT	3	6	123412	123417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015703	AT	3	6	123737	123742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015703	CG	3	6	124283	124288	0 %	0 %	50 %	50 %	338209639
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111	NC_015703	TG	3	6	126525	126530	0 %	50 %	50 %	0 %	338209640
112	NC_015703	CA	3	6	130697	130702	50 %	0 %	0 %	50 %	338209641
113	NC_015703	TA	3	6	131627	131632	50 %	50 %	0 %	0 %	338209642
114	NC_015703	GA	3	6	131929	131934	50 %	0 %	50 %	0 %	338209642
115	NC_015703	CG	3	6	136285	136290	0 %	0 %	50 %	50 %	338209645
116	NC_015703	TG	3	6	137082	137087	0 %	50 %	50 %	0 %	338209646
117	NC_015703	CT	3	6	139339	139344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015703	CT	3	6	143405	143410	0 %	50 %	0 %	50 %	338209649
119	NC_015703	TG	3	6	144387	144392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015703	CG	3	6	145252	145257	0 %	0 %	50 %	50 %	338209651
121	NC_015703	GA	3	6	145686	145691	50 %	0 %	50 %	0 %	338209651
122	NC_015703	GA	3	6	147491	147496	50 %	0 %	50 %	0 %	338209653
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124	NC_015703	GT	3	6	154455	154460	0 %	50 %	50 %	0 %	338209660
125	NC_015703	AG	4	8	154692	154699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015703	CA	3	6	155608	155613	50 %	0 %	0 %	50 %	338209662
127	NC_015703	AT	3	6	155699	155704	50 %	50 %	0 %	0 %	338209663
128	NC_015703	CG	3	6	156399	156404	0 %	0 %	50 %	50 %	338209663
129	NC_015703	GC	3	6	156589	156594	0 %	0 %	50 %	50 %	338209663
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134	NC_015703	TG	3	6	162684	162689	0 %	50 %	50 %	0 %	338209668
135	NC_015703	CT	3	6	162757	162762	0 %	50 %	0 %	50 %	338209668
136	NC_015703	GC	3	6	162768	162773	0 %	0 %	50 %	50 %	338209668
137	NC_015703	CG	4	8	163548	163555	0 %	0 %	50 %	50 %	338209670
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141	NC_015703	TG	3	6	172448	172453	0 %	50 %	50 %	0 %	338209676
142	NC_015703	TC	4	8	175787	175794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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