MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Parachlamydia acanthamoebae UV-7 chromosome

Total Repeats: 1006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015702	TACAAA	2	12	7006	7017	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	338174002
2	NC_015702	GTCTTA	2	12	9165	9176	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015702	GGAAGC	2	12	12180	12191	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	338174005
4	NC_015702	TCTCTT	2	12	12550	12561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338174005
5	NC_015702	TTCCGT	2	12	25291	25302	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338174014
6	NC_015702	AGCAAA	2	12	30923	30934	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338174019
7	NC_015702	GTTTGT	2	12	31170	31181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338174020
8	NC_015702	GAAAAA	2	12	35133	35144	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015702	TTTTAA	2	12	35290	35301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015702	AAATTT	2	12	40077	40088	50 %	50 %	0 %	0 %	338174028
11	NC_015702	TCTTTT	2	12	41174	41185	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338174030
12	NC_015702	GTTTAT	2	12	42429	42440	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338174031
13	NC_015702	AGCTGG	2	12	44449	44460	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338174033
14	NC_015702	ATTCAA	2	12	46370	46381	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338174036
15	NC_015702	TTATGG	2	12	51382	51393	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338174040
16	NC_015702	TGTTTA	2	12	51414	51425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338174040
17	NC_015702	TTATGG	2	12	54850	54861	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338174044
18	NC_015702	TGTTTA	2	12	54882	54893	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338174044
19	NC_015702	GTGGAT	2	12	60077	60088	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338174049
20	NC_015702	TGGACC	2	12	60103	60114	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338174049
21	NC_015702	CTAGTT	2	12	70738	70749	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338174063
22	NC_015702	TTTTCA	2	12	70827	70838	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338174063
23	NC_015702	GCTGAC	2	12	71785	71796	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338174063
24	NC_015702	CCATAT	2	12	77048	77059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338174067
25	NC_015702	ATTTTT	2	12	77985	77996	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	338174067
26	NC_015702	TGCATT	2	12	78195	78206	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338174068
27	NC_015702	TCATTG	2	12	78273	78284	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338174068
28	NC_015702	CAGCTA	2	12	79542	79553	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338174068
29	NC_015702	TTTTAA	2	12	80912	80923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338174070
30	NC_015702	TTCTTT	2	12	80958	80969	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338174070
31	NC_015702	TTTGAT	2	12	81883	81894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338174072
32	NC_015702	TGATAT	2	12	86470	86481	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338174076
33	NC_015702	TGCGAT	2	12	89333	89344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338174078
34	NC_015702	TGGGAT	2	12	91485	91496	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338174080
35	NC_015702	ATTGGC	2	12	92397	92408	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338174080
36	NC_015702	GCAGTA	2	12	96264	96275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338174083
37	NC_015702	TTCCTA	2	12	97992	98003	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338174084
38	NC_015702	TCTAAT	2	12	98873	98884	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338174084
39	NC_015702	TAAAAT	2	12	101460	101471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338174085
40	NC_015702	GAACAT	3	18	108165	108182	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338174091
41	NC_015702	TAATCG	2	12	114972	114983	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338174100
42	NC_015702	AAACTT	2	12	120510	120521	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338174105
43	NC_015702	TGCTTT	2	12	120783	120794	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338174106
44	NC_015702	GTCAAA	2	12	124893	124904	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338174110
45	NC_015702	GGAGCT	2	12	129901	129912	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338174113
46	NC_015702	CTTATC	2	12	132277	132288	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338174116
47	NC_015702	GCAATT	2	12	133845	133856	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338174117
48	NC_015702	TTTTTC	2	12	134314	134325	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338174117
49	NC_015702	TTTCCT	2	12	136817	136828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338174120
50	NC_015702	GCCTGA	2	12	137827	137838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338174121
51	NC_015702	AATCAA	2	12	142148	142159	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	338174128
52	NC_015702	AGAAAA	2	12	144054	144065	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338174130
53	NC_015702	GAAGTT	2	12	145233	145244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338174131
54	NC_015702	CGCTTG	2	12	148572	148583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338174132
55	NC_015702	AAGAGA	2	12	153808	153819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338174137
56	NC_015702	ATTGTG	2	12	155858	155869	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338174140
57	NC_015702	ATTTTA	2	12	156508	156519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338174141
58	NC_015702	TTCAAT	2	12	157006	157017	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338174142
59	NC_015702	TTTTGC	2	12	160667	160678	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338174146
60	NC_015702	AATGCG	2	12	161330	161341	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338174146
61	NC_015702	AATCAT	2	12	167847	167858	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338174155
62	NC_015702	GTTGCC	2	12	174620	174631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338174161
63	NC_015702	TGAAAA	2	12	175835	175846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338174162
64	NC_015702	CTGACG	2	12	189853	189864	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338174169
65	NC_015702	TTCCAT	2	12	191962	191973	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338174172
66	NC_015702	GCCTTT	2	12	191996	192007	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015702	AGCTTG	2	12	193714	193725	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338174178
68	NC_015702	AAATAA	2	12	194429	194440	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015702	TAATTG	2	12	201539	201550	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338174186
70	NC_015702	TTGTTT	2	12	204016	204027	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	338174187
71	NC_015702	ATAAAA	2	12	205009	205020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	338174187
72	NC_015702	AAAGAA	2	12	207657	207668	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015702	TTATCA	2	12	210065	210076	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338174192
74	NC_015702	GTGAAG	2	12	210900	210911	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338174193
75	NC_015702	TGTTTT	2	12	211586	211597	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	338174194
76	NC_015702	AACATT	2	12	214812	214823	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015702	ACCAAA	2	12	219535	219546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338174203
78	NC_015702	AGGCAT	2	12	220954	220965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338174205
79	NC_015702	TGGATA	2	12	222883	222894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338174206
80	NC_015702	TTTTTA	2	12	225713	225724	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015702	GTTGCA	2	12	227967	227978	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338174212
82	NC_015702	CTGTCG	2	12	228944	228955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338174214
83	NC_015702	ATCAAG	2	12	233877	233888	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338174217
84	NC_015702	TGCTGT	2	12	236028	236039	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338174218
85	NC_015702	TTGAAA	2	12	236207	236218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338174218
86	NC_015702	GCAAGC	2	12	236244	236255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338174218
87	NC_015702	GATGTA	2	12	237712	237723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338174220
88	NC_015702	AAGCAA	2	12	248215	248226	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338174230
89	NC_015702	GAAATA	2	12	248720	248731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338174230
90	NC_015702	TGTTAT	2	12	249039	249050	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338174231
91	NC_015702	GAAAAA	2	12	249337	249348	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338174231
92	NC_015702	CTTCCG	2	12	251173	251184	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338174231
93	NC_015702	AATCCC	2	12	254842	254853	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338174235
94	NC_015702	TGAATC	2	12	257594	257605	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338174237
95	NC_015702	TCCAGC	2	12	257783	257794	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338174237
96	NC_015702	AGAGCA	2	12	257990	258001	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338174237
97	NC_015702	TTTACG	2	12	261752	261763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338174239
98	NC_015702	TGGGGA	2	12	270324	270335	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	338174246
99	NC_015702	GAATAT	2	12	273226	273237	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338174248
100	NC_015702	TGCAAT	2	12	278568	278579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015702	GTTTGT	2	12	278817	278828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338174255
102	NC_015702	CTTACT	2	12	281503	281514	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338174259
103	NC_015702	CGAATT	2	12	284932	284943	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338174261
104	NC_015702	TGATTG	2	12	286586	286597	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338174262
105	NC_015702	CAATTT	2	12	288283	288294	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338174263
106	NC_015702	AATCTT	2	12	289173	289184	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338174263
107	NC_015702	TTGAGA	2	12	299656	299667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338174267
108	NC_015702	CAAAAG	2	12	305005	305016	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338174270
109	NC_015702	CATTTA	2	12	306066	306077	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338174271
110	NC_015702	TTTAAC	2	12	310032	310043	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338174275
111	NC_015702	ATCTTT	2	12	310814	310825	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338174275
112	NC_015702	CGATGA	2	12	318599	318610	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338174282
113	NC_015702	GGGAAG	2	12	318655	318666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338174282
114	NC_015702	GGCAAT	2	12	319528	319539	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338174282
115	NC_015702	AGCTTT	2	12	319738	319749	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338174283
116	NC_015702	TCAAAA	2	12	325543	325554	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	338174287
117	NC_015702	CGGATG	2	12	328971	328982	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338174289
118	NC_015702	TGCAGC	2	12	330310	330321	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338174290
119	NC_015702	GATTTT	2	12	332564	332575	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338174292
120	NC_015702	ATGGAA	2	12	338315	338326	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_015702	ATTTTT	2	12	409784	409795	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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349	NC_015702	TGACTG	2	12	1056251	1056262	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
350	NC_015702	GATGGT	2	12	1057099	1057110	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338174945
351	NC_015702	AGTTTT	2	12	1059081	1059092	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338174948
352	NC_015702	AAATGA	2	12	1062555	1062566	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338174953
353	NC_015702	TGGAAA	2	12	1063860	1063871	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
354	NC_015702	TGACTG	2	12	1064013	1064024	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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357	NC_015702	CAATGT	2	12	1067603	1067614	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338174961
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453	NC_015702	TTGGAA	2	12	1390993	1391004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338175224
454	NC_015702	AAGCAA	2	12	1391117	1391128	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338175224
455	NC_015702	GAAAAG	2	12	1394777	1394788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_015702	GCTGAT	2	12	1397132	1397143	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338175230
457	NC_015702	ATCAAA	2	12	1403503	1403514	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	338175239
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459	NC_015702	TTCTTT	2	12	1407442	1407453	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338175242
460	NC_015702	TCGTTT	2	12	1410687	1410698	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338175243
461	NC_015702	TGCTTT	2	12	1411352	1411363	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338175244
462	NC_015702	ATTGAA	2	12	1412020	1412031	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338175245
463	NC_015702	ATCTCT	2	12	1418417	1418428	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338175248
464	NC_015702	TTGTTC	2	12	1422260	1422271	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338175250
465	NC_015702	AAATTA	2	12	1424387	1424398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338175251
466	NC_015702	TTCTAT	2	12	1429069	1429080	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338175258
467	NC_015702	GATAGG	2	12	1435103	1435114	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338175263
468	NC_015702	TAAGCT	2	12	1445850	1445861	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338175269
469	NC_015702	TGTAGA	2	12	1446081	1446092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338175269
470	NC_015702	TAAGAA	2	12	1448394	1448405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338175271
471	NC_015702	TAGCGC	2	12	1448809	1448820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338175272
472	NC_015702	TGCCGT	2	12	1451632	1451643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338175274
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483	NC_015702	AGATTT	2	12	1478743	1478754	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_015702	ATCTTT	2	12	1485684	1485695	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
487	NC_015702	CTTGTT	2	12	1490523	1490534	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338175303
488	NC_015702	TTTTGT	2	12	1491525	1491536	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	338175305
489	NC_015702	TTCTGA	2	12	1492132	1492143	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338175305
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494	NC_015702	ATCCAC	2	12	1506979	1506990	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338175319
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499	NC_015702	TTCATT	2	12	1513264	1513275	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338175327
500	NC_015702	ATATGG	2	12	1514149	1514160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338175328

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