MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR584

Total Repeats: 292

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015701	ATT	2	6	4	9	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015701	TAA	2	6	56	61	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015701	ACC	2	6	102	107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015701	TAA	2	6	246	251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015701	TAT	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015701	TAT	2	6	331	336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015701	ACC	2	6	373	378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204607
8	NC_015701	CTA	2	6	437	442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204607
9	NC_015701	AAC	2	6	443	448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204607
10	NC_015701	TGA	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204607
11	NC_015701	ATC	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204607
12	NC_015701	GAG	2	6	623	628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338204607
13	NC_015701	TTG	2	6	698	703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204607
14	NC_015701	AAC	2	6	721	726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204608
15	NC_015701	AAT	2	6	783	788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204608
16	NC_015701	ATG	3	9	889	897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204608
17	NC_015701	AGA	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204608
18	NC_015701	TGA	2	6	1201	1206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204608
19	NC_015701	ACA	2	6	1535	1540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015701	TCA	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015701	CAA	2	6	1589	1594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015701	AAC	2	6	1661	1666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015701	TCA	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015701	CAC	2	6	1813	1818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015701	CGG	2	6	1839	1844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015701	GTT	2	6	1904	1909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204609
27	NC_015701	CTT	2	6	2049	2054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204609
28	NC_015701	AGT	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204609
29	NC_015701	TTC	2	6	2175	2180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204609
30	NC_015701	TAA	2	6	2220	2225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204609
31	NC_015701	GTT	2	6	2246	2251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204609
32	NC_015701	ATC	2	6	2448	2453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204609
33	NC_015701	GTG	2	6	2469	2474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338204609
34	NC_015701	CCT	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338204609
35	NC_015701	TCA	2	6	2638	2643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204609
36	NC_015701	ATC	2	6	2665	2670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204609
37	NC_015701	CTA	2	6	2747	2752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204609
38	NC_015701	CGT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204609
39	NC_015701	TAT	2	6	2801	2806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204609
40	NC_015701	TTG	2	6	2853	2858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204609
41	NC_015701	CCA	2	6	2870	2875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204609
42	NC_015701	CCA	2	6	2902	2907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204609
43	NC_015701	CTG	2	6	3038	3043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204609
44	NC_015701	TAC	2	6	3149	3154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204609
45	NC_015701	TTG	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204609
46	NC_015701	ACT	2	6	3300	3305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015701	AGT	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015701	CTT	2	6	3534	3539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015701	ACT	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015701	TAT	2	6	3700	3705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015701	TTA	2	6	3740	3745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015701	AAT	2	6	3747	3752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015701	ATT	2	6	3778	3783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015701	CAT	2	6	3929	3934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204610
55	NC_015701	ATC	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204610
56	NC_015701	CAA	2	6	3948	3953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204610
57	NC_015701	TCT	2	6	4069	4074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204610
58	NC_015701	TCC	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015701	CAT	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015701	TAA	2	6	4328	4333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015701	ATT	3	9	4378	4386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015701	ATG	2	6	4389	4394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015701	CAT	2	6	4457	4462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015701	TGC	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015701	CAC	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015701	AAC	2	6	4699	4704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015701	ACA	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015701	AGT	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204611
69	NC_015701	CAA	2	6	4937	4942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204611
70	NC_015701	CAT	2	6	5107	5112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204611
71	NC_015701	TAC	2	6	5343	5348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204611
72	NC_015701	ATT	2	6	5374	5379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204611
73	NC_015701	TCA	2	6	5389	5394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204611
74	NC_015701	GAC	2	6	5428	5433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338204611
75	NC_015701	ACT	2	6	5556	5561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204611
76	NC_015701	TAT	2	6	5663	5668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015701	CAT	3	9	5801	5809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015701	ACA	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015701	ATC	2	6	5869	5874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015701	TAA	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015701	ATA	2	6	5910	5915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015701	ATT	2	6	5958	5963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015701	TAG	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015701	CTT	2	6	6075	6080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015701	TGT	2	6	6360	6365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015701	GTA	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015701	ATT	2	6	6514	6519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015701	GTA	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015701	ATA	2	6	6552	6557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015701	GTA	2	6	6558	6563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015701	TAC	2	6	6575	6580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015701	TAC	2	6	6633	6638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015701	GTA	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015701	ATT	2	6	6674	6679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015701	ATT	2	6	6694	6699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015701	TAC	2	6	6709	6714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015701	GTA	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015701	TAT	3	9	6841	6849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015701	ACT	2	6	6910	6915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204612
100	NC_015701	TAC	2	6	7004	7009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204612
101	NC_015701	GAA	2	6	7010	7015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204612
102	NC_015701	GCA	2	6	7026	7031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338204612
103	NC_015701	ATG	2	6	7060	7065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204612
104	NC_015701	GAA	2	6	7078	7083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204612
105	NC_015701	TCT	2	6	7125	7130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204612
106	NC_015701	AGA	2	6	7140	7145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204612
107	NC_015701	AAC	2	6	7277	7282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204612
108	NC_015701	TCA	2	6	7310	7315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204612
109	NC_015701	ACC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204612
110	NC_015701	CTA	2	6	7367	7372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204612
111	NC_015701	AAT	2	6	7456	7461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204612
112	NC_015701	ATT	2	6	7483	7488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204612
113	NC_015701	AAT	2	6	7513	7518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204612
114	NC_015701	CGA	2	6	7566	7571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338204612
115	NC_015701	ATT	2	6	7588	7593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204612
116	NC_015701	ATT	2	6	7711	7716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204612
117	NC_015701	AAG	2	6	7781	7786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204613
118	NC_015701	GCA	2	6	7886	7891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338204613
119	NC_015701	TTA	2	6	7950	7955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204613
120	NC_015701	ATG	2	6	8062	8067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204613
121	NC_015701	TAC	2	6	8153	8158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015701	TAG	2	6	8172	8177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015701	AGT	2	6	8258	8263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204614
124	NC_015701	TTG	2	6	8306	8311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204614
125	NC_015701	CAT	2	6	8399	8404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204614
126	NC_015701	ATA	2	6	8441	8446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204614
127	NC_015701	TCG	2	6	8481	8486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204614
128	NC_015701	TCG	2	6	8517	8522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204614
129	NC_015701	CAT	2	6	8668	8673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204614
130	NC_015701	ATT	2	6	8738	8743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204614
131	NC_015701	TAA	2	6	8888	8893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015701	GAA	2	6	8894	8899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015701	ATA	2	6	8900	8905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015701	ATG	2	6	8925	8930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204615
135	NC_015701	TTC	2	6	8968	8973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204615
136	NC_015701	TTA	2	6	9028	9033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204615
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262	NC_015701	CTT	2	6	17382	17387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204621
263	NC_015701	TTG	2	6	17478	17483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204621
264	NC_015701	CAA	2	6	17553	17558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204621
265	NC_015701	GCC	2	6	17584	17589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338204621
266	NC_015701	TGC	2	6	17591	17596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204621
267	NC_015701	GTT	2	6	17639	17644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204621
268	NC_015701	TCC	2	6	17782	17787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_015701	TTA	2	6	17829	17834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_015701	AAT	2	6	17853	17858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_015701	ATA	2	6	17905	17910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_015701	TCT	2	6	18008	18013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_015701	ATC	3	9	18069	18077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204622
274	NC_015701	AGT	2	6	18086	18091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204622
275	NC_015701	CAT	2	6	18131	18136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204622
276	NC_015701	TGA	2	6	18151	18156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204622
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278	NC_015701	TAT	2	6	18401	18406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204623
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282	NC_015701	TAA	2	6	18621	18626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204623
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288	NC_015701	ATT	2	6	18956	18961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204623
289	NC_015701	CAC	2	6	18991	18996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204623
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291	NC_015701	TCC	2	6	19029	19034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_015701	ATA	2	6	19038	19043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.