MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR584

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015701	A	6	6	170	175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015701	A	7	7	208	214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015701	T	6	6	315	320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015701	A	6	6	532	537	100 %	0 %	0 %	0 %	338204607
5	NC_015701	A	6	6	1331	1336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015701	A	6	6	1392	1397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015701	A	6	6	1436	1441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015701	T	6	6	1457	1462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015701	T	6	6	1542	1547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015701	T	6	6	3764	3769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015701	T	8	8	4013	4020	0 %	100 %	0 %	0 %	338204610
12	NC_015701	T	6	6	4106	4111	0 %	100 %	0 %	0 %	338204610
13	NC_015701	T	7	7	4143	4149	0 %	100 %	0 %	0 %	338204610
14	NC_015701	T	6	6	4170	4175	0 %	100 %	0 %	0 %	338204610
15	NC_015701	T	7	7	4230	4236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015701	T	6	6	4296	4301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015701	A	6	6	4363	4368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015701	T	7	7	4450	4456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015701	T	6	6	4501	4506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015701	A	7	7	4535	4541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015701	A	7	7	4752	4758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015701	A	6	6	4805	4810	100 %	0 %	0 %	0 %	338204611
23	NC_015701	A	7	7	4913	4919	100 %	0 %	0 %	0 %	338204611
24	NC_015701	A	6	6	4954	4959	100 %	0 %	0 %	0 %	338204611
25	NC_015701	A	6	6	5421	5426	100 %	0 %	0 %	0 %	338204611
26	NC_015701	A	7	7	5525	5531	100 %	0 %	0 %	0 %	338204611
27	NC_015701	T	6	6	6247	6252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015701	A	7	7	6609	6615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015701	T	7	7	6804	6810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015701	A	6	6	7052	7057	100 %	0 %	0 %	0 %	338204612
31	NC_015701	A	6	6	7196	7201	100 %	0 %	0 %	0 %	338204612
32	NC_015701	T	6	6	7429	7434	0 %	100 %	0 %	0 %	338204612
33	NC_015701	A	7	7	7893	7899	100 %	0 %	0 %	0 %	338204613
34	NC_015701	A	8	8	8104	8111	100 %	0 %	0 %	0 %	338204613
35	NC_015701	A	6	6	8143	8148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015701	T	6	6	8184	8189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015701	T	6	6	8210	8215	0 %	100 %	0 %	0 %	338204614
38	NC_015701	T	6	6	8376	8381	0 %	100 %	0 %	0 %	338204614
39	NC_015701	T	6	6	8801	8806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015701	A	7	7	8824	8830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015701	T	6	6	9344	9349	0 %	100 %	0 %	0 %	338204615
42	NC_015701	A	8	8	9849	9856	100 %	0 %	0 %	0 %	338204615
43	NC_015701	T	6	6	10089	10094	0 %	100 %	0 %	0 %	338204615
44	NC_015701	A	6	6	10119	10124	100 %	0 %	0 %	0 %	338204615
45	NC_015701	A	6	6	10361	10366	100 %	0 %	0 %	0 %	338204615
46	NC_015701	A	7	7	10943	10949	100 %	0 %	0 %	0 %	338204616
47	NC_015701	A	6	6	10962	10967	100 %	0 %	0 %	0 %	338204616
48	NC_015701	T	6	6	11007	11012	0 %	100 %	0 %	0 %	338204616
49	NC_015701	A	6	6	11363	11368	100 %	0 %	0 %	0 %	338204616
50	NC_015701	A	7	7	12255	12261	100 %	0 %	0 %	0 %	338204616
51	NC_015701	A	6	6	12815	12820	100 %	0 %	0 %	0 %	338204616
52	NC_015701	T	7	7	13987	13993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015701	A	6	6	14053	14058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015701	T	6	6	14409	14414	0 %	100 %	0 %	0 %	338204618
55	NC_015701	T	6	6	14750	14755	0 %	100 %	0 %	0 %	338204619
56	NC_015701	A	7	7	17891	17897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015701	T	7	7	18059	18065	0 %	100 %	0 %	0 %	338204622
58	NC_015701	T	7	7	18106	18112	0 %	100 %	0 %	0 %	338204622
59	NC_015701	T	6	6	18738	18743	0 %	100 %	0 %	0 %	338204623
60	NC_015701	A	8	8	18940	18947	100 %	0 %	0 %	0 %	338204623

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.