MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR581

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015700	GCGG	2	8	2731	2738	0 %	0 %	75 %	25 %	338202325
2	NC_015700	ACAG	2	8	3137	3144	50 %	0 %	25 %	25 %	338202325
3	NC_015700	GATG	2	8	3148	3155	25 %	25 %	50 %	0 %	338202325
4	NC_015700	ATGG	2	8	3184	3191	25 %	25 %	50 %	0 %	338202325
5	NC_015700	TGGC	2	8	3194	3201	0 %	25 %	50 %	25 %	338202325
6	NC_015700	TGGA	2	8	3588	3595	25 %	25 %	50 %	0 %	338202325
7	NC_015700	TAGA	2	8	3679	3686	50 %	25 %	25 %	0 %	338202325
8	NC_015700	CATC	2	8	3786	3793	25 %	25 %	0 %	50 %	338202325
9	NC_015700	GGAA	2	8	4293	4300	50 %	0 %	50 %	0 %	338202325
10	NC_015700	GTCC	2	8	4351	4358	0 %	25 %	25 %	50 %	338202325
11	NC_015700	AAGG	2	8	5701	5708	50 %	0 %	50 %	0 %	338202327
12	NC_015700	AAAT	2	8	5711	5718	75 %	25 %	0 %	0 %	338202327
13	NC_015700	ATAA	2	8	5776	5783	75 %	25 %	0 %	0 %	338202327
14	NC_015700	GTTG	2	8	6036	6043	0 %	50 %	50 %	0 %	338202328
15	NC_015700	TAAG	2	8	6139	6146	50 %	25 %	25 %	0 %	338202328
16	NC_015700	TAAA	2	8	7094	7101	75 %	25 %	0 %	0 %	338202331
17	NC_015700	GACC	2	8	7389	7396	25 %	0 %	25 %	50 %	338202331
18	NC_015700	ATCA	2	8	9402	9409	50 %	25 %	0 %	25 %	338202334
19	NC_015700	TAAG	2	8	9554	9561	50 %	25 %	25 %	0 %	338202334
20	NC_015700	CTTT	2	8	10007	10014	0 %	75 %	0 %	25 %	338202335
21	NC_015700	GTTA	2	8	11010	11017	25 %	50 %	25 %	0 %	338202335
22	NC_015700	AATG	2	8	11381	11388	50 %	25 %	25 %	0 %	338202335
23	NC_015700	CTTT	2	8	11717	11724	0 %	75 %	0 %	25 %	338202335

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.