MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR581

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015700	TAA	2	6	13	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015700	CTT	2	6	556	561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015700	AAC	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015700	TTA	2	6	2043	2048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015700	GTT	2	6	2137	2142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015700	GGA	2	6	2150	2155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015700	AAT	2	6	2164	2169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015700	AAG	2	6	2427	2432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015700	TGT	2	6	2452	2457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015700	TCC	2	6	4490	4495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_015700	CAG	2	6	4526	4531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015700	GAT	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015700	TTC	2	6	4823	4828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015700	CTG	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015700	GTG	2	6	4928	4933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015700	CCG	2	6	5002	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015700	ATA	2	6	5431	5436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015700	ATA	2	6	5459	5464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015700	TAT	2	6	6180	6185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015700	AGT	2	6	8099	8104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015700	TAA	2	6	8158	8163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015700	TTA	2	6	8164	8169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015700	GAA	2	6	8254	8259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015700	TAA	3	9	9829	9837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015700	CAT	2	6	12049	12054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015700	TAA	2	6	12069	12074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015700	CTG	2	6	12145	12150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.