MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR580

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015699	CCGG	2	8	891	898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015699	ATTG	2	8	1378	1385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015699	TCCC	2	8	1495	1502	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_015699	CACC	2	8	1633	1640	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_015699	CCGT	2	8	1983	1990	0 %	25 %	25 %	50 %	338202353
6	NC_015699	CCTG	2	8	2489	2496	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015699	GGAG	2	8	2756	2763	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015699	CCTC	2	8	2786	2793	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_015699	CTGA	2	8	2808	2815	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015699	AACT	2	8	3076	3083	50 %	25 %	0 %	25 %	338202354
11	NC_015699	TGGT	2	8	3592	3599	0 %	50 %	50 %	0 %	338202355
12	NC_015699	GTTG	2	8	3606	3613	0 %	50 %	50 %	0 %	338202355
13	NC_015699	TTCA	2	8	4399	4406	25 %	50 %	0 %	25 %	338202356
14	NC_015699	GTTG	2	8	4760	4767	0 %	50 %	50 %	0 %	338202356
15	NC_015699	TTGT	2	8	4984	4991	0 %	75 %	25 %	0 %	338202356
16	NC_015699	GAAT	2	8	5492	5499	50 %	25 %	25 %	0 %	338202356
17	NC_015699	GAAC	2	8	5527	5534	50 %	0 %	25 %	25 %	338202356
18	NC_015699	TCAC	2	8	5575	5582	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015699	AAAG	2	8	5980	5987	75 %	0 %	25 %	0 %	338202357
20	NC_015699	TAAA	2	8	6048	6055	75 %	25 %	0 %	0 %	338202357
21	NC_015699	GGTT	2	8	6311	6318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015699	AATT	2	8	6429	6436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015699	TCAA	2	8	6728	6735	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.