MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR585

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015698	TTAT	2	8	6	13	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015698	TATT	2	8	197	204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015698	TGAC	2	8	278	285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015698	GTCA	2	8	307	314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015698	TTTA	2	8	657	664	25 %	75 %	0 %	0 %	338202337
6	NC_015698	AAGC	2	8	1112	1119	50 %	0 %	25 %	25 %	338202337
7	NC_015698	CAAA	2	8	1349	1356	75 %	0 %	0 %	25 %	338202338
8	NC_015698	TTGG	2	8	1981	1988	0 %	50 %	50 %	0 %	338202338
9	NC_015698	GGCT	2	8	2148	2155	0 %	25 %	50 %	25 %	338202338
10	NC_015698	TCAT	2	8	2455	2462	25 %	50 %	0 %	25 %	338202338
11	NC_015698	CCAA	2	8	3021	3028	50 %	0 %	0 %	50 %	338202339
12	NC_015698	ATTG	2	8	3514	3521	25 %	50 %	25 %	0 %	338202339
13	NC_015698	GAAA	2	8	4231	4238	75 %	0 %	25 %	0 %	338202340
14	NC_015698	TTCA	2	8	4549	4556	25 %	50 %	0 %	25 %	338202341
15	NC_015698	CCGA	2	8	4888	4895	25 %	0 %	25 %	50 %	338202341
16	NC_015698	TTTG	2	8	5347	5354	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015698	AGAT	2	8	6102	6109	50 %	25 %	25 %	0 %	338202342
18	NC_015698	AGTG	2	8	6477	6484	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015698	AAAT	2	8	7095	7102	75 %	25 %	0 %	0 %	338202343
20	NC_015698	TAAA	2	8	7243	7250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015698	AGGG	2	8	7371	7378	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015698	TTTG	2	8	7495	7502	0 %	75 %	25 %	0 %	338202344
23	NC_015698	TATT	2	8	7784	7791	25 %	75 %	0 %	0 %	338202344
24	NC_015698	CTTA	2	8	7962	7969	25 %	50 %	0 %	25 %	338202344
25	NC_015698	TGGT	2	8	8319	8326	0 %	50 %	50 %	0 %	338202344
26	NC_015698	ACTA	2	8	8507	8514	50 %	25 %	0 %	25 %	338202344
27	NC_015698	TAAA	2	8	9141	9148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015698	AATT	2	8	9249	9256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015698	AACC	2	8	9611	9618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015698	ATGG	2	8	9827	9834	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015698	TTTG	2	8	9913	9920	0 %	75 %	25 %	0 %	338202346
32	NC_015698	TTGG	2	8	10078	10085	0 %	50 %	50 %	0 %	338202346
33	NC_015698	TTGG	2	8	10261	10268	0 %	50 %	50 %	0 %	338202346
34	NC_015698	ATTA	2	8	10316	10323	50 %	50 %	0 %	0 %	338202346
35	NC_015698	GTTT	2	8	10485	10492	0 %	75 %	25 %	0 %	338202346
36	NC_015698	AATG	2	8	11347	11354	50 %	25 %	25 %	0 %	338202346
37	NC_015698	TAAA	2	8	12731	12738	75 %	25 %	0 %	0 %	338202348
38	NC_015698	AATT	2	8	12931	12938	50 %	50 %	0 %	0 %	338202348
39	NC_015698	GCGA	2	8	12952	12959	25 %	0 %	50 %	25 %	338202348
40	NC_015698	TGGT	2	8	13044	13051	0 %	50 %	50 %	0 %	338202348
41	NC_015698	TCAC	2	8	13930	13937	25 %	25 %	0 %	50 %	338202350

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.