MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR585

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015698	TTTA	2	8	657	664	25 %	75 %	0 %	0 %	338202337
2	NC_015698	AAGC	2	8	1112	1119	50 %	0 %	25 %	25 %	338202337
3	NC_015698	CAAA	2	8	1349	1356	75 %	0 %	0 %	25 %	338202338
4	NC_015698	TTGG	2	8	1981	1988	0 %	50 %	50 %	0 %	338202338
5	NC_015698	GGCT	2	8	2148	2155	0 %	25 %	50 %	25 %	338202338
6	NC_015698	TCAT	2	8	2455	2462	25 %	50 %	0 %	25 %	338202338
7	NC_015698	CCAA	2	8	3021	3028	50 %	0 %	0 %	50 %	338202339
8	NC_015698	ATTG	2	8	3514	3521	25 %	50 %	25 %	0 %	338202339
9	NC_015698	GAAA	2	8	4231	4238	75 %	0 %	25 %	0 %	338202340
10	NC_015698	TTCA	2	8	4549	4556	25 %	50 %	0 %	25 %	338202341
11	NC_015698	CCGA	2	8	4888	4895	25 %	0 %	25 %	50 %	338202341
12	NC_015698	AGAT	2	8	6102	6109	50 %	25 %	25 %	0 %	338202342
13	NC_015698	AAAT	2	8	7095	7102	75 %	25 %	0 %	0 %	338202343
14	NC_015698	TTTG	2	8	7495	7502	0 %	75 %	25 %	0 %	338202344
15	NC_015698	TATT	2	8	7784	7791	25 %	75 %	0 %	0 %	338202344
16	NC_015698	CTTA	2	8	7962	7969	25 %	50 %	0 %	25 %	338202344
17	NC_015698	TGGT	2	8	8319	8326	0 %	50 %	50 %	0 %	338202344
18	NC_015698	ACTA	2	8	8507	8514	50 %	25 %	0 %	25 %	338202344
19	NC_015698	TTTG	2	8	9913	9920	0 %	75 %	25 %	0 %	338202346
20	NC_015698	TTGG	2	8	10078	10085	0 %	50 %	50 %	0 %	338202346
21	NC_015698	TTGG	2	8	10261	10268	0 %	50 %	50 %	0 %	338202346
22	NC_015698	ATTA	2	8	10316	10323	50 %	50 %	0 %	0 %	338202346
23	NC_015698	GTTT	2	8	10485	10492	0 %	75 %	25 %	0 %	338202346
24	NC_015698	AATG	2	8	11347	11354	50 %	25 %	25 %	0 %	338202346
25	NC_015698	TAAA	2	8	12731	12738	75 %	25 %	0 %	0 %	338202348
26	NC_015698	AATT	2	8	12931	12938	50 %	50 %	0 %	0 %	338202348
27	NC_015698	GCGA	2	8	12952	12959	25 %	0 %	50 %	25 %	338202348
28	NC_015698	TGGT	2	8	13044	13051	0 %	50 %	50 %	0 %	338202348
29	NC_015698	TCAC	2	8	13930	13937	25 %	25 %	0 %	50 %	338202350

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.