MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 6428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015697	TTAT	2	8	379	386	25 %	75 %	0 %	0 %	338202360
2	NC_015697	AATG	2	8	401	408	50 %	25 %	25 %	0 %	338202360
3	NC_015697	TAAT	2	8	1150	1157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015697	CTTG	2	8	1910	1917	0 %	50 %	25 %	25 %	338202361
5	NC_015697	AATT	2	8	2368	2375	50 %	50 %	0 %	0 %	338202361
6	NC_015697	GTTT	2	8	2620	2627	0 %	75 %	25 %	0 %	338202362
7	NC_015697	ATAA	2	8	2894	2901	75 %	25 %	0 %	0 %	338202362
8	NC_015697	TTAA	2	8	3051	3058	50 %	50 %	0 %	0 %	338202362
9	NC_015697	TGCT	2	8	3158	3165	0 %	50 %	25 %	25 %	338202362
10	NC_015697	TTCA	2	8	3326	3333	25 %	50 %	0 %	25 %	338202362
11	NC_015697	TAAT	2	8	4473	4480	50 %	50 %	0 %	0 %	338202364
12	NC_015697	TCAA	2	8	4824	4831	50 %	25 %	0 %	25 %	338202364
13	NC_015697	GAAA	2	8	4870	4877	75 %	0 %	25 %	0 %	338202364
14	NC_015697	GGAT	2	8	5304	5311	25 %	25 %	50 %	0 %	338202364
15	NC_015697	ATAG	2	8	5447	5454	50 %	25 %	25 %	0 %	338202364
16	NC_015697	AGGA	2	8	5938	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	338202365
17	NC_015697	GTTG	2	8	6180	6187	0 %	50 %	50 %	0 %	338202366
18	NC_015697	ATTT	2	8	6359	6366	25 %	75 %	0 %	0 %	338202366
19	NC_015697	AGAT	2	8	6430	6437	50 %	25 %	25 %	0 %	338202366
20	NC_015697	TGAT	2	8	6717	6724	25 %	50 %	25 %	0 %	338202367
21	NC_015697	AACA	2	8	7271	7278	75 %	0 %	0 %	25 %	338202367
22	NC_015697	TCCT	2	8	7899	7906	0 %	50 %	0 %	50 %	338202368
23	NC_015697	CTTG	2	8	7941	7948	0 %	50 %	25 %	25 %	338202368
24	NC_015697	TCGC	2	8	8101	8108	0 %	25 %	25 %	50 %	338202368
25	NC_015697	TAAC	2	8	9146	9153	50 %	25 %	0 %	25 %	338202369
26	NC_015697	TCAT	2	8	9448	9455	25 %	50 %	0 %	25 %	338202370
27	NC_015697	TGAT	2	8	9891	9898	25 %	50 %	25 %	0 %	338202371
28	NC_015697	CGGC	2	8	9935	9942	0 %	0 %	50 %	50 %	338202371
29	NC_015697	CAAT	2	8	10142	10149	50 %	25 %	0 %	25 %	338202371
30	NC_015697	TGCA	2	8	10919	10926	25 %	25 %	25 %	25 %	338202372
31	NC_015697	GGAC	2	8	11281	11288	25 %	0 %	50 %	25 %	338202373
32	NC_015697	AATT	2	8	11544	11551	50 %	50 %	0 %	0 %	338202373
33	NC_015697	CATT	2	8	11567	11574	25 %	50 %	0 %	25 %	338202373
34	NC_015697	TAAT	2	8	11844	11851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015697	TTTC	2	8	11985	11992	0 %	75 %	0 %	25 %	338202374
36	NC_015697	ACCA	2	8	12109	12116	50 %	0 %	0 %	50 %	338202374
37	NC_015697	TCAA	2	8	12319	12326	50 %	25 %	0 %	25 %	338202374
38	NC_015697	ATGC	2	8	13258	13265	25 %	25 %	25 %	25 %	338202375
39	NC_015697	CAAT	2	8	13410	13417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015697	TATC	2	8	14137	14144	25 %	50 %	0 %	25 %	338202376
41	NC_015697	CAAT	2	8	15213	15220	50 %	25 %	0 %	25 %	338202377
42	NC_015697	GTTA	2	8	15314	15321	25 %	50 %	25 %	0 %	338202377
43	NC_015697	TAAA	2	8	16352	16359	75 %	25 %	0 %	0 %	338202377
44	NC_015697	TAAT	2	8	17956	17963	50 %	50 %	0 %	0 %	338202379
45	NC_015697	TTTA	2	8	18083	18090	25 %	75 %	0 %	0 %	338202379
46	NC_015697	TTTC	2	8	18147	18154	0 %	75 %	0 %	25 %	338202379
47	NC_015697	CAAC	2	8	18383	18390	50 %	0 %	0 %	50 %	338202379
48	NC_015697	TAAA	2	8	18830	18837	75 %	25 %	0 %	0 %	338202380
49	NC_015697	AACC	2	8	19545	19552	50 %	0 %	0 %	50 %	338202381
50	NC_015697	TTCT	2	8	19758	19765	0 %	75 %	0 %	25 %	338202381
51	NC_015697	GATT	2	8	19808	19815	25 %	50 %	25 %	0 %	338202381
52	NC_015697	TAGT	2	8	19871	19878	25 %	50 %	25 %	0 %	338202381
53	NC_015697	TTTC	2	8	20133	20140	0 %	75 %	0 %	25 %	338202381
54	NC_015697	AACC	2	8	20376	20383	50 %	0 %	0 %	50 %	338202382
55	NC_015697	AAAG	2	8	20796	20803	75 %	0 %	25 %	0 %	338202382
56	NC_015697	ATAA	2	8	20952	20959	75 %	25 %	0 %	0 %	338202382
57	NC_015697	GTAA	2	8	21446	21453	50 %	25 %	25 %	0 %	338202384
58	NC_015697	TCAA	2	8	21497	21504	50 %	25 %	0 %	25 %	338202384
59	NC_015697	ATCA	2	8	21553	21560	50 %	25 %	0 %	25 %	338202384
60	NC_015697	TGCT	2	8	22181	22188	0 %	50 %	25 %	25 %	338202385
61	NC_015697	CGAC	2	8	22320	22327	25 %	0 %	25 %	50 %	338202385
62	NC_015697	GTTG	2	8	22347	22354	0 %	50 %	50 %	0 %	338202385
63	NC_015697	TTTA	2	8	22862	22869	25 %	75 %	0 %	0 %	338202385
64	NC_015697	CCGC	2	8	23366	23373	0 %	0 %	25 %	75 %	338202386
65	NC_015697	ATTT	2	8	24018	24025	25 %	75 %	0 %	0 %	338202386
66	NC_015697	AAGG	2	8	24139	24146	50 %	0 %	50 %	0 %	338202386
67	NC_015697	GACT	2	8	24356	24363	25 %	25 %	25 %	25 %	338202386
68	NC_015697	AGCA	2	8	24570	24577	50 %	0 %	25 %	25 %	338202386
69	NC_015697	CTTT	2	8	24743	24750	0 %	75 %	0 %	25 %	338202386
70	NC_015697	GTAA	2	8	24872	24879	50 %	25 %	25 %	0 %	338202386
71	NC_015697	CCCA	2	8	26151	26158	25 %	0 %	0 %	75 %	338202386
72	NC_015697	AAGC	2	8	26263	26270	50 %	0 %	25 %	25 %	338202386
73	NC_015697	TTCT	2	8	26403	26410	0 %	75 %	0 %	25 %	338202386
74	NC_015697	CTTG	2	8	26588	26595	0 %	50 %	25 %	25 %	338202386
75	NC_015697	TTGA	2	8	26771	26778	25 %	50 %	25 %	0 %	338202387
76	NC_015697	AAGT	2	8	26815	26822	50 %	25 %	25 %	0 %	338202387
77	NC_015697	TTGA	2	8	27066	27073	25 %	50 %	25 %	0 %	338202387
78	NC_015697	AATT	2	8	27182	27189	50 %	50 %	0 %	0 %	338202387
79	NC_015697	TTAA	2	8	27771	27778	50 %	50 %	0 %	0 %	338202387
80	NC_015697	AGTA	2	8	27821	27828	50 %	25 %	25 %	0 %	338202387
81	NC_015697	AAAT	2	8	27868	27875	75 %	25 %	0 %	0 %	338202388
82	NC_015697	GATA	2	8	27937	27944	50 %	25 %	25 %	0 %	338202388
83	NC_015697	TTAT	2	8	28029	28036	25 %	75 %	0 %	0 %	338202388
84	NC_015697	AGTA	2	8	29114	29121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015697	TATG	2	8	29144	29151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015697	AATT	2	8	29286	29293	50 %	50 %	0 %	0 %	338202389
87	NC_015697	CTTA	2	8	29588	29595	25 %	50 %	0 %	25 %	338202389
88	NC_015697	ATGG	2	8	29877	29884	25 %	25 %	50 %	0 %	338202390
89	NC_015697	AAAT	2	8	30175	30182	75 %	25 %	0 %	0 %	338202390
90	NC_015697	AGCC	2	8	30677	30684	25 %	0 %	25 %	50 %	338202390
91	NC_015697	AAAC	2	8	30727	30734	75 %	0 %	0 %	25 %	338202390
92	NC_015697	TTGA	2	8	31193	31200	25 %	50 %	25 %	0 %	338202391
93	NC_015697	AAAT	2	8	31544	31551	75 %	25 %	0 %	0 %	338202392
94	NC_015697	GTTG	2	8	31569	31576	0 %	50 %	50 %	0 %	338202392
95	NC_015697	CAAT	2	8	32149	32156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015697	TATC	2	8	32877	32884	25 %	50 %	0 %	25 %	338202395
97	NC_015697	CGTA	2	8	33583	33590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015697	ATAA	2	8	33780	33787	75 %	25 %	0 %	0 %	338202396
99	NC_015697	CCCG	2	8	34066	34073	0 %	0 %	25 %	75 %	338202396
100	NC_015697	TTTC	2	8	34915	34922	0 %	75 %	0 %	25 %	338202396
101	NC_015697	TTAC	2	8	35644	35651	25 %	50 %	0 %	25 %	338202397
102	NC_015697	TCAA	2	8	35894	35901	50 %	25 %	0 %	25 %	338202397
103	NC_015697	ATCG	2	8	36203	36210	25 %	25 %	25 %	25 %	338202397
104	NC_015697	AAAT	2	8	36661	36668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015697	CAAT	2	8	36858	36865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015697	ACCC	2	8	38013	38020	25 %	0 %	0 %	75 %	338202399
107	NC_015697	AATA	2	8	38031	38038	75 %	25 %	0 %	0 %	338202399
108	NC_015697	ATTT	2	8	38467	38474	25 %	75 %	0 %	0 %	338202400
109	NC_015697	CTAG	2	8	38843	38850	25 %	25 %	25 %	25 %	338202400
110	NC_015697	TATC	2	8	39719	39726	25 %	50 %	0 %	25 %	338202402
111	NC_015697	TTTC	2	8	40247	40254	0 %	75 %	0 %	25 %	338202402
112	NC_015697	AGAA	2	8	40275	40282	75 %	0 %	25 %	0 %	338202403
113	NC_015697	AAGT	2	8	40499	40506	50 %	25 %	25 %	0 %	338202403
114	NC_015697	ATTG	2	8	40518	40525	25 %	50 %	25 %	0 %	338202403
115	NC_015697	TAAG	2	8	41003	41010	50 %	25 %	25 %	0 %	338202403
116	NC_015697	CTTT	2	8	41249	41256	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015697	ACTT	2	8	41728	41735	25 %	50 %	0 %	25 %	338202404
118	NC_015697	GTTC	2	8	42531	42538	0 %	50 %	25 %	25 %	338202404
119	NC_015697	CCAT	2	8	42854	42861	25 %	25 %	0 %	50 %	338202404
120	NC_015697	CATT	2	8	43506	43513	25 %	50 %	0 %	25 %	338202404
121	NC_015697	TAAT	2	8	43709	43716	50 %	50 %	0 %	0 %	338202404
122	NC_015697	TCCT	2	8	43773	43780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015697	ATTT	2	8	43804	43811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015697	ATGA	2	8	43887	43894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015697	TCCT	2	8	44236	44243	0 %	50 %	0 %	50 %	338202405
126	NC_015697	TTTA	2	8	44418	44425	25 %	75 %	0 %	0 %	338202405
127	NC_015697	TTTC	2	8	44509	44516	0 %	75 %	0 %	25 %	338202405
128	NC_015697	CTAT	2	8	45011	45018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015697	CATA	2	8	45215	45222	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015697	CTGT	2	8	45585	45592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015697	CCTA	2	8	45821	45828	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015697	GGCT	2	8	46194	46201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015697	TGCA	2	8	47324	47331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015697	TCGC	2	8	47710	47717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015697	TTTC	2	8	47738	47745	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015697	GCTA	2	8	47793	47800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015697	TTAA	2	8	48016	48023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015697	CACG	2	8	49254	49261	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015697	CAAA	2	8	49514	49521	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015697	CACT	2	8	49620	49627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015697	ATCA	2	8	49659	49666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015697	ATTA	2	8	49920	49927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_015697	TATC	2	8	50110	50117	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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