MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella sp. TX077308 chromosome

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015696	TAAAAG	2	12	11455	11466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015696	TAAAAA	2	12	20707	20718	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015696	TTATTT	2	12	26911	26922	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015696	CTTAAT	2	12	43447	43458	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015696	ATTTTT	2	12	125507	125518	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015696	AATATT	2	12	139324	139335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015696	ATTTCC	2	12	158414	158425	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015696	TTAAAA	2	12	178400	178411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015696	AATTAA	2	12	180574	180585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015696	ATAAAT	2	12	265873	265884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015696	AAAGTA	2	12	265914	265925	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015696	AAATAT	2	12	267124	267135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015696	AACTTA	2	12	277883	277894	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015696	AGTATA	2	12	287147	287158	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015696	ATAAAA	2	12	302989	303000	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015696	TTTTAT	2	12	306286	306297	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015696	TTTTAT	2	12	315314	315325	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015696	AGAGTA	2	12	339511	339522	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015696	TATAAT	2	12	388635	388646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015696	AAATTA	2	12	434365	434376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015696	AGCTTT	2	12	440572	440583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015696	TGAAAT	2	12	462137	462148	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015696	TATAAG	2	12	476196	476207	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015696	TACTTT	2	12	482265	482276	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015696	ATGATA	2	12	512647	512658	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015696	TATTTA	2	12	560319	560330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015696	GATTTA	2	12	594157	594168	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015696	TTATAG	2	12	616853	616864	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015696	TTTACA	2	12	638846	638857	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015696	GAATAA	2	12	663244	663255	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015696	TATAAG	2	12	767096	767107	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015696	ATATTT	2	12	772830	772841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015696	TAATCA	2	12	800035	800046	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015696	GTTATA	2	12	828782	828793	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015696	CTGTAT	2	12	853028	853039	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015696	TTATGC	2	12	920755	920766	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015696	AAAATT	2	12	931859	931870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015696	ATATAA	2	12	948161	948172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015696	AAAATA	2	12	967220	967231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015696	TGAAAT	2	12	1052178	1052189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015696	TAAAAT	2	12	1072856	1072867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015696	CAGGCT	2	12	1131547	1131558	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015696	TGAATA	2	12	1162223	1162234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015696	TATAAA	2	12	1177395	1177406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015696	TAAAAA	2	12	1231286	1231297	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015696	ATATAA	2	12	1237177	1237188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015696	TTTTAA	2	12	1243130	1243141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015696	ATTTAA	2	12	1301207	1301218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015696	TATAAT	2	12	1302475	1302486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015696	TTTAAT	2	12	1333399	1333410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015696	AGTAAT	2	12	1344914	1344925	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015696	TTTAAA	2	12	1363320	1363331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015696	AAATAT	2	12	1433859	1433870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015696	TTTAAC	2	12	1491485	1491496	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015696	ATTCTC	2	12	1496376	1496387	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015696	TAAAAT	2	12	1499521	1499532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015696	TCTACC	2	12	1519428	1519439	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015696	GTTTTT	2	12	1519814	1519825	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015696	GCTTAG	2	12	1565595	1565606	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015696	AAATAC	2	12	1567373	1567384	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015696	CTTTTT	2	12	1575323	1575334	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015696	AACAAA	2	12	1623934	1623945	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015696	TTAATA	2	12	1643820	1643831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015696	AATATA	2	12	1697782	1697793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015696	AAACCA	2	12	1722452	1722463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015696	ATTAAA	2	12	1723518	1723529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015696	ATTTCA	2	12	1783522	1783533	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015696	ATTCTT	2	12	1786572	1786583	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015696	TTTTAA	2	12	1816927	1816938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015696	TACTCT	2	12	1846429	1846440	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015696	ATAATT	2	12	1853894	1853905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015696	AAATAT	2	12	1908017	1908028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015696	TTTATA	2	12	1921053	1921064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015696	AAAATT	2	12	1921085	1921096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015696	ATTTCA	2	12	1924387	1924398	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015696	ACTTTT	2	12	1938774	1938785	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015696	TTAACT	2	12	1942300	1942311	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015696	ATTTTT	2	12	1943816	1943827	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015696	ACATGG	2	12	1957870	1957881	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015696	ACATGG	2	12	1962296	1962307	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015696	TTTCTT	2	12	2035695	2035706	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.