MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL05

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015695	GATTG	2	10	1595	1604	20 %	40 %	40 %	0 %	338215006
2	NC_015695	CCATT	2	10	1630	1639	20 %	40 %	0 %	40 %	338215006
3	NC_015695	TTTTA	2	10	4193	4202	20 %	80 %	0 %	0 %	338215007
4	NC_015695	AAAAG	2	10	5118	5127	80 %	0 %	20 %	0 %	338215008
5	NC_015695	CAGAA	2	10	5804	5813	60 %	0 %	20 %	20 %	338215009
6	NC_015695	TTCCG	2	10	7904	7913	0 %	40 %	20 %	40 %	338215011
7	NC_015695	CCATC	2	10	9097	9106	20 %	20 %	0 %	60 %	338215011
8	NC_015695	ACCGT	2	10	10184	10193	20 %	20 %	20 %	40 %	338215012
9	NC_015695	CCTCT	2	10	10841	10850	0 %	40 %	0 %	60 %	338215013
10	NC_015695	GTTTT	2	10	12064	12073	0 %	80 %	20 %	0 %	338215013
11	NC_015695	AAAAG	2	10	12427	12436	80 %	0 %	20 %	0 %	338215013
12	NC_015695	TACTT	2	10	13510	13519	20 %	60 %	0 %	20 %	338215014
13	NC_015695	AACGG	2	10	14353	14362	40 %	0 %	40 %	20 %	338215015
14	NC_015695	TGAAA	2	10	15091	15100	60 %	20 %	20 %	0 %	338215015
15	NC_015695	CTTTG	2	10	17055	17064	0 %	60 %	20 %	20 %	338215017
16	NC_015695	ATAAA	2	10	23280	23289	80 %	20 %	0 %	0 %	338215023
17	NC_015695	TGGGT	2	10	23885	23894	0 %	40 %	60 %	0 %	338215023
18	NC_015695	AGTCA	2	10	28046	28055	40 %	20 %	20 %	20 %	338215027
19	NC_015695	ATGAA	2	10	32483	32492	60 %	20 %	20 %	0 %	338215030
20	NC_015695	AAGGC	2	10	33293	33302	40 %	0 %	40 %	20 %	338215030
21	NC_015695	TGAAT	2	10	35128	35137	40 %	40 %	20 %	0 %	338215033
22	NC_015695	CCGAA	2	10	35198	35207	40 %	0 %	20 %	40 %	338215033
23	NC_015695	ACAAT	2	10	35501	35510	60 %	20 %	0 %	20 %	338215033
24	NC_015695	GGCTT	2	10	35662	35671	0 %	40 %	40 %	20 %	338215033
25	NC_015695	ACCTG	2	10	36649	36658	20 %	20 %	20 %	40 %	338215035

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.