MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL05

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015695	AATG	2	8	151	158	50 %	25 %	25 %	0 %	338215005
2	NC_015695	GATC	2	8	841	848	25 %	25 %	25 %	25 %	338215005
3	NC_015695	TTGG	2	8	1150	1157	0 %	50 %	50 %	0 %	338215005
4	NC_015695	TAAC	2	8	1354	1361	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015695	TACG	2	8	2023	2030	25 %	25 %	25 %	25 %	338215006
6	NC_015695	CATC	2	8	2662	2669	25 %	25 %	0 %	50 %	338215006
7	NC_015695	TACG	2	8	3082	3089	25 %	25 %	25 %	25 %	338215006
8	NC_015695	TTGA	2	8	3305	3312	25 %	50 %	25 %	0 %	338215006
9	NC_015695	TCTT	2	8	3492	3499	0 %	75 %	0 %	25 %	338215006
10	NC_015695	ACGC	2	8	3509	3516	25 %	0 %	25 %	50 %	338215006
11	NC_015695	GGCA	2	8	4730	4737	25 %	0 %	50 %	25 %	338215008
12	NC_015695	GGAA	2	8	4758	4765	50 %	0 %	50 %	0 %	338215008
13	NC_015695	ACCC	2	8	4883	4890	25 %	0 %	0 %	75 %	338215008
14	NC_015695	CGGC	2	8	5249	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015695	ATTT	2	8	5948	5955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015695	GAAA	2	8	6942	6949	75 %	0 %	25 %	0 %	338215011
17	NC_015695	CATG	2	8	7756	7763	25 %	25 %	25 %	25 %	338215011
18	NC_015695	CCGG	2	8	7972	7979	0 %	0 %	50 %	50 %	338215011
19	NC_015695	ACGC	2	8	8095	8102	25 %	0 %	25 %	50 %	338215011
20	NC_015695	GGCC	2	8	8621	8628	0 %	0 %	50 %	50 %	338215011
21	NC_015695	ATAA	2	8	8643	8650	75 %	25 %	0 %	0 %	338215011
22	NC_015695	CGGT	2	8	8940	8947	0 %	25 %	50 %	25 %	338215011
23	NC_015695	ATCC	2	8	9134	9141	25 %	25 %	0 %	50 %	338215011
24	NC_015695	TACA	2	8	9182	9189	50 %	25 %	0 %	25 %	338215011
25	NC_015695	GAAT	2	8	9665	9672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015695	TGAT	2	8	9694	9701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015695	TTGA	2	8	10348	10355	25 %	50 %	25 %	0 %	338215012
28	NC_015695	AACC	2	8	11557	11564	50 %	0 %	0 %	50 %	338215013
29	NC_015695	CTTT	2	8	13145	13152	0 %	75 %	0 %	25 %	338215014
30	NC_015695	GCCG	2	8	13367	13374	0 %	0 %	50 %	50 %	338215014
31	NC_015695	TGTA	2	8	13394	13401	25 %	50 %	25 %	0 %	338215014
32	NC_015695	AAAG	2	8	13922	13929	75 %	0 %	25 %	0 %	338215015
33	NC_015695	TTAA	2	8	15123	15130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015695	CCGA	2	8	15374	15381	25 %	0 %	25 %	50 %	338215016
35	NC_015695	GGAG	2	8	16044	16051	25 %	0 %	75 %	0 %	338215016
36	NC_015695	CTAC	2	8	16507	16514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015695	TGAT	2	8	17017	17024	25 %	50 %	25 %	0 %	338215017
38	NC_015695	TCGG	2	8	17313	17320	0 %	25 %	50 %	25 %	338215017
39	NC_015695	ACTT	2	8	17467	17474	25 %	50 %	0 %	25 %	338215018
40	NC_015695	GCAG	2	8	17806	17813	25 %	0 %	50 %	25 %	338215018
41	NC_015695	CCGC	2	8	18012	18019	0 %	0 %	25 %	75 %	338215018
42	NC_015695	AATA	2	8	18891	18898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015695	CCAG	2	8	20024	20031	25 %	0 %	25 %	50 %	338215020
44	NC_015695	ACCA	2	8	20083	20090	50 %	0 %	0 %	50 %	338215020
45	NC_015695	GATT	2	8	20223	20230	25 %	50 %	25 %	0 %	338215020
46	NC_015695	TGAT	2	8	20329	20336	25 %	50 %	25 %	0 %	338215020
47	NC_015695	TTTG	2	8	20393	20400	0 %	75 %	25 %	0 %	338215020
48	NC_015695	ATTT	2	8	20518	20525	25 %	75 %	0 %	0 %	338215020
49	NC_015695	AGAA	2	8	20967	20974	75 %	0 %	25 %	0 %	338215021
50	NC_015695	GCAT	2	8	21464	21471	25 %	25 %	25 %	25 %	338215022
51	NC_015695	CTTT	3	12	22182	22193	0 %	75 %	0 %	25 %	338215022
52	NC_015695	GCCG	2	8	22232	22239	0 %	0 %	50 %	50 %	338215022
53	NC_015695	AGGA	2	8	22358	22365	50 %	0 %	50 %	0 %	338215022
54	NC_015695	CATA	2	8	22397	22404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015695	GCCG	2	8	23179	23186	0 %	0 %	50 %	50 %	338215023
56	NC_015695	TCAA	2	8	23206	23213	50 %	25 %	0 %	25 %	338215023
57	NC_015695	TGAA	2	8	24104	24111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015695	GATA	2	8	24307	24314	50 %	25 %	25 %	0 %	338215024
59	NC_015695	ATCA	2	8	24449	24456	50 %	25 %	0 %	25 %	338215024
60	NC_015695	GCCG	2	8	25235	25242	0 %	0 %	50 %	50 %	338215024
61	NC_015695	CCTG	2	8	25475	25482	0 %	25 %	25 %	50 %	338215024
62	NC_015695	AATA	2	8	25925	25932	75 %	25 %	0 %	0 %	338215025
63	NC_015695	CCTG	2	8	27036	27043	0 %	25 %	25 %	50 %	338215026
64	NC_015695	GAAA	2	8	27117	27124	75 %	0 %	25 %	0 %	338215026
65	NC_015695	TTGA	2	8	27532	27539	25 %	50 %	25 %	0 %	338215026
66	NC_015695	CATC	2	8	27916	27923	25 %	25 %	0 %	50 %	338215027
67	NC_015695	CTGG	2	8	28076	28083	0 %	25 %	50 %	25 %	338215027
68	NC_015695	GTAT	2	8	28121	28128	25 %	50 %	25 %	0 %	338215027
69	NC_015695	ATTT	2	8	28869	28876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015695	TAAA	2	8	29080	29087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015695	AATT	2	8	29143	29150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015695	AATA	2	8	29401	29408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015695	TCAA	2	8	29490	29497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015695	AGAA	2	8	29770	29777	75 %	0 %	25 %	0 %	338215028
75	NC_015695	AAAT	2	8	30272	30279	75 %	25 %	0 %	0 %	338215028
76	NC_015695	AAAG	2	8	31512	31519	75 %	0 %	25 %	0 %	338215029
77	NC_015695	CATC	2	8	31549	31556	25 %	25 %	0 %	50 %	338215029
78	NC_015695	TTCA	2	8	31805	31812	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015695	CTGC	2	8	32030	32037	0 %	25 %	25 %	50 %	338215030
80	NC_015695	TGAA	2	8	32213	32220	50 %	25 %	25 %	0 %	338215030
81	NC_015695	TTCA	2	8	32245	32252	25 %	50 %	0 %	25 %	338215030
82	NC_015695	AACA	2	8	32964	32971	75 %	0 %	0 %	25 %	338215030
83	NC_015695	GAAA	2	8	33015	33022	75 %	0 %	25 %	0 %	338215030
84	NC_015695	AAAC	2	8	33466	33473	75 %	0 %	0 %	25 %	338215030
85	NC_015695	AAGA	2	8	33675	33682	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015695	TGAA	2	8	33746	33753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015695	TGAG	2	8	34362	34369	25 %	25 %	50 %	0 %	338215032
88	NC_015695	GCCG	2	8	35295	35302	0 %	0 %	50 %	50 %	338215033
89	NC_015695	GTTG	2	8	35540	35547	0 %	50 %	50 %	0 %	338215033
90	NC_015695	GATG	2	8	36200	36207	25 %	25 %	50 %	0 %	338215034
91	NC_015695	AATG	2	8	36357	36364	50 %	25 %	25 %	0 %	338215034
92	NC_015695	ATTA	2	8	36582	36589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015695	TGTA	2	8	37436	37443	25 %	50 %	25 %	0 %	338215035
94	NC_015695	TTGA	2	8	37553	37560	25 %	50 %	25 %	0 %	338215036
95	NC_015695	AAAT	2	8	37670	37677	75 %	25 %	0 %	0 %	338215036
96	NC_015695	TTAT	2	8	37859	37866	25 %	75 %	0 %	0 %	338215036
97	NC_015695	TCTT	2	8	37976	37983	0 %	75 %	0 %	25 %	338215036
98	NC_015695	GCTC	2	8	38089	38096	0 %	25 %	25 %	50 %	338215036
99	NC_015695	GTTA	2	8	38151	38158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015695	CATT	2	8	38214	38221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015695	TATC	2	8	38545	38552	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015695	TAGA	2	8	38579	38586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015695	GAAA	2	8	38631	38638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015695	ATGA	2	8	38641	38648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015695	TTCA	2	8	38654	38661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.