MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL05

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015695	AATG	2	8	151	158	50 %	25 %	25 %	0 %	338215005
2	NC_015695	GATC	2	8	841	848	25 %	25 %	25 %	25 %	338215005
3	NC_015695	TTGG	2	8	1150	1157	0 %	50 %	50 %	0 %	338215005
4	NC_015695	TACG	2	8	2023	2030	25 %	25 %	25 %	25 %	338215006
5	NC_015695	CATC	2	8	2662	2669	25 %	25 %	0 %	50 %	338215006
6	NC_015695	TACG	2	8	3082	3089	25 %	25 %	25 %	25 %	338215006
7	NC_015695	TTGA	2	8	3305	3312	25 %	50 %	25 %	0 %	338215006
8	NC_015695	TCTT	2	8	3492	3499	0 %	75 %	0 %	25 %	338215006
9	NC_015695	ACGC	2	8	3509	3516	25 %	0 %	25 %	50 %	338215006
10	NC_015695	GGCA	2	8	4730	4737	25 %	0 %	50 %	25 %	338215008
11	NC_015695	GGAA	2	8	4758	4765	50 %	0 %	50 %	0 %	338215008
12	NC_015695	ACCC	2	8	4883	4890	25 %	0 %	0 %	75 %	338215008
13	NC_015695	GAAA	2	8	6942	6949	75 %	0 %	25 %	0 %	338215011
14	NC_015695	CATG	2	8	7756	7763	25 %	25 %	25 %	25 %	338215011
15	NC_015695	CCGG	2	8	7972	7979	0 %	0 %	50 %	50 %	338215011
16	NC_015695	ACGC	2	8	8095	8102	25 %	0 %	25 %	50 %	338215011
17	NC_015695	GGCC	2	8	8621	8628	0 %	0 %	50 %	50 %	338215011
18	NC_015695	ATAA	2	8	8643	8650	75 %	25 %	0 %	0 %	338215011
19	NC_015695	CGGT	2	8	8940	8947	0 %	25 %	50 %	25 %	338215011
20	NC_015695	ATCC	2	8	9134	9141	25 %	25 %	0 %	50 %	338215011
21	NC_015695	TACA	2	8	9182	9189	50 %	25 %	0 %	25 %	338215011
22	NC_015695	TTGA	2	8	10348	10355	25 %	50 %	25 %	0 %	338215012
23	NC_015695	AACC	2	8	11557	11564	50 %	0 %	0 %	50 %	338215013
24	NC_015695	CTTT	2	8	13145	13152	0 %	75 %	0 %	25 %	338215014
25	NC_015695	GCCG	2	8	13367	13374	0 %	0 %	50 %	50 %	338215014
26	NC_015695	TGTA	2	8	13394	13401	25 %	50 %	25 %	0 %	338215014
27	NC_015695	AAAG	2	8	13922	13929	75 %	0 %	25 %	0 %	338215015
28	NC_015695	CCGA	2	8	15374	15381	25 %	0 %	25 %	50 %	338215016
29	NC_015695	GGAG	2	8	16044	16051	25 %	0 %	75 %	0 %	338215016
30	NC_015695	TGAT	2	8	17017	17024	25 %	50 %	25 %	0 %	338215017
31	NC_015695	TCGG	2	8	17313	17320	0 %	25 %	50 %	25 %	338215017
32	NC_015695	ACTT	2	8	17467	17474	25 %	50 %	0 %	25 %	338215018
33	NC_015695	GCAG	2	8	17806	17813	25 %	0 %	50 %	25 %	338215018
34	NC_015695	CCGC	2	8	18012	18019	0 %	0 %	25 %	75 %	338215018
35	NC_015695	CCAG	2	8	20024	20031	25 %	0 %	25 %	50 %	338215020
36	NC_015695	ACCA	2	8	20083	20090	50 %	0 %	0 %	50 %	338215020
37	NC_015695	GATT	2	8	20223	20230	25 %	50 %	25 %	0 %	338215020
38	NC_015695	TGAT	2	8	20329	20336	25 %	50 %	25 %	0 %	338215020
39	NC_015695	TTTG	2	8	20393	20400	0 %	75 %	25 %	0 %	338215020
40	NC_015695	ATTT	2	8	20518	20525	25 %	75 %	0 %	0 %	338215020
41	NC_015695	AGAA	2	8	20967	20974	75 %	0 %	25 %	0 %	338215021
42	NC_015695	GCAT	2	8	21464	21471	25 %	25 %	25 %	25 %	338215022
43	NC_015695	CTTT	3	12	22182	22193	0 %	75 %	0 %	25 %	338215022
44	NC_015695	GCCG	2	8	22232	22239	0 %	0 %	50 %	50 %	338215022
45	NC_015695	AGGA	2	8	22358	22365	50 %	0 %	50 %	0 %	338215022
46	NC_015695	GCCG	2	8	23179	23186	0 %	0 %	50 %	50 %	338215023
47	NC_015695	TCAA	2	8	23206	23213	50 %	25 %	0 %	25 %	338215023
48	NC_015695	GATA	2	8	24307	24314	50 %	25 %	25 %	0 %	338215024
49	NC_015695	ATCA	2	8	24449	24456	50 %	25 %	0 %	25 %	338215024
50	NC_015695	GCCG	2	8	25235	25242	0 %	0 %	50 %	50 %	338215024
51	NC_015695	CCTG	2	8	25475	25482	0 %	25 %	25 %	50 %	338215024
52	NC_015695	AATA	2	8	25925	25932	75 %	25 %	0 %	0 %	338215025
53	NC_015695	CCTG	2	8	27036	27043	0 %	25 %	25 %	50 %	338215026
54	NC_015695	GAAA	2	8	27117	27124	75 %	0 %	25 %	0 %	338215026
55	NC_015695	TTGA	2	8	27532	27539	25 %	50 %	25 %	0 %	338215026
56	NC_015695	CATC	2	8	27916	27923	25 %	25 %	0 %	50 %	338215027
57	NC_015695	CTGG	2	8	28076	28083	0 %	25 %	50 %	25 %	338215027
58	NC_015695	GTAT	2	8	28121	28128	25 %	50 %	25 %	0 %	338215027
59	NC_015695	AGAA	2	8	29770	29777	75 %	0 %	25 %	0 %	338215028
60	NC_015695	AAAT	2	8	30272	30279	75 %	25 %	0 %	0 %	338215028
61	NC_015695	AAAG	2	8	31512	31519	75 %	0 %	25 %	0 %	338215029
62	NC_015695	CATC	2	8	31549	31556	25 %	25 %	0 %	50 %	338215029
63	NC_015695	CTGC	2	8	32030	32037	0 %	25 %	25 %	50 %	338215030
64	NC_015695	TGAA	2	8	32213	32220	50 %	25 %	25 %	0 %	338215030
65	NC_015695	TTCA	2	8	32245	32252	25 %	50 %	0 %	25 %	338215030
66	NC_015695	AACA	2	8	32964	32971	75 %	0 %	0 %	25 %	338215030
67	NC_015695	GAAA	2	8	33015	33022	75 %	0 %	25 %	0 %	338215030
68	NC_015695	AAAC	2	8	33466	33473	75 %	0 %	0 %	25 %	338215030
69	NC_015695	TGAG	2	8	34362	34369	25 %	25 %	50 %	0 %	338215032
70	NC_015695	GCCG	2	8	35295	35302	0 %	0 %	50 %	50 %	338215033
71	NC_015695	GTTG	2	8	35540	35547	0 %	50 %	50 %	0 %	338215033
72	NC_015695	GATG	2	8	36200	36207	25 %	25 %	50 %	0 %	338215034
73	NC_015695	AATG	2	8	36357	36364	50 %	25 %	25 %	0 %	338215034
74	NC_015695	TGTA	2	8	37436	37443	25 %	50 %	25 %	0 %	338215035
75	NC_015695	TTGA	2	8	37553	37560	25 %	50 %	25 %	0 %	338215036
76	NC_015695	AAAT	2	8	37670	37677	75 %	25 %	0 %	0 %	338215036
77	NC_015695	TTAT	2	8	37859	37866	25 %	75 %	0 %	0 %	338215036
78	NC_015695	TCTT	2	8	37976	37983	0 %	75 %	0 %	25 %	338215036
79	NC_015695	GCTC	2	8	38089	38096	0 %	25 %	25 %	50 %	338215036

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.