MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL05

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015695	CA	3	6	119	124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015695	AT	3	6	465	470	50 %	50 %	0 %	0 %	338215005
3	NC_015695	TG	3	6	2414	2419	0 %	50 %	50 %	0 %	338215006
4	NC_015695	AG	3	6	2650	2655	50 %	0 %	50 %	0 %	338215006
5	NC_015695	AG	3	6	2681	2686	50 %	0 %	50 %	0 %	338215006
6	NC_015695	CG	3	6	3137	3142	0 %	0 %	50 %	50 %	338215006
7	NC_015695	GT	3	6	3468	3473	0 %	50 %	50 %	0 %	338215006
8	NC_015695	AT	3	6	4866	4871	50 %	50 %	0 %	0 %	338215008
9	NC_015695	CG	3	6	6287	6292	0 %	0 %	50 %	50 %	338215010
10	NC_015695	GT	3	6	9243	9248	0 %	50 %	50 %	0 %	338215011
11	NC_015695	AT	3	6	12121	12126	50 %	50 %	0 %	0 %	338215013
12	NC_015695	GC	3	6	15454	15459	0 %	0 %	50 %	50 %	338215016
13	NC_015695	GC	3	6	18200	18205	0 %	0 %	50 %	50 %	338215018
14	NC_015695	GT	3	6	18414	18419	0 %	50 %	50 %	0 %	338215018
15	NC_015695	TA	3	6	18867	18872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015695	TA	3	6	19980	19985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015695	CT	3	6	20101	20106	0 %	50 %	0 %	50 %	338215020
18	NC_015695	GC	4	8	20262	20269	0 %	0 %	50 %	50 %	338215020
19	NC_015695	TC	3	6	20482	20487	0 %	50 %	0 %	50 %	338215020
20	NC_015695	GC	3	6	20953	20958	0 %	0 %	50 %	50 %	338215021
21	NC_015695	AC	3	6	21866	21871	50 %	0 %	0 %	50 %	338215022
22	NC_015695	AT	3	6	22266	22271	50 %	50 %	0 %	0 %	338215022
23	NC_015695	TG	3	6	22334	22339	0 %	50 %	50 %	0 %	338215022
24	NC_015695	AC	3	6	22767	22772	50 %	0 %	0 %	50 %	338215023
25	NC_015695	AC	3	6	24386	24391	50 %	0 %	0 %	50 %	338215024
26	NC_015695	AG	3	6	26479	26484	50 %	0 %	50 %	0 %	338215025
27	NC_015695	AG	3	6	26557	26562	50 %	0 %	50 %	0 %	338215025
28	NC_015695	CA	3	6	26786	26791	50 %	0 %	0 %	50 %	338215026
29	NC_015695	TA	3	6	27755	27760	50 %	50 %	0 %	0 %	338215027
30	NC_015695	AC	3	6	28324	28329	50 %	0 %	0 %	50 %	338215027
31	NC_015695	CT	3	6	31863	31868	0 %	50 %	0 %	50 %	338215030
32	NC_015695	CT	3	6	32071	32076	0 %	50 %	0 %	50 %	338215030
33	NC_015695	GT	3	6	32507	32512	0 %	50 %	50 %	0 %	338215030
34	NC_015695	GA	3	6	32706	32711	50 %	0 %	50 %	0 %	338215030
35	NC_015695	GA	3	6	33727	33732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015695	TC	3	6	33776	33781	0 %	50 %	0 %	50 %	338215031
37	NC_015695	AT	3	6	35190	35195	50 %	50 %	0 %	0 %	338215033
38	NC_015695	CA	3	6	36085	36090	50 %	0 %	0 %	50 %	338215034
39	NC_015695	AG	3	6	36548	36553	50 %	0 %	50 %	0 %	338215034
40	NC_015695	GC	3	6	36724	36729	0 %	0 %	50 %	50 %	338215035
41	NC_015695	TA	3	6	37905	37910	50 %	50 %	0 %	0 %	338215036
42	NC_015695	AC	3	6	38289	38294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015695	CA	3	6	38529	38534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.