MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL05

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015695	T	8	8	246	253	0 %	100 %	0 %	0 %	338215005
2	NC_015695	T	6	6	561	566	0 %	100 %	0 %	0 %	338215005
3	NC_015695	A	8	8	614	621	100 %	0 %	0 %	0 %	338215005
4	NC_015695	A	6	6	1133	1138	100 %	0 %	0 %	0 %	338215005
5	NC_015695	A	7	7	1381	1387	100 %	0 %	0 %	0 %	338215006
6	NC_015695	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	338215006
7	NC_015695	T	6	6	2114	2119	0 %	100 %	0 %	0 %	338215006
8	NC_015695	T	6	6	2698	2703	0 %	100 %	0 %	0 %	338215006
9	NC_015695	G	6	6	2988	2993	0 %	0 %	100 %	0 %	338215006
10	NC_015695	T	6	6	3941	3946	0 %	100 %	0 %	0 %	338215007
11	NC_015695	A	7	7	4566	4572	100 %	0 %	0 %	0 %	338215008
12	NC_015695	T	6	6	4665	4670	0 %	100 %	0 %	0 %	338215008
13	NC_015695	A	6	6	4789	4794	100 %	0 %	0 %	0 %	338215008
14	NC_015695	T	6	6	5261	5266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015695	A	7	7	5295	5301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015695	A	7	7	5419	5425	100 %	0 %	0 %	0 %	338215009
17	NC_015695	A	7	7	5473	5479	100 %	0 %	0 %	0 %	338215009
18	NC_015695	A	6	6	5556	5561	100 %	0 %	0 %	0 %	338215009
19	NC_015695	T	7	7	5633	5639	0 %	100 %	0 %	0 %	338215009
20	NC_015695	T	7	7	5892	5898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015695	T	7	7	6408	6414	0 %	100 %	0 %	0 %	338215010
22	NC_015695	T	8	8	6782	6789	0 %	100 %	0 %	0 %	338215010
23	NC_015695	T	6	6	7397	7402	0 %	100 %	0 %	0 %	338215011
24	NC_015695	T	6	6	7411	7416	0 %	100 %	0 %	0 %	338215011
25	NC_015695	T	6	6	7655	7660	0 %	100 %	0 %	0 %	338215011
26	NC_015695	T	6	6	8339	8344	0 %	100 %	0 %	0 %	338215011
27	NC_015695	T	6	6	8354	8359	0 %	100 %	0 %	0 %	338215011
28	NC_015695	C	6	6	8910	8915	0 %	0 %	0 %	100 %	338215011
29	NC_015695	T	6	6	8927	8932	0 %	100 %	0 %	0 %	338215011
30	NC_015695	T	6	6	9308	9313	0 %	100 %	0 %	0 %	338215011
31	NC_015695	A	7	7	9522	9528	100 %	0 %	0 %	0 %	338215011
32	NC_015695	A	7	7	9544	9550	100 %	0 %	0 %	0 %	338215011
33	NC_015695	T	6	6	10036	10041	0 %	100 %	0 %	0 %	338215012
34	NC_015695	A	7	7	10262	10268	100 %	0 %	0 %	0 %	338215012
35	NC_015695	A	8	8	10491	10498	100 %	0 %	0 %	0 %	338215012
36	NC_015695	T	6	6	10534	10539	0 %	100 %	0 %	0 %	338215012
37	NC_015695	A	7	7	11841	11847	100 %	0 %	0 %	0 %	338215013
38	NC_015695	T	6	6	12547	12552	0 %	100 %	0 %	0 %	338215013
39	NC_015695	T	7	7	12648	12654	0 %	100 %	0 %	0 %	338215014
40	NC_015695	A	6	6	13325	13330	100 %	0 %	0 %	0 %	338215014
41	NC_015695	A	7	7	13405	13411	100 %	0 %	0 %	0 %	338215014
42	NC_015695	T	6	6	13606	13611	0 %	100 %	0 %	0 %	338215014
43	NC_015695	T	6	6	13711	13716	0 %	100 %	0 %	0 %	338215014
44	NC_015695	T	6	6	14022	14027	0 %	100 %	0 %	0 %	338215015
45	NC_015695	A	6	6	14068	14073	100 %	0 %	0 %	0 %	338215015
46	NC_015695	A	7	7	14127	14133	100 %	0 %	0 %	0 %	338215015
47	NC_015695	T	6	6	14538	14543	0 %	100 %	0 %	0 %	338215015
48	NC_015695	T	6	6	14567	14572	0 %	100 %	0 %	0 %	338215015
49	NC_015695	T	6	6	14794	14799	0 %	100 %	0 %	0 %	338215015
50	NC_015695	T	6	6	15169	15174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015695	A	6	6	15836	15841	100 %	0 %	0 %	0 %	338215016
52	NC_015695	T	8	8	15892	15899	0 %	100 %	0 %	0 %	338215016
53	NC_015695	A	6	6	16205	16210	100 %	0 %	0 %	0 %	338215016
54	NC_015695	A	6	6	16384	16389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015695	T	6	6	16532	16537	0 %	100 %	0 %	0 %	338215017
56	NC_015695	A	6	6	16538	16543	100 %	0 %	0 %	0 %	338215017
57	NC_015695	A	6	6	16695	16700	100 %	0 %	0 %	0 %	338215017
58	NC_015695	A	6	6	16935	16940	100 %	0 %	0 %	0 %	338215017
59	NC_015695	A	6	6	17440	17445	100 %	0 %	0 %	0 %	338215018
60	NC_015695	A	6	6	17645	17650	100 %	0 %	0 %	0 %	338215018
61	NC_015695	A	6	6	18038	18043	100 %	0 %	0 %	0 %	338215018
62	NC_015695	T	6	6	18551	18556	0 %	100 %	0 %	0 %	338215018
63	NC_015695	T	6	6	18765	18770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015695	T	6	6	18819	18824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015695	T	6	6	19568	19573	0 %	100 %	0 %	0 %	338215019
66	NC_015695	T	7	7	20507	20513	0 %	100 %	0 %	0 %	338215020
67	NC_015695	A	6	6	20615	20620	100 %	0 %	0 %	0 %	338215021
68	NC_015695	A	6	6	21118	21123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015695	A	6	6	21132	21137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015695	T	6	6	21471	21476	0 %	100 %	0 %	0 %	338215022
71	NC_015695	T	6	6	21616	21621	0 %	100 %	0 %	0 %	338215022
72	NC_015695	A	8	8	21816	21823	100 %	0 %	0 %	0 %	338215022
73	NC_015695	A	6	6	22146	22151	100 %	0 %	0 %	0 %	338215022
74	NC_015695	T	6	6	22568	22573	0 %	100 %	0 %	0 %	338215023
75	NC_015695	T	6	6	22619	22624	0 %	100 %	0 %	0 %	338215023
76	NC_015695	T	6	6	22842	22847	0 %	100 %	0 %	0 %	338215023
77	NC_015695	A	6	6	23687	23692	100 %	0 %	0 %	0 %	338215023
78	NC_015695	T	6	6	24193	24198	0 %	100 %	0 %	0 %	338215024
79	NC_015695	A	6	6	25126	25131	100 %	0 %	0 %	0 %	338215024
80	NC_015695	T	6	6	25552	25557	0 %	100 %	0 %	0 %	338215024
81	NC_015695	A	7	7	26294	26300	100 %	0 %	0 %	0 %	338215025
82	NC_015695	A	6	6	27476	27481	100 %	0 %	0 %	0 %	338215026
83	NC_015695	A	7	7	27544	27550	100 %	0 %	0 %	0 %	338215026
84	NC_015695	A	6	6	27621	27626	100 %	0 %	0 %	0 %	338215026
85	NC_015695	T	7	7	27713	27719	0 %	100 %	0 %	0 %	338215027
86	NC_015695	A	6	6	28372	28377	100 %	0 %	0 %	0 %	338215027
87	NC_015695	A	6	6	28561	28566	100 %	0 %	0 %	0 %	338215027
88	NC_015695	T	6	6	28696	28701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015695	T	7	7	29019	29025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015695	A	7	7	29125	29131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015695	A	7	7	29465	29471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015695	A	8	8	29496	29503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015695	A	6	6	29506	29511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015695	A	7	7	29531	29537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015695	A	6	6	29557	29562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015695	T	6	6	29638	29643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015695	T	6	6	29694	29699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015695	A	10	10	29731	29740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015695	T	6	6	29786	29791	0 %	100 %	0 %	0 %	338215028
100	NC_015695	A	6	6	30760	30765	100 %	0 %	0 %	0 %	338215029
101	NC_015695	A	7	7	30886	30892	100 %	0 %	0 %	0 %	338215029
102	NC_015695	A	6	6	31566	31571	100 %	0 %	0 %	0 %	338215029
103	NC_015695	A	6	6	31591	31596	100 %	0 %	0 %	0 %	338215029
104	NC_015695	T	7	7	31868	31874	0 %	100 %	0 %	0 %	338215030
105	NC_015695	A	7	7	31946	31952	100 %	0 %	0 %	0 %	338215030
106	NC_015695	A	7	7	32110	32116	100 %	0 %	0 %	0 %	338215030
107	NC_015695	A	6	6	32327	32332	100 %	0 %	0 %	0 %	338215030
108	NC_015695	G	7	7	32878	32884	0 %	0 %	100 %	0 %	338215030
109	NC_015695	T	6	6	32904	32909	0 %	100 %	0 %	0 %	338215030
110	NC_015695	A	7	7	34004	34010	100 %	0 %	0 %	0 %	338215031
111	NC_015695	A	6	6	34488	34493	100 %	0 %	0 %	0 %	338215032
112	NC_015695	A	6	6	34690	34695	100 %	0 %	0 %	0 %	338215032
113	NC_015695	T	10	10	35110	35119	0 %	100 %	0 %	0 %	338215033
114	NC_015695	A	6	6	35590	35595	100 %	0 %	0 %	0 %	338215033
115	NC_015695	T	6	6	35655	35660	0 %	100 %	0 %	0 %	338215033
116	NC_015695	A	6	6	35933	35938	100 %	0 %	0 %	0 %	338215033
117	NC_015695	T	6	6	36297	36302	0 %	100 %	0 %	0 %	338215034
118	NC_015695	C	6	6	36630	36635	0 %	0 %	0 %	100 %	338215035
119	NC_015695	T	6	6	37940	37945	0 %	100 %	0 %	0 %	338215036
120	NC_015695	A	6	6	38439	38444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015695	T	6	6	38469	38474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015695	T	6	6	38485	38490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015695	G	9	9	38492	38500	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015695	A	8	8	38519	38526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015695	A	6	6	38737	38742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.