MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL03

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015694	TGCTGA	2	12	1131	1142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338209458
2	NC_015694	TACGAT	2	12	7536	7547	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338209468
3	NC_015694	TAAAAA	2	12	8589	8600	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	338209469
4	NC_015694	CAGCTG	2	12	19603	19614	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338209480
5	NC_015694	TGGTTT	2	12	29129	29140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209496
6	NC_015694	GAACGG	2	12	32108	32119	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	338209500
7	NC_015694	AACTGG	2	12	34842	34853	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338209503
8	NC_015694	TGATAA	2	12	36520	36531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338209505
9	NC_015694	GAATTA	2	12	37017	37028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338209505
10	NC_015694	GCCAAT	2	12	40194	40205	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338209508
11	NC_015694	TGGAAA	2	12	42424	42435	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338209508
12	NC_015694	GCCACA	2	12	44570	44581	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338209510
13	NC_015694	TCACTT	2	12	47117	47128	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338209513
14	NC_015694	TCCATG	2	12	48519	48530	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338209515
15	NC_015694	ACTATC	2	12	50920	50931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209516
16	NC_015694	GTATAA	2	12	54429	54440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338209519
17	NC_015694	TCACGG	2	12	55903	55914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338209519
18	NC_015694	CTGCCG	2	12	56049	56060	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338209519
19	NC_015694	CAGGGT	2	12	59644	59655	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338209520
20	NC_015694	GCTCCT	2	12	60026	60037	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338209520
21	NC_015694	ACTGCC	2	12	66704	66715	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338209526

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.