MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL03

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015694	TTCAA	2	10	1525	1534	40 %	40 %	0 %	20 %	338209458
2	NC_015694	TAATG	3	15	1647	1661	40 %	40 %	20 %	0 %	338209458
3	NC_015694	AAGGT	2	10	1860	1869	40 %	20 %	40 %	0 %	338209459
4	NC_015694	CGTCG	2	10	2575	2584	0 %	20 %	40 %	40 %	338209461
5	NC_015694	TTTTG	2	10	3439	3448	0 %	80 %	20 %	0 %	338209462
6	NC_015694	TTTAT	2	10	3895	3904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015694	CAAAT	2	10	5726	5735	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015694	ATAGA	2	10	7301	7310	60 %	20 %	20 %	0 %	338209468
9	NC_015694	TAAAA	2	10	7647	7656	80 %	20 %	0 %	0 %	338209468
10	NC_015694	ATTGT	2	10	12008	12017	20 %	60 %	20 %	0 %	338209473
11	NC_015694	TATTT	2	10	12448	12457	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015694	CCTGC	2	10	13261	13270	0 %	20 %	20 %	60 %	338209474
13	NC_015694	CAATG	2	10	13387	13396	40 %	20 %	20 %	20 %	338209474
14	NC_015694	GAAAA	2	10	14828	14837	80 %	0 %	20 %	0 %	338209475
15	NC_015694	GCTGT	2	10	15698	15707	0 %	40 %	40 %	20 %	338209477
16	NC_015694	CGCCC	2	10	16004	16013	0 %	0 %	20 %	80 %	338209478
17	NC_015694	TTACA	2	10	17518	17527	40 %	40 %	0 %	20 %	338209479
18	NC_015694	ATTTG	2	10	17845	17854	20 %	60 %	20 %	0 %	338209479
19	NC_015694	ACCGT	2	10	20632	20641	20 %	20 %	20 %	40 %	338209481
20	NC_015694	GATTG	2	10	22419	22428	20 %	40 %	40 %	0 %	338209485
21	NC_015694	AGTTG	2	10	25703	25712	20 %	40 %	40 %	0 %	338209491
22	NC_015694	ACTTT	2	10	26421	26430	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015694	AAAGA	2	10	26659	26668	80 %	0 %	20 %	0 %	338209492
24	NC_015694	CTATA	2	10	27456	27465	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015694	GAGTG	2	10	28539	28548	20 %	20 %	60 %	0 %	338209496
26	NC_015694	TTAAT	2	10	33878	33887	40 %	60 %	0 %	0 %	338209502
27	NC_015694	AGAAA	2	10	34158	34167	80 %	0 %	20 %	0 %	338209502
28	NC_015694	TCAAT	2	10	37180	37189	40 %	40 %	0 %	20 %	338209505
29	NC_015694	ATTCC	2	10	37825	37834	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015694	TATTT	2	10	39234	39243	20 %	80 %	0 %	0 %	338209508
31	NC_015694	GTTTA	2	10	39485	39494	20 %	60 %	20 %	0 %	338209508
32	NC_015694	AATTT	2	10	44361	44370	40 %	60 %	0 %	0 %	338209510
33	NC_015694	CTTAT	2	10	45484	45493	20 %	60 %	0 %	20 %	338209511
34	NC_015694	ATTTT	2	10	45854	45863	20 %	80 %	0 %	0 %	338209512
35	NC_015694	TGTAC	2	10	46419	46428	20 %	40 %	20 %	20 %	338209512
36	NC_015694	TTAAA	2	10	50479	50488	60 %	40 %	0 %	0 %	338209515
37	NC_015694	TGATC	2	10	55075	55084	20 %	40 %	20 %	20 %	338209519
38	NC_015694	CAGCG	2	10	59626	59635	20 %	0 %	40 %	40 %	338209520
39	NC_015694	CTGCC	2	10	61667	61676	0 %	20 %	20 %	60 %	338209521
40	NC_015694	GATCA	2	10	61867	61876	40 %	20 %	20 %	20 %	338209521
41	NC_015694	TGTCC	2	10	62265	62274	0 %	40 %	20 %	40 %	338209521
42	NC_015694	CAGAA	2	10	62303	62312	60 %	0 %	20 %	20 %	338209521
43	NC_015694	CACCT	2	10	62749	62758	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_015694	CACCC	2	10	62797	62806	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
45	NC_015694	AAATA	2	10	62833	62842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015694	GAACC	2	10	63770	63779	40 %	0 %	20 %	40 %	338209523
47	NC_015694	ATAAA	2	10	65641	65650	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.