MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL03

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015694	TTAT	2	8	43	50	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015694	AGTT	2	8	194	201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015694	GTAA	2	8	374	381	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015694	TGTA	2	8	689	696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015694	AAAT	2	8	713	720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015694	TTTA	2	8	1019	1026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015694	TGTA	2	8	1095	1102	25 %	50 %	25 %	0 %	338209458
8	NC_015694	ATCA	2	8	1460	1467	50 %	25 %	0 %	25 %	338209458
9	NC_015694	AAAT	2	8	1747	1754	75 %	25 %	0 %	0 %	338209459
10	NC_015694	TACT	2	8	1958	1965	25 %	50 %	0 %	25 %	338209459
11	NC_015694	TTCC	2	8	2062	2069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015694	TTAA	2	8	3721	3728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015694	CAAC	2	8	4284	4291	50 %	0 %	0 %	50 %	338209463
14	NC_015694	GATA	2	8	4724	4731	50 %	25 %	25 %	0 %	338209464
15	NC_015694	TGAC	2	8	4801	4808	25 %	25 %	25 %	25 %	338209464
16	NC_015694	GCGG	2	8	4973	4980	0 %	0 %	75 %	25 %	338209464
17	NC_015694	CGGA	2	8	5133	5140	25 %	0 %	50 %	25 %	338209464
18	NC_015694	CGGA	2	8	5465	5472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015694	ATAA	2	8	5539	5546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015694	TCAA	2	8	6047	6054	50 %	25 %	0 %	25 %	338209465
21	NC_015694	CAAT	2	8	6631	6638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015694	TGTT	2	8	6749	6756	0 %	75 %	25 %	0 %	338209467
23	NC_015694	AAAT	2	8	6840	6847	75 %	25 %	0 %	0 %	338209467
24	NC_015694	GGCA	2	8	7145	7152	25 %	0 %	50 %	25 %	338209467
25	NC_015694	TACT	2	8	7399	7406	25 %	50 %	0 %	25 %	338209468
26	NC_015694	TGAG	2	8	7754	7761	25 %	25 %	50 %	0 %	338209468
27	NC_015694	AAAT	2	8	8167	8174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015694	ATGA	2	8	8448	8455	50 %	25 %	25 %	0 %	338209469
29	NC_015694	TTTC	2	8	8460	8467	0 %	75 %	0 %	25 %	338209469
30	NC_015694	TGAA	2	8	9155	9162	50 %	25 %	25 %	0 %	338209470
31	NC_015694	AAAG	2	8	9290	9297	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015694	TAAA	2	8	9334	9341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015694	GGAT	2	8	9607	9614	25 %	25 %	50 %	0 %	338209472
34	NC_015694	TTAC	2	8	10128	10135	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015694	ATTT	2	8	11279	11286	25 %	75 %	0 %	0 %	338209473
36	NC_015694	AACC	2	8	11470	11477	50 %	0 %	0 %	50 %	338209473
37	NC_015694	GTTG	2	8	12102	12109	0 %	50 %	50 %	0 %	338209473
38	NC_015694	CAGT	2	8	12420	12427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015694	TTTC	2	8	13440	13447	0 %	75 %	0 %	25 %	338209474
40	NC_015694	TATC	2	8	13701	13708	25 %	50 %	0 %	25 %	338209474
41	NC_015694	AGAC	2	8	13798	13805	50 %	0 %	25 %	25 %	338209474
42	NC_015694	CTGA	2	8	14354	14361	25 %	25 %	25 %	25 %	338209474
43	NC_015694	CAGG	2	8	14628	14635	25 %	0 %	50 %	25 %	338209475
44	NC_015694	GGCT	2	8	14857	14864	0 %	25 %	50 %	25 %	338209475
45	NC_015694	TGTT	2	8	14872	14879	0 %	75 %	25 %	0 %	338209475
46	NC_015694	TGCT	2	8	14957	14964	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015694	CAGT	2	8	15468	15475	25 %	25 %	25 %	25 %	338209477
48	NC_015694	GACA	2	8	15559	15566	50 %	0 %	25 %	25 %	338209477
49	NC_015694	GTGG	2	8	15688	15695	0 %	25 %	75 %	0 %	338209477
50	NC_015694	GGCA	2	8	15836	15843	25 %	0 %	50 %	25 %	338209478
51	NC_015694	CTTA	2	8	15942	15949	25 %	50 %	0 %	25 %	338209478
52	NC_015694	CCTG	2	8	16212	16219	0 %	25 %	25 %	50 %	338209479
53	NC_015694	CAAA	2	8	16342	16349	75 %	0 %	0 %	25 %	338209479
54	NC_015694	ACCG	2	8	16790	16797	25 %	0 %	25 %	50 %	338209479
55	NC_015694	GCAG	2	8	17014	17021	25 %	0 %	50 %	25 %	338209479
56	NC_015694	ACCG	2	8	17297	17304	25 %	0 %	25 %	50 %	338209479
57	NC_015694	AAGG	2	8	17666	17673	50 %	0 %	50 %	0 %	338209479
58	NC_015694	GCTT	2	8	18633	18640	0 %	50 %	25 %	25 %	338209480
59	NC_015694	GCTT	2	8	20519	20526	0 %	50 %	25 %	25 %	338209481
60	NC_015694	TACA	2	8	20559	20566	50 %	25 %	0 %	25 %	338209481
61	NC_015694	GTAT	2	8	21003	21010	25 %	50 %	25 %	0 %	338209483
62	NC_015694	ACGA	2	8	21039	21046	50 %	0 %	25 %	25 %	338209483
63	NC_015694	CCGG	2	8	21119	21126	0 %	0 %	50 %	50 %	338209483
64	NC_015694	ATCA	2	8	22243	22250	50 %	25 %	0 %	25 %	338209485
65	NC_015694	CCTG	2	8	22320	22327	0 %	25 %	25 %	50 %	338209485
66	NC_015694	AGGC	2	8	22439	22446	25 %	0 %	50 %	25 %	338209485
67	NC_015694	TATT	2	8	22670	22677	25 %	75 %	0 %	0 %	338209485
68	NC_015694	CTAT	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	338209485
69	NC_015694	ATGG	2	8	22738	22745	25 %	25 %	50 %	0 %	338209485
70	NC_015694	CCTA	2	8	23026	23033	25 %	25 %	0 %	50 %	338209485
71	NC_015694	TTCC	2	8	23226	23233	0 %	50 %	0 %	50 %	338209486
72	NC_015694	GATT	2	8	23692	23699	25 %	50 %	25 %	0 %	338209486
73	NC_015694	TTTC	2	8	23711	23718	0 %	75 %	0 %	25 %	338209486
74	NC_015694	TGTT	2	8	23820	23827	0 %	75 %	25 %	0 %	338209486
75	NC_015694	GTCA	2	8	24223	24230	25 %	25 %	25 %	25 %	338209487
76	NC_015694	AGGA	2	8	24999	25006	50 %	0 %	50 %	0 %	338209490
77	NC_015694	TAAA	2	8	25522	25529	75 %	25 %	0 %	0 %	338209490
78	NC_015694	GCAG	2	8	25787	25794	25 %	0 %	50 %	25 %	338209491
79	NC_015694	TCAG	2	8	25986	25993	25 %	25 %	25 %	25 %	338209491
80	NC_015694	CATA	2	8	26613	26620	50 %	25 %	0 %	25 %	338209492
81	NC_015694	ATGC	2	8	27273	27280	25 %	25 %	25 %	25 %	338209493
82	NC_015694	CAAT	2	8	27470	27477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015694	TAAA	2	8	28249	28256	75 %	25 %	0 %	0 %	338209496
84	NC_015694	TTTC	2	8	29696	29703	0 %	75 %	0 %	25 %	338209497
85	NC_015694	TTTC	2	8	29762	29769	0 %	75 %	0 %	25 %	338209497
86	NC_015694	AGGA	2	8	29856	29863	50 %	0 %	50 %	0 %	338209497
87	NC_015694	TGTA	2	8	30165	30172	25 %	50 %	25 %	0 %	338209497
88	NC_015694	CAGT	2	8	30625	30632	25 %	25 %	25 %	25 %	338209497
89	NC_015694	AATA	2	8	30816	30823	75 %	25 %	0 %	0 %	338209498
90	NC_015694	AGGC	2	8	31992	31999	25 %	0 %	50 %	25 %	338209500
91	NC_015694	AAGC	2	8	32315	32322	50 %	0 %	25 %	25 %	338209501
92	NC_015694	TGAT	2	8	33483	33490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015694	ATTA	2	8	33693	33700	50 %	50 %	0 %	0 %	338209502
94	NC_015694	ACCC	2	8	33940	33947	25 %	0 %	0 %	75 %	338209502
95	NC_015694	AGGT	2	8	33989	33996	25 %	25 %	50 %	0 %	338209502
96	NC_015694	TAAA	2	8	34124	34131	75 %	25 %	0 %	0 %	338209502
97	NC_015694	TATC	2	8	34584	34591	25 %	50 %	0 %	25 %	338209502
98	NC_015694	AATT	2	8	34667	34674	50 %	50 %	0 %	0 %	338209502
99	NC_015694	GAAA	2	8	34685	34692	75 %	0 %	25 %	0 %	338209502
100	NC_015694	AATC	2	8	35364	35371	50 %	25 %	0 %	25 %	338209503
101	NC_015694	TATT	2	8	35514	35521	25 %	75 %	0 %	0 %	338209504
102	NC_015694	CGAA	2	8	36329	36336	50 %	0 %	25 %	25 %	338209505
103	NC_015694	ACAG	2	8	36360	36367	50 %	0 %	25 %	25 %	338209505
104	NC_015694	TGGA	2	8	37363	37370	25 %	25 %	50 %	0 %	338209506
105	NC_015694	TGAA	2	8	37750	37757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015694	TGAT	2	8	40208	40215	25 %	50 %	25 %	0 %	338209508
107	NC_015694	TCAT	2	8	40289	40296	25 %	50 %	0 %	25 %	338209508
108	NC_015694	TCGA	2	8	40355	40362	25 %	25 %	25 %	25 %	338209508
109	NC_015694	ATTA	2	8	40593	40600	50 %	50 %	0 %	0 %	338209508
110	NC_015694	AGTT	2	8	40625	40632	25 %	50 %	25 %	0 %	338209508
111	NC_015694	AAAG	2	8	41004	41011	75 %	0 %	25 %	0 %	338209508
112	NC_015694	TTAT	2	8	41021	41028	25 %	75 %	0 %	0 %	338209508
113	NC_015694	TGGT	2	8	41075	41082	0 %	50 %	50 %	0 %	338209508
114	NC_015694	GAAT	2	8	41282	41289	50 %	25 %	25 %	0 %	338209508
115	NC_015694	TAGA	2	8	41318	41325	50 %	25 %	25 %	0 %	338209508
116	NC_015694	TCAT	2	8	41441	41448	25 %	50 %	0 %	25 %	338209508
117	NC_015694	GAAA	2	8	41490	41497	75 %	0 %	25 %	0 %	338209508
118	NC_015694	AATC	2	8	41705	41712	50 %	25 %	0 %	25 %	338209508
119	NC_015694	GTTT	2	8	42126	42133	0 %	75 %	25 %	0 %	338209508
120	NC_015694	TGAT	2	8	42224	42231	25 %	50 %	25 %	0 %	338209508
121	NC_015694	ACTT	2	8	42455	42462	25 %	50 %	0 %	25 %	338209508
122	NC_015694	ATGT	2	8	43254	43261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015694	CAGC	2	8	43547	43554	25 %	0 %	25 %	50 %	338209509
124	NC_015694	CCTG	2	8	43794	43801	0 %	25 %	25 %	50 %	338209509
125	NC_015694	AGTT	2	8	44275	44282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015694	CAGT	2	8	44535	44542	25 %	25 %	25 %	25 %	338209510
127	NC_015694	CATT	2	8	44789	44796	25 %	50 %	0 %	25 %	338209511
128	NC_015694	TTGC	2	8	45574	45581	0 %	50 %	25 %	25 %	338209511
129	NC_015694	CCAG	2	8	45751	45758	25 %	0 %	25 %	50 %	338209511
130	NC_015694	GATA	2	8	47514	47521	50 %	25 %	25 %	0 %	338209513
131	NC_015694	ATTT	2	8	47641	47648	25 %	75 %	0 %	0 %	338209513
132	NC_015694	TTTA	2	8	47671	47678	25 %	75 %	0 %	0 %	338209513
133	NC_015694	CAAT	2	8	48215	48222	50 %	25 %	0 %	25 %	338209514
134	NC_015694	CTTT	2	8	48541	48548	0 %	75 %	0 %	25 %	338209515
135	NC_015694	TCTT	2	8	48938	48945	0 %	75 %	0 %	25 %	338209515
136	NC_015694	CAGC	2	8	49273	49280	25 %	0 %	25 %	50 %	338209515
137	NC_015694	TAAA	2	8	49585	49592	75 %	25 %	0 %	0 %	338209515
138	NC_015694	GTTG	2	8	50034	50041	0 %	50 %	50 %	0 %	338209515
139	NC_015694	ATAA	2	8	50114	50121	75 %	25 %	0 %	0 %	338209515
140	NC_015694	CAAA	2	8	50366	50373	75 %	0 %	0 %	25 %	338209515
141	NC_015694	GTTT	2	8	50651	50658	0 %	75 %	25 %	0 %	338209515
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143	NC_015694	TCTT	2	8	52564	52571	0 %	75 %	0 %	25 %	338209518
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.