MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL03

Total Repeats: 796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015694	TTA	2	6	14	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015694	TGA	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015694	ATA	2	6	216	221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015694	ATA	2	6	225	230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015694	AAT	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015694	AGT	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015694	AAG	2	6	600	605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015694	AGG	2	6	1056	1061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209458
9	NC_015694	TCA	2	6	1168	1173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209458
10	NC_015694	AAG	2	6	1176	1181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209458
11	NC_015694	TGA	2	6	1182	1187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209458
12	NC_015694	TTA	2	6	1271	1276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209458
13	NC_015694	TGC	2	6	1334	1339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209458
14	NC_015694	AAG	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209458
15	NC_015694	TAT	2	6	1732	1737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209459
16	NC_015694	GCC	2	6	1780	1785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209459
17	NC_015694	GAA	2	6	1786	1791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209459
18	NC_015694	GAG	2	6	1895	1900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209459
19	NC_015694	GAC	2	6	1979	1984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209459
20	NC_015694	GGT	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015694	TTC	2	6	2108	2113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209460
22	NC_015694	ACC	2	6	2152	2157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209460
23	NC_015694	TAG	2	6	2189	2194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209460
24	NC_015694	TGA	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209460
25	NC_015694	TTG	2	6	2696	2701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209461
26	NC_015694	TTG	2	6	2795	2800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209461
27	NC_015694	AGT	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209461
28	NC_015694	AAT	2	6	2866	2871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209461
29	NC_015694	ATA	2	6	2981	2986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209461
30	NC_015694	AAG	2	6	3026	3031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209461
31	NC_015694	GAA	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209461
32	NC_015694	CAG	2	6	3181	3186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209461
33	NC_015694	CCT	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209461
34	NC_015694	ATT	2	6	3290	3295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015694	GAA	2	6	3303	3308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015694	TTA	2	6	3324	3329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015694	CTC	2	6	3404	3409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209462
38	NC_015694	TGA	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209462
39	NC_015694	ATA	2	6	3567	3572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209462
40	NC_015694	ATC	2	6	3711	3716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209462
41	NC_015694	AAT	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015694	AAT	2	6	3832	3837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015694	CAC	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015694	AGC	2	6	4238	4243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209463
45	NC_015694	AAT	2	6	4276	4281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209463
46	NC_015694	GAT	2	6	4388	4393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209463
47	NC_015694	AGA	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209464
48	NC_015694	TCA	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209464
49	NC_015694	CAT	2	6	4755	4760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209464
50	NC_015694	GAA	2	6	4838	4843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209464
51	NC_015694	AGC	2	6	5056	5061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209464
52	NC_015694	GGA	2	6	5243	5248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209464
53	NC_015694	GAT	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015694	GCA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015694	CAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015694	ATA	2	6	5839	5844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015694	TAT	2	6	5891	5896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209465
58	NC_015694	TCA	2	6	5975	5980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209465
59	NC_015694	GAT	2	6	5984	5989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209465
60	NC_015694	ATT	2	6	6039	6044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209465
61	NC_015694	ATT	2	6	6074	6079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209465
62	NC_015694	GGA	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209466
63	NC_015694	GAG	2	6	6434	6439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209466
64	NC_015694	AAT	2	6	6464	6469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015694	TCA	2	6	6536	6541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015694	TAA	2	6	6625	6630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015694	TAT	3	9	6648	6656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015694	AAC	2	6	6706	6711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209467
69	NC_015694	TGA	2	6	6738	6743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209467
70	NC_015694	ATG	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209467
71	NC_015694	CTC	2	6	6804	6809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209467
72	NC_015694	CTT	2	6	6893	6898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209467
73	NC_015694	GAA	3	9	7264	7272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209468
74	NC_015694	GAT	2	6	7339	7344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209468
75	NC_015694	TAT	2	6	7350	7355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209468
76	NC_015694	CAA	2	6	7481	7486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209468
77	NC_015694	GAT	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209468
78	NC_015694	ATA	2	6	7762	7767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209468
79	NC_015694	AGA	2	6	7779	7784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209468
80	NC_015694	TAA	2	6	7785	7790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209468
81	NC_015694	TAT	2	6	7794	7799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209468
82	NC_015694	TTG	2	6	7821	7826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015694	TTA	2	6	7975	7980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015694	CCT	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_015694	ATT	2	6	8119	8124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015694	TTA	2	6	8143	8148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015694	CCA	2	6	8158	8163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015694	ATA	2	6	8181	8186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015694	GCA	2	6	8247	8252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209469
90	NC_015694	ACT	2	6	8268	8273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209469
91	NC_015694	TGA	2	6	8276	8281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209469
92	NC_015694	AAG	2	6	8327	8332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209469
93	NC_015694	AGA	2	6	8333	8338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209469
94	NC_015694	TTA	2	6	8544	8549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209469
95	NC_015694	ATT	2	6	8564	8569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209469
96	NC_015694	CCT	2	6	8822	8827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015694	GTT	2	6	8929	8934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015694	ATG	2	6	8972	8977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015694	AGC	2	6	8993	8998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015694	CAA	2	6	9028	9033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209470
101	NC_015694	GCA	2	6	9180	9185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209470
102	NC_015694	TTC	2	6	9198	9203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209470
103	NC_015694	TTA	2	6	9227	9232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209470
104	NC_015694	GTC	2	6	9251	9256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015694	CAA	2	6	9324	9329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015694	GTT	2	6	9387	9392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209471
107	NC_015694	TTA	2	6	9398	9403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209471
108	NC_015694	ACA	2	6	9464	9469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209471
109	NC_015694	CTT	2	6	9507	9512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209471
110	NC_015694	CTA	2	6	9585	9590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209472
111	NC_015694	GTT	2	6	9731	9736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209472
112	NC_015694	GGC	2	6	9818	9823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209472
113	NC_015694	ACC	2	6	9906	9911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209472
114	NC_015694	CAG	2	6	9979	9984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209472
115	NC_015694	CTT	2	6	10071	10076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209472
116	NC_015694	TTA	2	6	10145	10150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015694	GTT	2	6	10301	10306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015694	TTC	2	6	10480	10485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209473
119	NC_015694	ACG	2	6	10512	10517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209473
120	NC_015694	GCT	2	6	10544	10549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209473
121	NC_015694	CAC	2	6	10711	10716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209473
122	NC_015694	CCT	2	6	10869	10874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209473
123	NC_015694	CGA	2	6	10945	10950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209473
124	NC_015694	CAA	2	6	10977	10982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209473
125	NC_015694	AAC	2	6	11002	11007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209473
126	NC_015694	TAA	2	6	11092	11097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209473
127	NC_015694	ATC	2	6	11449	11454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209473
128	NC_015694	TAT	2	6	11457	11462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209473
129	NC_015694	TAA	2	6	11584	11589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209473
130	NC_015694	GAT	3	9	11780	11788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209473
131	NC_015694	ATT	2	6	11816	11821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209473
132	NC_015694	GGC	2	6	11933	11938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209473
133	NC_015694	TAC	2	6	12118	12123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209473
134	NC_015694	CTT	2	6	12153	12158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209473
135	NC_015694	GTT	2	6	12294	12299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209473
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138	NC_015694	CCG	2	6	12832	12837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209474
139	NC_015694	ATT	2	6	12842	12847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209474
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142	NC_015694	GTT	2	6	13133	13138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209474
143	NC_015694	TTG	2	6	13287	13292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209474
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151	NC_015694	ATG	2	6	14061	14066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209474
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159	NC_015694	TGA	2	6	14522	14527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015694	TTA	2	6	14550	14555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_015694	GCC	2	6	22894	22899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209485
259	NC_015694	CAC	2	6	23010	23015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209485
260	NC_015694	GAA	2	6	23035	23040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209485
261	NC_015694	AAT	2	6	23041	23046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209485
262	NC_015694	TGC	2	6	23058	23063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209486
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266	NC_015694	TCA	2	6	23485	23490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209486
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281	NC_015694	TCA	2	6	24930	24935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_015694	AAC	2	6	25655	25660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_015694	ATT	3	9	25740	25748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209491
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318	NC_015694	GAA	2	6	28142	28147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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372	NC_015694	TAG	2	6	33187	33192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
373	NC_015694	ATA	2	6	33202	33207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_015694	TTA	2	6	33725	33730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209502
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383	NC_015694	GGT	2	6	33964	33969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209502
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386	NC_015694	ATG	2	6	34142	34147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209502
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389	NC_015694	GAA	2	6	34237	34242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209502
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