MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL03

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015694	A	8	8	308	315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015694	A	6	6	358	363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015694	A	8	8	771	778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015694	A	6	6	939	944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015694	A	6	6	1220	1225	100 %	0 %	0 %	0 %	338209458
6	NC_015694	A	6	6	1821	1826	100 %	0 %	0 %	0 %	338209459
7	NC_015694	A	6	6	1987	1992	100 %	0 %	0 %	0 %	338209459
8	NC_015694	T	6	6	2134	2139	0 %	100 %	0 %	0 %	338209460
9	NC_015694	A	7	7	2249	2255	100 %	0 %	0 %	0 %	338209460
10	NC_015694	T	6	6	3009	3014	0 %	100 %	0 %	0 %	338209461
11	NC_015694	T	7	7	3036	3042	0 %	100 %	0 %	0 %	338209461
12	NC_015694	T	6	6	3248	3253	0 %	100 %	0 %	0 %	338209461
13	NC_015694	T	6	6	3362	3367	0 %	100 %	0 %	0 %	338209462
14	NC_015694	G	6	6	3652	3657	0 %	0 %	100 %	0 %	338209462
15	NC_015694	C	6	6	3981	3986	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_015694	A	6	6	4093	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	338209463
17	NC_015694	A	6	6	4374	4379	100 %	0 %	0 %	0 %	338209463
18	NC_015694	A	6	6	5085	5090	100 %	0 %	0 %	0 %	338209464
19	NC_015694	A	6	6	5272	5277	100 %	0 %	0 %	0 %	338209464
20	NC_015694	T	7	7	5627	5633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015694	A	6	6	5704	5709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015694	T	6	6	5795	5800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015694	T	6	6	5812	5817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015694	T	6	6	6115	6120	0 %	100 %	0 %	0 %	338209465
25	NC_015694	C	6	6	6167	6172	0 %	0 %	0 %	100 %	338209466
26	NC_015694	A	8	8	7414	7421	100 %	0 %	0 %	0 %	338209468
27	NC_015694	A	7	7	7653	7659	100 %	0 %	0 %	0 %	338209468
28	NC_015694	A	6	6	8438	8443	100 %	0 %	0 %	0 %	338209469
29	NC_015694	A	8	8	8498	8505	100 %	0 %	0 %	0 %	338209469
30	NC_015694	T	6	6	8516	8521	0 %	100 %	0 %	0 %	338209469
31	NC_015694	A	6	6	8524	8529	100 %	0 %	0 %	0 %	338209469
32	NC_015694	T	7	7	8629	8635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015694	A	6	6	8703	8708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015694	T	6	6	8714	8719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015694	A	6	6	9328	9333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015694	A	7	7	9364	9370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015694	T	6	6	9577	9582	0 %	100 %	0 %	0 %	338209472
38	NC_015694	T	6	6	9592	9597	0 %	100 %	0 %	0 %	338209472
39	NC_015694	A	6	6	9967	9972	100 %	0 %	0 %	0 %	338209472
40	NC_015694	A	6	6	10411	10416	100 %	0 %	0 %	0 %	338209473
41	NC_015694	T	6	6	11800	11805	0 %	100 %	0 %	0 %	338209473
42	NC_015694	T	7	7	12587	12593	0 %	100 %	0 %	0 %	338209474
43	NC_015694	T	6	6	12769	12774	0 %	100 %	0 %	0 %	338209474
44	NC_015694	A	7	7	13028	13034	100 %	0 %	0 %	0 %	338209474
45	NC_015694	T	6	6	14560	14565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015694	T	8	8	14578	14585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015694	A	6	6	14597	14602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015694	A	6	6	14924	14929	100 %	0 %	0 %	0 %	338209475
49	NC_015694	T	6	6	15112	15117	0 %	100 %	0 %	0 %	338209476
50	NC_015694	T	6	6	15205	15210	0 %	100 %	0 %	0 %	338209476
51	NC_015694	A	7	7	15967	15973	100 %	0 %	0 %	0 %	338209478
52	NC_015694	A	6	6	16075	16080	100 %	0 %	0 %	0 %	338209479
53	NC_015694	A	6	6	16240	16245	100 %	0 %	0 %	0 %	338209479
54	NC_015694	T	7	7	16279	16285	0 %	100 %	0 %	0 %	338209479
55	NC_015694	T	6	6	16375	16380	0 %	100 %	0 %	0 %	338209479
56	NC_015694	T	6	6	16393	16398	0 %	100 %	0 %	0 %	338209479
57	NC_015694	C	6	6	16760	16765	0 %	0 %	0 %	100 %	338209479
58	NC_015694	T	6	6	17154	17159	0 %	100 %	0 %	0 %	338209479
59	NC_015694	G	6	6	17824	17829	0 %	0 %	100 %	0 %	338209479
60	NC_015694	T	6	6	18110	18115	0 %	100 %	0 %	0 %	338209479
61	NC_015694	T	6	6	18336	18341	0 %	100 %	0 %	0 %	338209479
62	NC_015694	A	6	6	18506	18511	100 %	0 %	0 %	0 %	338209479
63	NC_015694	T	8	8	18572	18579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015694	A	7	7	19704	19710	100 %	0 %	0 %	0 %	338209480
65	NC_015694	T	6	6	19882	19887	0 %	100 %	0 %	0 %	338209481
66	NC_015694	A	6	6	20044	20049	100 %	0 %	0 %	0 %	338209481
67	NC_015694	A	6	6	20718	20723	100 %	0 %	0 %	0 %	338209481
68	NC_015694	A	6	6	20849	20854	100 %	0 %	0 %	0 %	338209482
69	NC_015694	T	6	6	20874	20879	0 %	100 %	0 %	0 %	338209482
70	NC_015694	T	6	6	21165	21170	0 %	100 %	0 %	0 %	338209483
71	NC_015694	A	8	8	21209	21216	100 %	0 %	0 %	0 %	338209483
72	NC_015694	T	6	6	21545	21550	0 %	100 %	0 %	0 %	338209484
73	NC_015694	T	6	6	21662	21667	0 %	100 %	0 %	0 %	338209484
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75	NC_015694	A	6	6	21885	21890	100 %	0 %	0 %	0 %	338209485
76	NC_015694	A	6	6	22189	22194	100 %	0 %	0 %	0 %	338209485
77	NC_015694	A	7	7	22283	22289	100 %	0 %	0 %	0 %	338209485
78	NC_015694	A	9	9	22331	22339	100 %	0 %	0 %	0 %	338209485
79	NC_015694	A	7	7	22409	22415	100 %	0 %	0 %	0 %	338209485
80	NC_015694	A	7	7	22778	22784	100 %	0 %	0 %	0 %	338209485
81	NC_015694	T	7	7	22836	22842	0 %	100 %	0 %	0 %	338209485
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84	NC_015694	A	6	6	24701	24706	100 %	0 %	0 %	0 %	338209488
85	NC_015694	A	6	6	24924	24929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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87	NC_015694	A	7	7	25515	25521	100 %	0 %	0 %	0 %	338209490
88	NC_015694	A	6	6	25527	25532	100 %	0 %	0 %	0 %	338209490
89	NC_015694	A	6	6	25768	25773	100 %	0 %	0 %	0 %	338209491
90	NC_015694	A	6	6	26620	26625	100 %	0 %	0 %	0 %	338209492
91	NC_015694	T	6	6	26842	26847	0 %	100 %	0 %	0 %	338209493
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94	NC_015694	T	6	6	27992	27997	0 %	100 %	0 %	0 %	338209495
95	NC_015694	A	6	6	28050	28055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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97	NC_015694	G	6	6	28485	28490	0 %	0 %	100 %	0 %	338209496
98	NC_015694	A	7	7	28692	28698	100 %	0 %	0 %	0 %	338209496
99	NC_015694	T	6	6	28749	28754	0 %	100 %	0 %	0 %	338209496
100	NC_015694	T	6	6	30067	30072	0 %	100 %	0 %	0 %	338209497
101	NC_015694	A	7	7	30109	30115	100 %	0 %	0 %	0 %	338209497
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105	NC_015694	A	7	7	33328	33334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015694	T	6	6	33622	33627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015694	A	6	6	35114	35119	100 %	0 %	0 %	0 %	338209503
108	NC_015694	A	6	6	35330	35335	100 %	0 %	0 %	0 %	338209503
109	NC_015694	A	7	7	35549	35555	100 %	0 %	0 %	0 %	338209504
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111	NC_015694	T	6	6	36925	36930	0 %	100 %	0 %	0 %	338209505
112	NC_015694	A	7	7	37551	37557	100 %	0 %	0 %	0 %	338209506
113	NC_015694	T	6	6	37982	37987	0 %	100 %	0 %	0 %	338209507
114	NC_015694	A	6	6	38335	38340	100 %	0 %	0 %	0 %	338209507
115	NC_015694	A	6	6	38564	38569	100 %	0 %	0 %	0 %	338209507
116	NC_015694	T	6	6	38735	38740	0 %	100 %	0 %	0 %	338209507
117	NC_015694	A	6	6	39028	39033	100 %	0 %	0 %	0 %	338209508
118	NC_015694	T	7	7	39318	39324	0 %	100 %	0 %	0 %	338209508
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120	NC_015694	A	7	7	39960	39966	100 %	0 %	0 %	0 %	338209508
121	NC_015694	A	6	6	40868	40873	100 %	0 %	0 %	0 %	338209508
122	NC_015694	T	7	7	41928	41934	0 %	100 %	0 %	0 %	338209508
123	NC_015694	T	6	6	42461	42466	0 %	100 %	0 %	0 %	338209508
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129	NC_015694	A	6	6	44283	44288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.