MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015693	GTTGAT	2	12	1470	1481	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338209373
2	NC_015693	TCAAAA	2	12	3475	3486	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015693	ACGTTT	2	12	7684	7695	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338209375
4	NC_015693	AGGTAA	2	12	7859	7870	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338209375
5	NC_015693	TACTTG	2	12	9889	9900	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338209377
6	NC_015693	TCAATC	2	12	11838	11849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209380
7	NC_015693	ATTGGA	2	12	14251	14262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015693	GCATCG	2	12	23560	23571	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338209391
9	NC_015693	CCAATT	2	12	24783	24794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015693	GTCGAG	2	12	25541	25552	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338209393
11	NC_015693	CTGTAC	2	12	27738	27749	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338209395
12	NC_015693	CGTTAC	2	12	28710	28721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338209395
13	NC_015693	GTAGCG	2	12	30871	30882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338209396
14	NC_015693	ATCAGT	2	12	33923	33934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015693	GCTTAC	2	12	37987	37998	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338209403
16	NC_015693	AGAAAA	2	12	41202	41213	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338209406
17	NC_015693	TGGCGG	2	12	42039	42050	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	338209407
18	NC_015693	CCAACA	2	12	45027	45038	50 %	0 %	0 %	50 %	338209410
19	NC_015693	TCTTTG	2	12	49105	49116	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338209412
20	NC_015693	GCCCGG	2	12	49876	49887	0 %	0 %	50 %	50 %	338209413
21	NC_015693	GGGTTT	2	12	51165	51176	0 %	50 %	50 %	0 %	338209414
22	NC_015693	GCGCAG	2	12	54949	54960	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338209417
23	NC_015693	AACGGT	2	12	55641	55652	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338209417
24	NC_015693	ACAAAT	2	12	57774	57785	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015693	TTACAA	2	12	59863	59874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338209421
26	NC_015693	ATTTGG	2	12	67148	67159	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338209428
27	NC_015693	GATACC	2	12	67165	67176	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338209428
28	NC_015693	GACAAC	2	12	68648	68659	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338209429
29	NC_015693	ATTGGT	2	12	72083	72094	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338209433
30	NC_015693	CTGTTT	2	12	72217	72228	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338209433
31	NC_015693	GCCATT	2	12	72555	72566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338209434
32	NC_015693	CCACCG	2	12	72748	72759	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	338209434
33	NC_015693	CAGACC	2	12	76060	76071	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338209438
34	NC_015693	ATACCG	2	12	76145	76156	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338209438
35	NC_015693	GAAGGC	2	12	80564	80575	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	338209440
36	NC_015693	TCTCAT	2	12	83365	83376	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338209442
37	NC_015693	TTGGGC	2	12	85916	85927	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338209442
38	NC_015693	ATAAAT	2	12	88121	88132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209444
39	NC_015693	ATAGAA	2	12	88842	88853	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338209445
40	NC_015693	ACAGCA	2	12	89480	89491	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338209445
41	NC_015693	CTTTGT	2	12	90675	90686	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338209446
42	NC_015693	AGTTTC	2	12	93335	93346	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338209448
43	NC_015693	TCGGTA	2	12	97091	97102	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338209451
44	NC_015693	AGCCCA	2	12	99215	99226	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338209453
45	NC_015693	AGGGGC	2	12	100130	100141	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	338209453
46	NC_015693	GCCACG	2	12	100836	100847	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338209453
47	NC_015693	CAAAAG	2	12	101150	101161	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338209453
48	NC_015693	TTCAAT	2	12	101548	101559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338209454
49	NC_015693	GGTATC	2	12	103493	103504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338209455

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.